13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2039 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_2039  hypothetical protein  100 
 
 		 78 aa  160  4.0000000000000004e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.412419 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2036  hypothetical protein  59.74 
 
 		 95 aa  92.8  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1202  lipoprotein transmembrane  63.93 
 
 		 75 aa  87.8  4e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1109  putative lipoprotein transmembrane  63.93 
 
 		 75 aa  87  8e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.862439  normal  0.605647 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1281  lipoprotein transmembrane  64.91 
 
 		 76 aa  81.6  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0429842  normal  0.428676 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1358  hypothetical protein  50.77 
 
 		 67 aa  64.3  0.0000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.0957605 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0458  hypothetical protein  52.54 
 
 		 72 aa  63.2  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.912732  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0638  hypothetical protein  48.08 
 
 		 175 aa  55.1  0.0000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0105694  normal  0.771152 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0718  hypothetical protein  40.38 
 
 		 173 aa  49.7  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.388417  normal  0.280155 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0935  hypothetical protein  33.33 
 
 		 159 aa  45.8  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.742864 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1991  hypothetical protein  47.37 
 
 		 164 aa  42.7  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0637  FixH family protein  35.09 
 
 		 166 aa  42  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1935  hypothetical protein  31.58 
 
 		 95 aa  40.8  0.007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.235684  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>