54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4300 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_4300  hypothetical protein  100 
 
 		 87 aa  171  3.9999999999999995e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.486279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1528  hypothetical protein  61.73 
 
 		 94 aa  106  9.000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1005  hypothetical protein  62.82 
 
 		 92 aa  104  5e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2823  hypothetical protein  65.88 
 
 		 98 aa  103  6e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.010351  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1089  hypothetical protein  62.82 
 
 		 92 aa  103  7e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1165  hypothetical protein  69.44 
 
 		 92 aa  102  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1935  hypothetical protein  58.54 
 
 		 95 aa  99.4  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.235684  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3777  hypothetical protein  49.35 
 
 		 86 aa  68.2  0.00000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2473  hypothetical protein  49.32 
 
 		 82 aa  64.3  0.0000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.121534  normal  0.0764463 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0718  hypothetical protein  43.64 
 
 		 173 aa  61.6  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.388417  normal  0.280155 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2774  hypothetical protein  43.66 
 
 		 87 aa  60.8  0.000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00214671 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0638  hypothetical protein  48.21 
 
 		 175 aa  58.5  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0105694  normal  0.771152 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1282  FixH family protein  38.71 
 
 		 169 aa  55.8  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44430  hypothetical protein  41.38 
 
 		 179 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0337511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3782  hypothetical protein  41.38 
 
 		 179 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.222956  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2780  hypothetical protein  54.67 
 
 		 104 aa  52.4  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.198014  normal  0.363116 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1847  hypothetical protein  40.35 
 
 		 158 aa  52  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.227491  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1281  lipoprotein transmembrane  39.06 
 
 		 76 aa  51.2  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0429842  normal  0.428676 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3420  hypothetical protein  43.64 
 
 		 178 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.300528  normal  0.0548017 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2111  hypothetical protein  41.07 
 
 		 159 aa  50.4  0.000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0125675  normal  0.439118 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1965  hypothetical protein  41.07 
 
 		 159 aa  50.1  0.000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0441287  hitchhiker  0.00747997 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2010  hypothetical protein  41.07 
 
 		 159 aa  50.1  0.000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.7151  hitchhiker  0.0000000218476 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2218  hypothetical protein  36.67 
 
 		 159 aa  50.1  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0257547  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2014  hypothetical protein  41.07 
 
 		 159 aa  50.1  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0149983  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2360  hypothetical protein  39.29 
 
 		 159 aa  49.3  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1997  hypothetical protein  37.29 
 
 		 178 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.591704  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2218  FixH family protein  38.18 
 
 		 159 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000107723  normal  0.262881 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1109  putative lipoprotein transmembrane  39.22 
 
 		 75 aa  47.8  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.862439  normal  0.605647 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4491  hypothetical protein  38.18 
 
 		 159 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2205  hypothetical protein  38.18 
 
 		 159 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000648455  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1955  hypothetical protein  40 
 
 		 159 aa  47.8  0.00005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2166  hypothetical protein  40 
 
 		 159 aa  47.4  0.00006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000514786  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2216  hypothetical protein  40 
 
 		 159 aa  47.4  0.00006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0316699  normal  0.253608 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3825  hypothetical protein  39.29 
 
 		 175 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1991  hypothetical protein  38.98 
 
 		 164 aa  47  0.00009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0637  FixH family protein  39.29 
 
 		 166 aa  47  0.00009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2421  hypothetical protein  36.21 
 
 		 159 aa  47  0.00009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000019522  hitchhiker  0.0000597978 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1795  hypothetical protein  35.85 
 
 		 159 aa  46.2  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.390885  normal  0.104999 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1202  lipoprotein transmembrane  37.25 
 
 		 75 aa  46.2  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1567  hypothetical protein  39.66 
 
 		 161 aa  45.8  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3578  hypothetical protein  37.5 
 
 		 175 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4260  hypothetical protein  37.5 
 
 		 176 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1608  hypothetical protein  37.5 
 
 		 176 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.148481  normal  0.0232786 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1789  hypothetical protein  29.51 
 
 		 171 aa  44.3  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.200799  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1817  hypothetical protein  37.5 
 
 		 179 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1989  hypothetical protein  34.48 
 
 		 159 aa  43.9  0.0008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.667905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2215  hypothetical protein  31.03 
 
 		 159 aa  42.7  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0935  hypothetical protein  40.74 
 
 		 159 aa  43.1  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.742864 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2609  hypothetical protein  33.93 
 
 		 172 aa  42.4  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00411707  normal  0.558054 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2417  hypothetical protein  32.84 
 
 		 190 aa  41.6  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2036  hypothetical protein  36.36 
 
 		 95 aa  41.2  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1876  hypothetical protein  29.21 
 
 		 185 aa  41.2  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1749  hypothetical protein  36.84 
 
 		 195 aa  40.8  0.006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00173592 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19960  cytochrome c oxidase accessory protein CcoH  35.19 
 
 		 167 aa  40.8  0.007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.177196  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>