54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0637 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0637  FixH family protein  100 
 
 		 166 aa  331  3e-90  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0718  hypothetical protein  38.46 
 
 		 173 aa  121  5e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.388417  normal  0.280155 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2218  FixH family protein  37.84 
 
 		 159 aa  110  6e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000107723  normal  0.262881 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1965  hypothetical protein  37.84 
 
 		 159 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0441287  hitchhiker  0.00747997 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2010  hypothetical protein  37.84 
 
 		 159 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.7151  hitchhiker  0.0000000218476 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2205  hypothetical protein  37.16 
 
 		 159 aa  108  3e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000648455  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4491  hypothetical protein  37.16 
 
 		 159 aa  108  3e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2111  hypothetical protein  37.84 
 
 		 159 aa  108  3e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0125675  normal  0.439118 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0638  hypothetical protein  43.36 
 
 		 175 aa  107  8.000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0105694  normal  0.771152 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2360  hypothetical protein  37.16 
 
 		 159 aa  107  1e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2216  hypothetical protein  36.24 
 
 		 159 aa  106  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0316699  normal  0.253608 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2166  hypothetical protein  36.24 
 
 		 159 aa  106  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000514786  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1955  hypothetical protein  35.81 
 
 		 159 aa  105  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1847  hypothetical protein  38.89 
 
 		 158 aa  105  3e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.227491  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2069  hypothetical protein  38.26 
 
 		 169 aa  103  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.860685  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2215  hypothetical protein  38.89 
 
 		 159 aa  101  4e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2014  hypothetical protein  34.9 
 
 		 159 aa  101  4e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0149983  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1282  FixH family protein  39.58 
 
 		 169 aa  97.1  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2421  hypothetical protein  35.42 
 
 		 159 aa  95.5  3e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000019522  hitchhiker  0.0000597978 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1989  hypothetical protein  38.19 
 
 		 159 aa  94.4  7e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.667905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0935  hypothetical protein  32.21 
 
 		 159 aa  92.8  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.742864 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1789  hypothetical protein  32.92 
 
 		 171 aa  92.4  3e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.200799  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2218  hypothetical protein  34.72 
 
 		 159 aa  90.9  8e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0257547  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1795  hypothetical protein  35.17 
 
 		 159 aa  90.5  9e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.390885  normal  0.104999 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1991  hypothetical protein  30.46 
 
 		 164 aa  87  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2609  hypothetical protein  38.19 
 
 		 172 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00411707  normal  0.558054 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02299  hypothetical protein  32.91 
 
 		 158 aa  79.7  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1876  hypothetical protein  32.68 
 
 		 185 aa  77.8  0.00000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1608  hypothetical protein  34.69 
 
 		 176 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.148481  normal  0.0232786 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4260  hypothetical protein  34.69 
 
 		 176 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003471  hypothetical protein  32.67 
 
 		 158 aa  77  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0601301  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3825  hypothetical protein  34.69 
 
 		 175 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1567  hypothetical protein  30.14 
 
 		 161 aa  75.5  0.0000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3578  hypothetical protein  34.01 
 
 		 175 aa  74.7  0.0000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1049  hypothetical protein  31.03 
 
 		 158 aa  73.6  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.146816  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3782  hypothetical protein  34.25 
 
 		 179 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.222956  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19960  cytochrome c oxidase accessory protein CcoH  34.65 
 
 		 167 aa  68.9  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.177196  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1817  hypothetical protein  31.29 
 
 		 179 aa  68.9  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02059  hypothetical protein  32 
 
 		 136 aa  68.6  0.00000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0309564  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3420  hypothetical protein  33.56 
 
 		 178 aa  68.2  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.300528  normal  0.0548017 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44430  hypothetical protein  33.56 
 
 		 179 aa  68.2  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0337511  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1997  hypothetical protein  31.08 
 
 		 178 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.591704  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2417  hypothetical protein  29.66 
 
 		 190 aa  62.8  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1749  hypothetical protein  23.95 
 
 		 195 aa  53.1  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00173592 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4300  hypothetical protein  39.29 
 
 		 87 aa  47.4  0.00009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.486279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2351  hypothetical protein  21.77 
 
 		 168 aa  47  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000235101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1528  hypothetical protein  37.5 
 
 		 94 aa  45.8  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1935  hypothetical protein  32.26 
 
 		 95 aa  44.3  0.0008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.235684  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1005  hypothetical protein  36.67 
 
 		 92 aa  44.3  0.0009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2573  integral membrane protein linked to a cation pump-like  27.33 
 
 		 156 aa  43.5  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.45803  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1089  hypothetical protein  36.67 
 
 		 92 aa  43.9  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1109  putative lipoprotein transmembrane  33.33 
 
 		 75 aa  43.1  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.862439  normal  0.605647 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2039  hypothetical protein  35.09 
 
 		 78 aa  42  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.412419 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2036  hypothetical protein  33.9 
 
 		 95 aa  42  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>