59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_2218 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_2218  FixH family protein  100 
 
 		 159 aa  331  2e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000107723  normal  0.262881 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4491  hypothetical protein  99.37 
 
 		 159 aa  329  1e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2205  hypothetical protein  99.37 
 
 		 159 aa  329  1e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000648455  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2216  hypothetical protein  96.23 
 
 		 159 aa  321  2e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0316699  normal  0.253608 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2166  hypothetical protein  96.23 
 
 		 159 aa  321  2e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000514786  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1955  hypothetical protein  92.45 
 
 		 159 aa  313  7e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1965  hypothetical protein  82.39 
 
 		 159 aa  282  1.0000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0441287  hitchhiker  0.00747997 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2010  hypothetical protein  82.39 
 
 		 159 aa  282  1.0000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.7151  hitchhiker  0.0000000218476 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2111  hypothetical protein  82.39 
 
 		 159 aa  280  6.000000000000001e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0125675  normal  0.439118 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2360  hypothetical protein  81.13 
 
 		 159 aa  279  1e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2014  hypothetical protein  66.67 
 
 		 159 aa  231  3e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0149983  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1795  hypothetical protein  64.78 
 
 		 159 aa  223  8e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.390885  normal  0.104999 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2215  hypothetical protein  62.26 
 
 		 159 aa  215  2e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2421  hypothetical protein  59.75 
 
 		 159 aa  211  3.9999999999999995e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000019522  hitchhiker  0.0000597978 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1989  hypothetical protein  60.38 
 
 		 159 aa  210  7.999999999999999e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.667905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1847  hypothetical protein  61.18 
 
 		 158 aa  208  2e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.227491  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2218  hypothetical protein  57.86 
 
 		 159 aa  201  3e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0257547  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1567  hypothetical protein  43.71 
 
 		 161 aa  134  7.000000000000001e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003471  hypothetical protein  46.26 
 
 		 158 aa  133  9e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0601301  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0935  hypothetical protein  40.27 
 
 		 159 aa  129  1.0000000000000001e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.742864 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02299  hypothetical protein  44.9 
 
 		 158 aa  127  4.0000000000000003e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1049  hypothetical protein  44.14 
 
 		 158 aa  128  4.0000000000000003e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.146816  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2069  hypothetical protein  37.5 
 
 		 169 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.860685  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1991  hypothetical protein  38.1 
 
 		 164 aa  125  2.0000000000000002e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0637  FixH family protein  37.84 
 
 		 166 aa  110  5e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0718  hypothetical protein  32.87 
 
 		 173 aa  95.5  3e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.388417  normal  0.280155 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0638  hypothetical protein  35.21 
 
 		 175 aa  92.8  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0105694  normal  0.771152 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1282  FixH family protein  32.48 
 
 		 169 aa  91.7  4e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1789  hypothetical protein  30.97 
 
 		 171 aa  90.1  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.200799  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02059  hypothetical protein  39.32 
 
 		 136 aa  87.8  6e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0309564  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19960  cytochrome c oxidase accessory protein CcoH  31.1 
 
 		 167 aa  83.6  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.177196  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2609  hypothetical protein  31.58 
 
 		 172 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00411707  normal  0.558054 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3825  hypothetical protein  29.94 
 
 		 175 aa  74.7  0.0000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4260  hypothetical protein  29.94 
 
 		 176 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1608  hypothetical protein  29.94 
 
 		 176 aa  72.4  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.148481  normal  0.0232786 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1997  hypothetical protein  30.14 
 
 		 178 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.591704  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3578  hypothetical protein  29.3 
 
 		 175 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1876  hypothetical protein  31.03 
 
 		 185 aa  67  0.00000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1817  hypothetical protein  28.93 
 
 		 179 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3782  hypothetical protein  28 
 
 		 179 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.222956  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44430  hypothetical protein  26.97 
 
 		 179 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0337511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3420  hypothetical protein  28.45 
 
 		 178 aa  62  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.300528  normal  0.0548017 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2417  hypothetical protein  28.07 
 
 		 190 aa  53.5  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1935  hypothetical protein  34.48 
 
 		 95 aa  49.3  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.235684  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4300  hypothetical protein  38.18 
 
 		 87 aa  47.8  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.486279  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2823  hypothetical protein  40.74 
 
 		 98 aa  47.4  0.00009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.010351  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1089  hypothetical protein  41.3 
 
 		 92 aa  44.7  0.0005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1005  hypothetical protein  41.3 
 
 		 92 aa  44.3  0.0006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2036  hypothetical protein  38 
 
 		 95 aa  44.3  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1528  hypothetical protein  29.11 
 
 		 94 aa  43.1  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2351  hypothetical protein  20 
 
 		 168 aa  43.5  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000235101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1527  FixH family protein  22.22 
 
 		 171 aa  42.4  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1154  FixH family protein  25.74 
 
 		 156 aa  42.4  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0322721 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1961  hypothetical protein  23.13 
 
 		 186 aa  41.6  0.005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1165  hypothetical protein  38.46 
 
 		 92 aa  41.6  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0464  FixH family protein  25.68 
 
 		 172 aa  41.2  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0404711  normal  0.285951 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2079  hypothetical protein  27.78 
 
 		 145 aa  40.8  0.008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.488973  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1358  hypothetical protein  38.89 
 
 		 67 aa  40.8  0.009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.0957605 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0773  hypothetical protein  30.26 
 
 		 193 aa  40.4  0.01  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0360313  normal  0.913908 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>