29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1474 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_1474  hypothetical protein  100 
 
 		 265 aa  541  1e-153  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2302  hypothetical protein  64.26 
 
 		 282 aa  360  1e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00342801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1705  hypothetical protein  65.6 
 
 		 284 aa  347  1e-94  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4797  hypothetical protein  53.19 
 
 		 257 aa  244  9.999999999999999e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4293  PGAP1 family protein  49.6 
 
 		 263 aa  210  2e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000482527  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1818  hypothetical protein  47.92 
 
 		 262 aa  203  3e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.100365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3646  hypothetical protein  47.5 
 
 		 265 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.33721 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1654  hypothetical protein  47.24 
 
 		 262 aa  191  8e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.876458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3470  PGAP1 family protein  45.18 
 
 		 264 aa  189  5e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.595037  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2469  hypothetical protein  43.85 
 
 		 248 aa  179  2.9999999999999997e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.505624  normal  0.536733 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3553  PGAP1 family protein  44.58 
 
 		 259 aa  177  2e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11216  hypothetical protein  41.98 
 
 		 275 aa  176  4e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1764  hypothetical protein  43.5 
 
 		 284 aa  174  9.999999999999999e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.560768  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1301  hypothetical protein  43.3 
 
 		 254 aa  158  9e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.130537  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2778  hypothetical protein  36.87 
 
 		 269 aa  126  3e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0282  hypothetical protein  34.87 
 
 		 249 aa  112  7.000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.347157 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0349  hypothetical protein  28.77 
 
 		 264 aa  78.2  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.393667  normal  0.208797 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16990  PGAP1-like protein  27.83 
 
 		 243 aa  76.6  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.515319 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1065  PGAP1 family protein  28.1 
 
 		 281 aa  74.7  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197027  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0784  PGAP1 family protein  30.14 
 
 		 269 aa  73.9  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.174438  normal  0.0487797 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2339  lipase  36.61 
 
 		 367 aa  43.9  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1910  PGAP1 family protein  30.43 
 
 		 338 aa  43.1  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.463878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0517  PGAP1 family protein  25 
 
 		 303 aa  43.1  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.678836  normal  0.0127605 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0533  PGAP1 family protein  25 
 
 		 303 aa  42.7  0.006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4759  alpha/beta hydrolase fold  38.46 
 
 		 331 aa  42.7  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00472864  normal  0.0179653 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2371  lipase  35.96 
 
 		 367 aa  42.4  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1386  lipase  35.96 
 
 		 367 aa  42.4  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.30026  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1107  lipase  35.96 
 
 		 367 aa  42.4  0.007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2080  lipase  35.96 
 
 		 367 aa  42.4  0.007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>