More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0298 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2708  putative cytochrome P450  82.35 
 
 		 387 aa  651    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.428821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1062  cytochrome P450  79.8 
 
 		 411 aa  660    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0298  cytochrome P450  100 
 
 		 392 aa  813    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1201  cytochrome P450  78.77 
 
 		 395 aa  655    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0703508  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1648  cytochrome P450  61.18 
 
 		 396 aa  493  9.999999999999999e-139  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2162  cytochrome P450  36.64 
 
 		 392 aa  231  1e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4590  cytochrome P450  35.39 
 
 		 398 aa  229  4e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.28178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0317  cytochrome P450  35.66 
 
 		 398 aa  220  3e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.569371 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1266  cytochrome P450  32.99 
 
 		 393 aa  216  5.9999999999999996e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0318577 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0627  cytochrome P450  34.6 
 
 		 395 aa  215  9.999999999999999e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.913499 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3187  cytochrome P450  32.56 
 
 		 396 aa  209  8e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.25675  normal  0.21811 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5017  cytochrome P450  32.23 
 
 		 394 aa  208  1e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.147849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4929  cytochrome P450  32.23 
 
 		 411 aa  208  2e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7099  cytochrome P450  31.2 
 
 		 396 aa  206  5e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5310  cytochrome P450  31.97 
 
 		 394 aa  206  5e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2761  ferredoxin  34.55 
 
 		 774 aa  204  3e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.843778  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3834  cytochrome P450  31.55 
 
 		 404 aa  202  7e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.205083  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3908  cytochrome P450  31.55 
 
 		 404 aa  202  7e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.306054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3820  cytochrome P450  31.55 
 
 		 404 aa  202  9e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.326991 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2582  cytochrome P450  31.74 
 
 		 395 aa  202  9e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00028994  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5535  cytochrome P450  31.78 
 
 		 406 aa  199  9e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0101021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5243  cytochrome P450  31.78 
 
 		 406 aa  199  9e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5154  cytochrome P450  31.78 
 
 		 418 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4145  cytochrome P450  32.71 
 
 		 398 aa  193  5e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.666553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4218  cytochrome P450  33.07 
 
 		 395 aa  193  5e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.247532 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6537  cytochrome P450  32.16 
 
 		 427 aa  191  2e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.233268 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2913  cytochrome P450  29.65 
 
 		 396 aa  191  2.9999999999999997e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6442  cytochrome P450 CYP109C2  33.85 
 
 		 387 aa  190  4e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.175786  normal  0.0638413 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4029  cytochrome P450  30.75 
 
 		 398 aa  188  1e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.717223 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3733  cytochrome P450  31.2 
 
 		 400 aa  185  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.123768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2552  cytochrome P450  31.79 
 
 		 401 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2597  cytochrome P450  31.79 
 
 		 401 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.138605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11282  cytochrome P450 130 cyp130  32.4 
 
 		 405 aa  184  3e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.112897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1257  cytochrome P450  30.67 
 
 		 395 aa  183  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000160229 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3721  cytochrome P450  30.95 
 
 		 400 aa  182  6e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.153528  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3794  cytochrome P450  30.95 
 
 		 400 aa  182  6e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.209215 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4324  cytochrome P450  29.12 
 
 		 395 aa  181  2e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0546  cytochrome P450  32.04 
 
 		 390 aa  181  2e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.636119  normal  0.852036 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4732  cytochrome P450  30.11 
 
 		 398 aa  181  2e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2591  cytochrome P450  31.52 
 
 		 401 aa  180  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3698  cytochrome P450  32.09 
 
 		 405 aa  179  4.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3771  cytochrome P450  32.09 
 
 		 405 aa  179  4.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.369198 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3696  cytochrome P450  30.25 
 
 		 380 aa  179  5.999999999999999e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3711  cytochrome P450  32.09 
 
 		 405 aa  179  7e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3976  cytochrome P450  32.31 
 
 		 398 aa  178  2e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.424907  normal  0.0390566 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0584  cytochrome P450  30.81 
 
 		 395 aa  178  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  30.56 
 
 		 412 aa  177  3e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6395  cytochrome P450  30.38 
 
 		 399 aa  177  3e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.492605  normal  0.133993 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  32.11 
 
 		 388 aa  177  3e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2229  cytochrome P450  31.42 
 
