12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3777 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_3777  hypothetical protein  100 
 
 		 86 aa  176  1e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1935  hypothetical protein  56.41 
 
 		 95 aa  92.4  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.235684  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1089  hypothetical protein  51.25 
 
 		 92 aa  87  8e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1005  hypothetical protein  51.25 
 
 		 92 aa  87  9e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1165  hypothetical protein  56.34 
 
 		 92 aa  84  6e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1528  hypothetical protein  53.57 
 
 		 94 aa  81.6  0.000000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2774  hypothetical protein  54.67 
 
 		 87 aa  72.8  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00214671 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4300  hypothetical protein  45.59 
 
 		 87 aa  62.4  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.486279  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2823  hypothetical protein  42.68 
 
 		 98 aa  57.4  0.00000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.010351  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2473  hypothetical protein  37.84 
 
 		 82 aa  53.9  0.0000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.121534  normal  0.0764463 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0718  hypothetical protein  50 
 
 		 173 aa  44.3  0.0006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.388417  normal  0.280155 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2780  hypothetical protein  50 
 
 		 104 aa  42.7  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.198014  normal  0.363116 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>