22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_1358 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_1358  hypothetical protein  100 
 
 		 67 aa  136  8.999999999999999e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.0957605 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0458  hypothetical protein  77.61 
 
 		 72 aa  111  3e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.912732  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1202  lipoprotein transmembrane  47.46 
 
 		 75 aa  65.5  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2039  hypothetical protein  50.77 
 
 		 78 aa  64.3  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.412419 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1109  putative lipoprotein transmembrane  49.06 
 
 		 75 aa  63.9  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.862439  normal  0.605647 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2036  hypothetical protein  45 
 
 		 95 aa  62  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1281  lipoprotein transmembrane  47.17 
 
 		 76 aa  60.8  0.000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0429842  normal  0.428676 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0718  hypothetical protein  42.37 
 
 		 173 aa  56.2  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.388417  normal  0.280155 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0638  hypothetical protein  36.51 
 
 		 175 aa  49.7  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0105694  normal  0.771152 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1847  hypothetical protein  40.82 
 
 		 158 aa  47.8  0.00005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.227491  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2111  hypothetical protein  37.04 
 
 		 159 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0125675  normal  0.439118 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1567  hypothetical protein  41.86 
 
 		 161 aa  42.7  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0935  hypothetical protein  35.56 
 
 		 159 aa  42.7  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.742864 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1965  hypothetical protein  37.04 
 
 		 159 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0441287  hitchhiker  0.00747997 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2010  hypothetical protein  37.04 
 
 		 159 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.7151  hitchhiker  0.0000000218476 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2014  hypothetical protein  39.13 
 
 		 159 aa  41.2  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0149983  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1955  hypothetical protein  38.89 
 
 		 159 aa  41.2  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2360  hypothetical protein  38.89 
 
 		 159 aa  41.2  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4491  hypothetical protein  38.89 
 
 		 159 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2205  hypothetical protein  38.89 
 
 		 159 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000648455  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1935  hypothetical protein  27.27 
 
 		 95 aa  40.8  0.007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.235684  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2218  FixH family protein  38.89 
 
 		 159 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000107723  normal  0.262881 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>