52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1935 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_1935  hypothetical protein  100 
 
 		 95 aa  197  6e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.235684  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1165  hypothetical protein  65.48 
 
 		 92 aa  110  6e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1528  hypothetical protein  69.33 
 
 		 94 aa  110  7.000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1005  hypothetical protein  59.46 
 
 		 92 aa  102  2e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1089  hypothetical protein  59.46 
 
 		 92 aa  102  3e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4300  hypothetical protein  61.11 
 
 		 87 aa  96.3  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.486279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3777  hypothetical protein  56.41 
 
 		 86 aa  92.4  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2823  hypothetical protein  48.15 
 
 		 98 aa  85.9  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.010351  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0718  hypothetical protein  43.48 
 
 		 173 aa  68.9  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.388417  normal  0.280155 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2774  hypothetical protein  44.59 
 
 		 87 aa  63.9  0.0000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00214671 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2780  hypothetical protein  60 
 
 		 104 aa  58.9  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.198014  normal  0.363116 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2473  hypothetical protein  41.56 
 
 		 82 aa  55.1  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.121534  normal  0.0764463 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1282  FixH family protein  34.52 
 
 		 169 aa  54.3  0.0000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2010  hypothetical protein  32.1 
 
 		 159 aa  53.9  0.0000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.7151  hitchhiker  0.0000000218476 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1965  hypothetical protein  32.1 
 
 		 159 aa  53.9  0.0000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0441287  hitchhiker  0.00747997 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2111  hypothetical protein  32.1 
 
 		 159 aa  53.5  0.0000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0125675  normal  0.439118 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1281  lipoprotein transmembrane  37.29 
 
 		 76 aa  53.1  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0429842  normal  0.428676 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1109  putative lipoprotein transmembrane  38.46 
 
 		 75 aa  52.4  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.862439  normal  0.605647 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2360  hypothetical protein  30.86 
 
 		 159 aa  52.4  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1847  hypothetical protein  36.92 
 
 		 158 aa  52  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.227491  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0638  hypothetical protein  29.07 
 
 		 175 aa  50.4  0.000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0105694  normal  0.771152 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3420  hypothetical protein  32.86 
 
 		 178 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.300528  normal  0.0548017 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2218  hypothetical protein  32.84 
 
 		 159 aa  50.4  0.000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0257547  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1202  lipoprotein transmembrane  36.54 
 
 		 75 aa  50.4  0.000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4491  hypothetical protein  34.48 
 
 		 159 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2205  hypothetical protein  34.48 
 
 		 159 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000648455  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1997  hypothetical protein  30.38 
 
 		 178 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.591704  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2218  FixH family protein  34.48 
 
 		 159 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000107723  normal  0.262881 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2215  hypothetical protein  29.58 
 
 		 159 aa  49.3  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2421  hypothetical protein  35.09 
 
 		 159 aa  48.9  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000019522  hitchhiker  0.0000597978 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2036  hypothetical protein  32.47 
 
 		 95 aa  48.1  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2166  hypothetical protein  36.21 
 
 		 159 aa  48.1  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000514786  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2216  hypothetical protein  36.21 
 
 		 159 aa  48.1  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0316699  normal  0.253608 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44430  hypothetical protein  30.11 
 
 		 179 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0337511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3782  hypothetical protein  30.11 
 
 		 179 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.222956  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1567  hypothetical protein  30.77 
 
 		 161 aa  47.4  0.00007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2014  hypothetical protein  38.46 
 
 		 159 aa  47  0.00008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0149983  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1991  hypothetical protein  34.12 
 
 		 164 aa  47  0.00009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1955  hypothetical protein  34.48 
 
 		 159 aa  46.6  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1795  hypothetical protein  31.03 
 
 		 159 aa  45.1  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.390885  normal  0.104999 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0458  hypothetical protein  32.79 
 
 		 72 aa  44.3  0.0005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.912732  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0637  FixH family protein  32.26 
 
 		 166 aa  44.3  0.0006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1989  hypothetical protein  33.33 
 
 		 159 aa  44.3  0.0006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.667905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1817  hypothetical protein  27.85 
 
 		 179 aa  42  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2417  hypothetical protein  32.79 
 
 		 190 aa  41.2  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1876  hypothetical protein  26.92 
 
 		 185 aa  40.8  0.006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3578  hypothetical protein  25.81 
 
 		 175 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2039  hypothetical protein  31.58 
 
 		 78 aa  40.8  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.412419 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1358  hypothetical protein  27.27 
 
 		 67 aa  40.8  0.007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.0957605 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1789  hypothetical protein  25.37 
 
 		 171 aa  40.4  0.008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.200799  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3825  hypothetical protein  27.14 
 
 		 175 aa  40.4  0.009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1608  hypothetical protein  27.14 
 
 		 176 aa  40  0.01  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.148481  normal  0.0232786 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>