51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2421 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_2421  hypothetical protein  100 
 
 		 159 aa  327  3e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000019522  hitchhiker  0.0000597978 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2215  hypothetical protein  80.5 
 
 		 159 aa  275  2e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1989  hypothetical protein  66.67 
 
 		 159 aa  246  1e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.667905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2014  hypothetical protein  65.41 
 
 		 159 aa  227  4e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0149983  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2218  hypothetical protein  61.01 
 
 		 159 aa  220  4.9999999999999996e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0257547  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1955  hypothetical protein  62.26 
 
 		 159 aa  219  9e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2111  hypothetical protein  62.26 
 
 		 159 aa  218  3e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0125675  normal  0.439118 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1965  hypothetical protein  61.64 
 
 		 159 aa  218  3e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0441287  hitchhiker  0.00747997 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2010  hypothetical protein  61.64 
 
 		 159 aa  218  3e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.7151  hitchhiker  0.0000000218476 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2360  hypothetical protein  61.01 
 
 		 159 aa  216  7.999999999999999e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2218  FixH family protein  59.75 
 
 		 159 aa  211  3.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000107723  normal  0.262881 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2166  hypothetical protein  60.38 
 
 		 159 aa  210  7e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000514786  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2216  hypothetical protein  60.38 
 
 		 159 aa  210  7e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0316699  normal  0.253608 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2205  hypothetical protein  59.12 
 
 		 159 aa  209  1e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000648455  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4491  hypothetical protein  59.12 
 
 		 159 aa  209  1e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1795  hypothetical protein  58.49 
 
 		 159 aa  208  2e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.390885  normal  0.104999 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1847  hypothetical protein  58.86 
 
 		 158 aa  203  9e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.227491  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1991  hypothetical protein  45.52 
 
 		 164 aa  141  4e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1567  hypothetical protein  45.33 
 
 		 161 aa  135  3.0000000000000003e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2069  hypothetical protein  41.56 
 
 		 169 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.860685  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0935  hypothetical protein  40.41 
 
 		 159 aa  121  3e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.742864 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003471  hypothetical protein  40.4 
 
 		 158 aa  122  3e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0601301  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02299  hypothetical protein  42.18 
 
 		 158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1049  hypothetical protein  37.18 
 
 		 158 aa  115  3.9999999999999997e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.146816  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0637  FixH family protein  35.42 
 
 		 166 aa  95.5  3e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0638  hypothetical protein  36.36 
 
 		 175 aa  94  7e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0105694  normal  0.771152 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2609  hypothetical protein  35.76 
 
 		 172 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00411707  normal  0.558054 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1282  FixH family protein  35.1 
 
 		 169 aa  90.9  6e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1789  hypothetical protein  30.19 
 
 		 171 aa  90.5  8e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.200799  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0718  hypothetical protein  33.33 
 
 		 173 aa  88.6  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.388417  normal  0.280155 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19960  cytochrome c oxidase accessory protein CcoH  33.33 
 
 		 167 aa  86.3  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.177196  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02059  hypothetical protein  35.83 
 
 		 136 aa  81.3  0.000000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0309564  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1997  hypothetical protein  30.77 
 
 		 178 aa  80.5  0.000000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.591704  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3782  hypothetical protein  32.65 
 
 		 179 aa  77.8  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.222956  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44430  hypothetical protein  31.97 
 
 		 179 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0337511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1817  hypothetical protein  31.47 
 
 		 179 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3420  hypothetical protein  30.52 
 
 		 178 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.300528  normal  0.0548017 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3578  hypothetical protein  30 
 
 		 175 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3825  hypothetical protein  31.47 
 
 		 175 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4260  hypothetical protein  30.67 
 
 		 176 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1608  hypothetical protein  30.67 
 
 		 176 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.148481  normal  0.0232786 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1876  hypothetical protein  27.81 
 
 		 185 aa  62  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2417  hypothetical protein  29.58 
 
 		 190 aa  60.5  0.000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1749  hypothetical protein  28.95 
 
 		 195 aa  50.1  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00173592 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1935  hypothetical protein  35.09 
 
 		 95 aa  48.9  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.235684  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4300  hypothetical protein  36.21 
 
 		 87 aa  47  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.486279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1961  hypothetical protein  23.49 
 
 		 186 aa  44.7  0.0005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0773  hypothetical protein  24.38 
 
 		 193 aa  43.9  0.0009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0360313  normal  0.913908 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1528  hypothetical protein  27.85 
 
 		 94 aa  43.5  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0779  hypothetical protein  31.08 
 
 		 193 aa  42.7  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.128656  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2823  hypothetical protein  42.31 
 
 		 98 aa  42.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.010351  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>