23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_1202 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_1202  lipoprotein transmembrane  100 
 
 		 75 aa  153  8e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1109  putative lipoprotein transmembrane  93.33 
 
 		 75 aa  145  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.862439  normal  0.605647 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1281  lipoprotein transmembrane  73.68 
 
 		 76 aa  116  9.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0429842  normal  0.428676 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2039  hypothetical protein  63.93 
 
 		 78 aa  87.8  5e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.412419 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2036  hypothetical protein  47.3 
 
 		 95 aa  82  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0458  hypothetical protein  48.44 
 
 		 72 aa  69.7  0.00000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.912732  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1358  hypothetical protein  47.46 
 
 		 67 aa  65.5  0.0000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.0957605 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0718  hypothetical protein  41.18 
 
 		 173 aa  55.5  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.388417  normal  0.280155 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1935  hypothetical protein  36.54 
 
 		 95 aa  50.4  0.000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.235684  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0638  hypothetical protein  33.93 
 
 		 175 aa  49.7  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0105694  normal  0.771152 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1165  hypothetical protein  35.38 
 
 		 92 aa  49.7  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1005  hypothetical protein  39.62 
 
 		 92 aa  48.1  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1089  hypothetical protein  39.62 
 
 		 92 aa  48.1  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1528  hypothetical protein  35.48 
 
 		 94 aa  47.8  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4300  hypothetical protein  37.25 
 
 		 87 aa  46.2  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.486279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1847  hypothetical protein  29.17 
 
 		 158 aa  43.5  0.0009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.227491  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2774  hypothetical protein  52.94 
 
 		 87 aa  43.5  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00214671 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2111  hypothetical protein  25 
 
 		 159 aa  41.2  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0125675  normal  0.439118 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1965  hypothetical protein  25 
 
 		 159 aa  40.8  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0441287  hitchhiker  0.00747997 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2010  hypothetical protein  25 
 
 		 159 aa  40.8  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.7151  hitchhiker  0.0000000218476 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2823  hypothetical protein  30.43 
 
 		 98 aa  40.8  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.010351  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2360  hypothetical protein  27.45 
 
 		 159 aa  40.8  0.007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1282  FixH family protein  29.03 
 
 		 169 aa  40.4  0.009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>