18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0458 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0458  hypothetical protein  100 
 
 		 72 aa  147  7e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.912732  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1358  hypothetical protein  77.61 
 
 		 67 aa  111  3e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.0957605 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1202  lipoprotein transmembrane  48.44 
 
 		 75 aa  69.7  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1109  putative lipoprotein transmembrane  45.71 
 
 		 75 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.862439  normal  0.605647 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1281  lipoprotein transmembrane  51.92 
 
 		 76 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0429842  normal  0.428676 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2036  hypothetical protein  47.69 
 
 		 95 aa  63.9  0.0000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2039  hypothetical protein  52.54 
 
 		 78 aa  63.2  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.412419 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0718  hypothetical protein  46.77 
 
 		 173 aa  61.6  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.388417  normal  0.280155 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0638  hypothetical protein  39.68 
 
 		 175 aa  50.8  0.000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0105694  normal  0.771152 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1935  hypothetical protein  32.79 
 
 		 95 aa  44.3  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.235684  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1847  hypothetical protein  39.13 
 
 		 158 aa  42.4  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.227491  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1089  hypothetical protein  32.84 
 
 		 92 aa  42.4  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1005  hypothetical protein  32.84 
 
 		 92 aa  42.7  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0935  hypothetical protein  40.48 
 
 		 159 aa  41.6  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.742864 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1528  hypothetical protein  31.58 
 
 		 94 aa  41.2  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1282  FixH family protein  36.54 
 
 		 169 aa  40  0.01  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1567  hypothetical protein  46.88 
 
 		 161 aa  40  0.01  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2360  hypothetical protein  41.51 
 
 		 159 aa  40  0.01  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>