48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_1997 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1997  hypothetical protein  100 
 
 		 178 aa  361  2e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.591704  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3420  hypothetical protein  80.9 
 
 		 178 aa  298  3e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.300528  normal  0.0548017 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1817  hypothetical protein  72 
 
 		 179 aa  266  8e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3825  hypothetical protein  71.02 
 
 		 175 aa  251  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4260  hypothetical protein  70.06 
 
 		 176 aa  250  7e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3578  hypothetical protein  69.89 
 
 		 175 aa  250  8.000000000000001e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1608  hypothetical protein  70.06 
 
 		 176 aa  249  1e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.148481  normal  0.0232786 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3782  hypothetical protein  62.15 
 
 		 179 aa  221  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.222956  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44430  hypothetical protein  61.02 
 
 		 179 aa  217  6e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0337511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2609  hypothetical protein  55.21 
 
 		 172 aa  181  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00411707  normal  0.558054 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19960  cytochrome c oxidase accessory protein CcoH  52.69 
 
 		 167 aa  176  2e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.177196  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0638  hypothetical protein  37.16 
 
 		 175 aa  88.6  4e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0105694  normal  0.771152 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2218  hypothetical protein  33.33 
 
 		 159 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0257547  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2421  hypothetical protein  30.77 
 
 		 159 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000019522  hitchhiker  0.0000597978 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0718  hypothetical protein  32.05 
 
 		 173 aa  79  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.388417  normal  0.280155 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1847  hypothetical protein  32.64 
 
 		 158 aa  78.6  0.00000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.227491  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1876  hypothetical protein  31.58 
 
 		 185 aa  78.2  0.00000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1789  hypothetical protein  29.53 
 
 		 171 aa  76.6  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.200799  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2069  hypothetical protein  29.24 
 
 		 169 aa  75.5  0.0000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.860685  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2215  hypothetical protein  32.41 
 
 		 159 aa  74.7  0.0000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1989  hypothetical protein  32.64 
 
 		 159 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.667905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2010  hypothetical protein  30.61 
 
 		 159 aa  72  0.000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.7151  hitchhiker  0.0000000218476 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1965  hypothetical protein  30.61 
 
 		 159 aa  72  0.000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0441287  hitchhiker  0.00747997 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2014  hypothetical protein  30.2 
 
 		 159 aa  71.6  0.000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0149983  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4491  hypothetical protein  30.14 
 
 		 159 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2205  hypothetical protein  30.14 
 
 		 159 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000648455  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1955  hypothetical protein  29.8 
 
 		 159 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2111  hypothetical protein  28.86 
 
 		 159 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0125675  normal  0.439118 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2360  hypothetical protein  29.93 
 
 		 159 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2218  FixH family protein  30.14 
 
 		 159 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000107723  normal  0.262881 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1282  FixH family protein  29.32 
 
 		 169 aa  68.6  0.00000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2417  hypothetical protein  27.78 
 
 		 190 aa  67.8  0.00000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1795  hypothetical protein  31.36 
 
 		 159 aa  68.2  0.00000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.390885  normal  0.104999 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2166  hypothetical protein  33.33 
 
 		 159 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000514786  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2216  hypothetical protein  33.33 
 
 		 159 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0316699  normal  0.253608 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1991  hypothetical protein  27.78 
 
 		 164 aa  65.1  0.0000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1567  hypothetical protein  30.43 
 
 		 161 aa  64.7  0.0000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0637  FixH family protein  31.08 
 
 		 166 aa  62.8  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0935  hypothetical protein  30.14 
 
 		 159 aa  60.8  0.000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.742864 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1049  hypothetical protein  28.06 
 
 		 158 aa  57.8  0.00000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.146816  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02299  hypothetical protein  28.28 
 
 		 158 aa  54.7  0.0000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003471  hypothetical protein  28.57 
 
 		 158 aa  53.5  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0601301  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02059  hypothetical protein  29.17 
 
 		 136 aa  52  0.000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0309564  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1935  hypothetical protein  30.38 
 
 		 95 aa  49.3  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.235684  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4300  hypothetical protein  37.29 
 
 		 87 aa  48.5  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.486279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1528  hypothetical protein  33.33 
 
 		 94 aa  45.1  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1281  lipoprotein transmembrane  29.23 
 
 		 76 aa  44.3  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0429842  normal  0.428676 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1165  hypothetical protein  31.88 
 
 		 92 aa  42  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>