 		 412 aa  177  4e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4221  cytochrome P450  30.93 
 
 		 403 aa  176  5e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.939357 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3863  cytochrome P450  29.03 
 
 		 408 aa  176  8e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.793072  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3962  cytochrome P450  31.88 
 
 		 398 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4036  cytochrome P450  31.88 
 
 		 398 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2477  cytochrome P450  32.98 
 
 		 401 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0425  cytochrome P450  30.81 
 
 		 406 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0314572  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2431  cytochrome P450  29.87 
 
 		 413 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3390  cytochrome P450  31.61 
 
 		 390 aa  174  3.9999999999999995e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0649051  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3307  cytochrome P450  31.99 
 
 		 434 aa  173  5e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.119575 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  29.95 
 
 		 398 aa  173  5.999999999999999e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4449  cytochrome P450  29.97 
 
 		 401 aa  172  6.999999999999999e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.002835 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4465  cytochrome P450  31.27 
 
 		 413 aa  171  1e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2583  cytochrome P450  28.57 
 
 		 401 aa  170  4e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000851846  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0012  cytochrome P450  32.43 
 
 		 422 aa  170  4e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.469662 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1831  cytochrome P450  29.09 
 
 		 403 aa  170  5e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.248728  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3438  cytochrome P450  30.92 
 
 		 412 aa  169  5e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5035  cytochrome P450  32.25 
 
 		 424 aa  169  6e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.854522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4652  cytochrome P450  32.25 
 
 		 424 aa  169  6e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.828296  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4740  cytochrome P450  32.25 
 
 		 424 aa  169  6e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.59592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2742  cytochrome P450  32.07 
 
 		 427 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0172964  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2772  cytochrome P450  32.07 
 
 		 427 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.434969  normal  0.614085 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2786  cytochrome P450  32.07 
 
 		 427 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1032  cytochrome P450  31.69 
 
 		 414 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0161128  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5159  cytochrome P450  31.28 
 
 		 402 aa  167  4e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.709517 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4491  cytochrome P450  27.41 
 
 		 421 aa  165  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1095  cytochrome P450  31.67 
 
 		 414 aa  165  1.0000000000000001e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1021  cytochrome P450  30.81 
 
 		 425 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0609813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2001  cytochrome P450  31.3 
 
 		 405 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.717574  normal  0.623103 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12293  cytochrome P450 124 cyp124  28.65 
 
 		 428 aa  164  3e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0765  cytochrome P450  28.79 
 
 		 402 aa  163  5.0000000000000005e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.356539 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0979  cytochrome P450  28.34 
 
 		 407 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.492068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4343  cytochrome P450  30.83 
 
 		 412 aa  163  6e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4963  cytochrome P450  29.97 
 
 		 402 aa  162  7e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.500706 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4580  cytochrome P450  29.97 
 
 		 402 aa  162  7e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4668  cytochrome P450  29.97 
 
 		 402 aa  162  7e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5144  cytochrome P450  29.89 
 
 		 409 aa  162  8.000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.623851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4449  cytochrome P450  29.26 
 
 		 398 aa  162  9e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0603  cytochrome P450  32.38 
 
 		 397 aa  162  1e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4560  cytochrome P450  30.92 
 
 		 395 aa  161  2e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.924133  normal  0.0532868 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0246  cytochrome P450  27.7 
 
 		 406 aa  161  2e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.463204  normal  0.16972 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2673  cytochrome P450  27.15 
 
 		 411 aa  161  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.121827 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1451  cytochrome P450  27.54 
 
 		 405 aa  160  3e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.729337 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12295  cytochrome P450 128 cyp128  28.54 
 
 		 489 aa  160  3e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3029  cytochrome P450  29.97 
 
 		 433 aa  160  3e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.89024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1904  cytochrome P450  28.03 
 
 		 443 aa  160  5e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1604  cytochrome P450  27.66 
 
 		 436 aa  159  6e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.454248 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3778  cytochrome P450  28.57 
 
 		 403 aa  159  6e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1766  cytochrome P450  30.87 
 
 		 405 aa  159  7e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.333614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1785  cytochrome P450  30.87 
 
 		 405 aa  159  7e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1832  cytochrome P450  30.87 
 
 		 405 aa  159  7e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>