51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_1528 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_1528  hypothetical protein  100 
 
 		 94 aa  189  2e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1089  hypothetical protein  63.1 
 
 		 92 aa  122  2e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1005  hypothetical protein  63.1 
 
 		 92 aa  122  2e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1165  hypothetical protein  60.22 
 
 		 92 aa  115  3e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1935  hypothetical protein  69.33 
 
 		 95 aa  110  7.000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.235684  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4300  hypothetical protein  61.97 
 
 		 87 aa  97.1  7e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.486279  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2823  hypothetical protein  46.24 
 
 		 98 aa  85.1  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.010351  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3777  hypothetical protein  53.57 
 
 		 86 aa  81.6  0.000000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2780  hypothetical protein  57.83 
 
 		 104 aa  72  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.198014  normal  0.363116 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0718  hypothetical protein  50 
 
 		 173 aa  66.6  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.388417  normal  0.280155 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2473  hypothetical protein  38.46 
 
 		 82 aa  58.2  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.121534  normal  0.0764463 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2774  hypothetical protein  39.51 
 
 		 87 aa  50.8  0.000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00214671 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1282  FixH family protein  35.14 
 
 		 169 aa  49.7  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44430  hypothetical protein  44.64 
 
 		 179 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0337511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3782  hypothetical protein  44.64 
 
 		 179 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.222956  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0638  hypothetical protein  36.84 
 
 		 175 aa  49.3  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0105694  normal  0.771152 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1109  putative lipoprotein transmembrane  37.1 
 
 		 75 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.862439  normal  0.605647 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3420  hypothetical protein  37.88 
 
 		 178 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.300528  normal  0.0548017 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3825  hypothetical protein  35.06 
 
 		 175 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1202  lipoprotein transmembrane  35.48 
 
 		 75 aa  47.8  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2010  hypothetical protein  31.65 
 
 		 159 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.7151  hitchhiker  0.0000000218476 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2111  hypothetical protein  31.65 
 
 		 159 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0125675  normal  0.439118 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1965  hypothetical protein  31.65 
 
 		 159 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0441287  hitchhiker  0.00747997 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1281  lipoprotein transmembrane  32.2 
 
 		 76 aa  45.8  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0429842  normal  0.428676 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0637  FixH family protein  37.5 
 
 		 166 aa  45.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1608  hypothetical protein  33.77 
 
 		 176 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.148481  normal  0.0232786 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4260  hypothetical protein  33.77 
 
 		 176 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1997  hypothetical protein  33.33 
 
 		 178 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.591704  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1817  hypothetical protein  37.7 
 
 		 179 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2218  hypothetical protein  36.51 
 
 		 159 aa  45.4  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0257547  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2014  hypothetical protein  30.77 
 
 		 159 aa  44.7  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0149983  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3578  hypothetical protein  32.47 
 
 		 175 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2360  hypothetical protein  36.36 
 
 		 159 aa  43.9  0.0008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2218  FixH family protein  29.11 
 
 		 159 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000107723  normal  0.262881 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1567  hypothetical protein  34.67 
 
 		 161 aa  43.1  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2215  hypothetical protein  27.85 
 
 		 159 aa  43.5  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1955  hypothetical protein  30.38 
 
 		 159 aa  43.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1847  hypothetical protein  35.19 
 
 		 158 aa  43.1  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.227491  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2421  hypothetical protein  27.85 
 
 		 159 aa  43.5  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000019522  hitchhiker  0.0000597978 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4491  hypothetical protein  29.11 
 
 		 159 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2205  hypothetical protein  29.11 
 
 		 159 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000648455  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2216  hypothetical protein  30.38 
 
 		 159 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0316699  normal  0.253608 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2166  hypothetical protein  30.38 
 
 		 159 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000514786  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1795  hypothetical protein  30.38 
 
 		 159 aa  42  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.390885  normal  0.104999 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1991  hypothetical protein  31.51 
 
 		 164 aa  41.6  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19960  cytochrome c oxidase accessory protein CcoH  37.04 
 
 		 167 aa  41.2  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.177196  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1876  hypothetical protein  35.71 
 
 		 185 aa  40.8  0.006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0458  hypothetical protein  31.58 
 
 		 72 aa  41.2  0.006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.912732  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2609  hypothetical protein  30.77 
 
 		 172 aa  40.8  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00411707  normal  0.558054 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1989  hypothetical protein  34.92 
 
 		 159 aa  40.4  0.007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.667905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2036  hypothetical protein  34.62 
 
 		 95 aa  40.4  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>