39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_1089 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_1089  hypothetical protein  100 
 
 		 92 aa  191  3e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1005  hypothetical protein  98.91 
 
 		 92 aa  189  1e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1528  hypothetical protein  63.1 
 
 		 94 aa  122  2e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1165  hypothetical protein  56.18 
 
 		 92 aa  114  3e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1935  hypothetical protein  59.46 
 
 		 95 aa  102  3e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.235684  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4300  hypothetical protein  63.24 
 
 		 87 aa  94  6e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.486279  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2823  hypothetical protein  50 
 
 		 98 aa  87.8  4e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.010351  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3777  hypothetical protein  51.25 
 
 		 86 aa  87  8e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2780  hypothetical protein  54.76 
 
 		 104 aa  73.6  0.0000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.198014  normal  0.363116 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2774  hypothetical protein  45.07 
 
 		 87 aa  64.3  0.0000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00214671 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0718  hypothetical protein  45.31 
 
 		 173 aa  63.5  0.0000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.388417  normal  0.280155 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2473  hypothetical protein  39.47 
 
 		 82 aa  56.2  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.121534  normal  0.0764463 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2036  hypothetical protein  34.85 
 
 		 95 aa  50.4  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1281  lipoprotein transmembrane  38.18 
 
 		 76 aa  49.7  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0429842  normal  0.428676 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1109  putative lipoprotein transmembrane  41.51 
 
 		 75 aa  49.7  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.862439  normal  0.605647 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1202  lipoprotein transmembrane  39.62 
 
 		 75 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0638  hypothetical protein  34.55 
 
 		 175 aa  47.4  0.00007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0105694  normal  0.771152 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2111  hypothetical protein  38.18 
 
 		 159 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0125675  normal  0.439118 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2360  hypothetical protein  40 
 
 		 159 aa  46.6  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2010  hypothetical protein  38.18 
 
 		 159 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.7151  hitchhiker  0.0000000218476 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1965  hypothetical protein  38.18 
 
 		 159 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0441287  hitchhiker  0.00747997 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4491  hypothetical protein  41.3 
 
 		 159 aa  44.7  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2205  hypothetical protein  41.3 
 
 		 159 aa  44.7  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000648455  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2218  FixH family protein  41.3 
 
 		 159 aa  44.7  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000107723  normal  0.262881 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1282  FixH family protein  37.74 
 
 		 169 aa  44.3  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1955  hypothetical protein  41.3 
 
 		 159 aa  44.3  0.0006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2014  hypothetical protein  34.38 
 
 		 159 aa  44.3  0.0006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0149983  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1876  hypothetical protein  25 
 
 		 185 aa  43.9  0.0007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3420  hypothetical protein  32.89 
 
 		 178 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.300528  normal  0.0548017 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0637  FixH family protein  36.67 
 
 		 166 aa  43.9  0.0008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2216  hypothetical protein  39.13 
 
 		 159 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0316699  normal  0.253608 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1847  hypothetical protein  31.48 
 
 		 158 aa  42.7  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.227491  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2417  hypothetical protein  35.59 
 
 		 190 aa  43.1  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2215  hypothetical protein  39.13 
 
 		 159 aa  43.5  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2166  hypothetical protein  39.13 
 
 		 159 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000514786  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1795  hypothetical protein  39.13 
 
 		 159 aa  43.1  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.390885  normal  0.104999 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2218  hypothetical protein  30.91 
 
 		 159 aa  42.7  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0257547  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0458  hypothetical protein  32.84 
 
 		 72 aa  42.4  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.912732  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2421  hypothetical protein  34.78 
 
 		 159 aa  40  0.01  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000019522  hitchhiker  0.0000597978 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>