13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2774 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2774  hypothetical protein  100 
 
 		 87 aa  171  2.9999999999999996e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00214671 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3777  hypothetical protein  54.67 
 
 		 86 aa  72.8  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1165  hypothetical protein  48 
 
 		 92 aa  66.2  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2473  hypothetical protein  54.17 
 
 		 82 aa  65.5  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.121534  normal  0.0764463 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1089  hypothetical protein  45.07 
 
 		 92 aa  64.3  0.0000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1005  hypothetical protein  45.07 
 
 		 92 aa  64.3  0.0000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1935  hypothetical protein  44.59 
 
 		 95 aa  63.9  0.0000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.235684  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4300  hypothetical protein  41.18 
 
 		 87 aa  57  0.00000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.486279  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2823  hypothetical protein  36.9 
 
 		 98 aa  55.5  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.010351  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1528  hypothetical protein  39.51 
 
 		 94 aa  50.8  0.000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1109  putative lipoprotein transmembrane  50 
 
 		 75 aa  45.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.862439  normal  0.605647 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1281  lipoprotein transmembrane  39.58 
 
 		 76 aa  43.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0429842  normal  0.428676 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1202  lipoprotein transmembrane  52.94 
 
 		 75 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>