51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2215 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_2215  hypothetical protein  100 
 
 		 159 aa  328  2e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2421  hypothetical protein  80.5 
 
 		 159 aa  275  2e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000019522  hitchhiker  0.0000597978 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1989  hypothetical protein  71.7 
 
 		 159 aa  256  7e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.667905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2014  hypothetical protein  64.78 
 
 		 159 aa  226  1e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0149983  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1965  hypothetical protein  65.41 
 
 		 159 aa  226  1e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0441287  hitchhiker  0.00747997 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2010  hypothetical protein  65.41 
 
 		 159 aa  226  1e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.7151  hitchhiker  0.0000000218476 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2360  hypothetical protein  64.78 
 
 		 159 aa  225  2e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2111  hypothetical protein  64.78 
 
 		 159 aa  224  3e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0125675  normal  0.439118 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2218  hypothetical protein  61.64 
 
 		 159 aa  222  1e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0257547  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1955  hypothetical protein  64.15 
 
 		 159 aa  223  1e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1795  hypothetical protein  60.38 
 
 		 159 aa  217  5e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.390885  normal  0.104999 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2218  FixH family protein  62.26 
 
 		 159 aa  215  2e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000107723  normal  0.262881 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2205  hypothetical protein  61.64 
 
 		 159 aa  213  8e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000648455  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4491  hypothetical protein  61.64 
 
 		 159 aa  213  8e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2166  hypothetical protein  61.64 
 
 		 159 aa  211  3.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000514786  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2216  hypothetical protein  61.64 
 
 		 159 aa  211  3.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0316699  normal  0.253608 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1847  hypothetical protein  59.21 
 
 		 158 aa  204  4e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.227491  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1991  hypothetical protein  40.82 
 
 		 164 aa  131  3e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2069  hypothetical protein  42.21 
 
 		 169 aa  128  3e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.860685  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1567  hypothetical protein  45.33 
 
 		 161 aa  127  5.0000000000000004e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0935  hypothetical protein  38.56 
 
 		 159 aa  126  1.0000000000000001e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.742864 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003471  hypothetical protein  42.38 
 
 		 158 aa  125  3e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0601301  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02299  hypothetical protein  43.15 
 
 		 158 aa  124  7e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1049  hypothetical protein  40.38 
 
 		 158 aa  121  4e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.146816  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0637  FixH family protein  38.89 
 
 		 166 aa  101  3e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0718  hypothetical protein  34.25 
 
 		 173 aa  93.2  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.388417  normal  0.280155 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2609  hypothetical protein  35.1 
 
 		 172 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00411707  normal  0.558054 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0638  hypothetical protein  31.94 
 
 		 175 aa  87  8e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0105694  normal  0.771152 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1282  FixH family protein  33.8 
 
 		 169 aa  87  9e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1789  hypothetical protein  30.13 
 
 		 171 aa  84.7  5e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.200799  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19960  cytochrome c oxidase accessory protein CcoH  33.78 
 
 		 167 aa  83.2  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.177196  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02059  hypothetical protein  37.5 
 
 		 136 aa  82.4  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0309564  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1997  hypothetical protein  32.41 
 
 		 178 aa  74.7  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.591704  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44430  hypothetical protein  32.43 
 
 		 179 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0337511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1817  hypothetical protein  31.33 
 
 		 179 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3782  hypothetical protein  32.43 
 
 		 179 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.222956  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3825  hypothetical protein  30.28 
 
 		 175 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3578  hypothetical protein  29.58 
 
 		 175 aa  68.2  0.00000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1608  hypothetical protein  30.28 
 
 		 176 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.148481  normal  0.0232786 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4260  hypothetical protein  30.28 
 
 		 176 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3420  hypothetical protein  28.57 
 
 		 178 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.300528  normal  0.0548017 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1876  hypothetical protein  28.03 
 
 		 185 aa  63.9  0.0000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2417  hypothetical protein  31.25 
 
 		 190 aa  55.8  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1749  hypothetical protein  35.37 
 
 		 195 aa  51.2  0.000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00173592 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1935  hypothetical protein  29.58 
 
 		 95 aa  49.3  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.235684  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1089  hypothetical protein  39.13 
 
 		 92 aa  43.5  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1528  hypothetical protein  27.85 
 
 		 94 aa  43.5  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1005  hypothetical protein  39.13 
 
 		 92 aa  43.5  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2823  hypothetical protein  42.31 
 
 		 98 aa  43.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.010351  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4300  hypothetical protein  32.73 
 
 		 87 aa  42.7  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.486279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2036  hypothetical protein  31.43 
 
 		 95 aa  41.2  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>