More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B3495 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B3495  UbiE/COQ5 methyltransferase  100 
 
 
275 aa  556  1e-157  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0172261  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2889  methyltransferase type 11  48.9 
 
 
273 aa  237  1e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000212071 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1067  methyltransferase type 11  37 
 
 
272 aa  217  2e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0574  Methyltransferase type 11  38.26 
 
 
291 aa  95.1  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.374047 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2458  methyltransferase type 11  33.04 
 
 
581 aa  91.7  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0222  Methyltransferase type 11  44.92 
 
 
266 aa  90.1  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.100135  normal  0.562756 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2627  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.85 
 
 
271 aa  88.6  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.114685 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0478  demethylmenaquinone methyltransferase  47.25 
 
 
252 aa  85.1  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3999  Methyltransferase type 11  32.84 
 
 
274 aa  84.3  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1638  Methyltransferase type 11  33.18 
 
 
269 aa  83.6  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.357155  normal  0.179609 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2827  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.41 
 
 
258 aa  83.6  0.000000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0976107 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1028  Methyltransferase type 11  42.34 
 
 
273 aa  82.8  0.000000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4566  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  27.92 
 
 
285 aa  82.8  0.000000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.343396 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6463  methyltransferase type 11  35.71 
 
 
283 aa  82.4  0.000000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0440629 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2013  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  43.96 
 
 
241 aa  80.9  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3132  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  30.34 
 
 
258 aa  81.3  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4690  methyltransferase type 11  29.54 
 
 
280 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21420  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase /demethylmenaquinone methyltransferase  32.34 
 
 
233 aa  80.5  0.00000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0478514  hitchhiker  0.0000156795 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4343  Methyltransferase type 11  24.72 
 
 
415 aa  80.5  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414925  normal  0.473204 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3724  methyltransferase type 11  44.25 
 
 
240 aa  80.5  0.00000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.752355 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2229  methyltransferase type 11  39.32 
 
 
276 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4465  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.41 
 
 
235 aa  79.7  0.00000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101456  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0637  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.73 
 
 
237 aa  79.7  0.00000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.133414 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  40.34 
 
 
252 aa  79.7  0.00000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11434  methyltransferase  38.93 
 
 
274 aa  79.7  0.00000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00184811  normal  0.364084 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1026  methyltransferase type 11  40.98 
 
 
270 aa  79.7  0.00000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3275  Methyltransferase type 11  36.36 
 
 
271 aa  79.3  0.00000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5925  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.37 
 
 
248 aa  79.3  0.00000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4620  methyltransferase type 11  36.09 
 
 
248 aa  79.3  0.00000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225989  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1622  demethylmenaquinone methyltransferase  30.18 
 
 
251 aa  79.3  0.00000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0485  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  41.76 
 
 
249 aa  79  0.00000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.693247  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2537  methyltransferase type 11  32.57 
 
 
281 aa  78.2  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0519  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.76 
 
 
229 aa  78.6  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0647  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  44.68 
 
 
278 aa  77.4  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00193935  hitchhiker  0.00940786 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0208  UbiE/COQ5 methyltransferase  38.32 
 
 
250 aa  77.8  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0448386  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1722  methyltransferase type 11  23.51 
 
 
280 aa  77.8  0.0000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0295021 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  34.13 
 
 
275 aa  77.8  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4211  methyltransferase type 11  37.8 
 
 
250 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4277  methyltransferase type 11  37.8 
 
 
252 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6077  Methyltransferase type 11  38.81 
 
 
277 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.315329 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1785  methyltransferase type 11  39.69 
 
 
275 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0456688  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4438  methyltransferase type 11  37.8 
 
 
252 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2859  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.81 
 
 
287 aa  77  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1144  Methyltransferase type 11  34.67 
 
 
337 aa  77  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.344527  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2831  methyltransferase type 11  43.14 
 
 
270 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2185  methyltransferase type 11  31.46 
 
 
291 aa  77  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.65586  normal  0.0215821 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8055  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  41.18 
 
 
231 aa  77  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1590  Methyltransferase type 11  39.34 
 
 
279 aa  76.6  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2092  UbiE/COQ5 methyltransferase  40.16 
 
 
270 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.05447  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07360  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase /demethylmenaquinone methyltransferase  43.27 
 
 
231 aa  76.6  0.0000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.065272 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1612  Methyltransferase type 11  32.38 
 
 
255 aa  76.3  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.227144  normal  0.791841 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2758  Methyltransferase type 11  29.58 
 
 
263 aa  76.3  0.0000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000336599  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0465  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  45.05 
 
 
249 aa  76.3  0.0000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1804  methyltransferase type 11  38.93 
 
 
275 aa  76.3  0.0000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.204587  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1851  methyltransferase type 11  38.93 
 
 
275 aa  76.3  0.0000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.249225 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4832  methyltransferase type 11  37.28 
 
 
287 aa  76.3  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0563647  normal  0.0172807 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0542  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  34.45 
 
 
261 aa  75.5  0.0000000000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3232  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.81 
 
 
240 aa  75.1  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.233403  normal  0.0251873 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0537  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.5 
 
 
235 aa  75.1  0.000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.383652 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1697  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  41.76 
 
 
249 aa  75.1  0.000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0587723  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3565  Methyltransferase type 11  27.76 
 
 
288 aa  74.7  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0597745  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3515  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.93 
 
 
287 aa  75.1  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2718  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  40.18 
 
 
230 aa  74.7  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.566379 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4067  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.96 
 
 
252 aa  74.7  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.423276 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0167  Methyltransferase type 11  25.37 
 
 
281 aa  73.9  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1080  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.92 
 
 
233 aa  74.3  0.000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0245435  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3030  type 12 methyltransferase  33.51 
 
 
258 aa  74.3  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.788601  normal  0.081497 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11556  methyltransferase  40.94 
 
 
347 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5646  methyltransferase type 11  38.52 
 
 
277 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.166193  normal  0.902058 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1988  Methyltransferase type 11  39.81 
 
 
269 aa  73.6  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0732  methyltransferase type 11  40.31 
 
 
237 aa  73.2  0.000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.358682 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1880  Methyltransferase type 11  29.94 
 
 
240 aa  73.2  0.000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1670  methyltransferase type 11  39.81 
 
 
269 aa  73.2  0.000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  30.06 
 
 
258 aa  73.2  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0248  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.29 
 
 
251 aa  72.8  0.000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.205211 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2776  methyltransferase type 11  38.52 
 
 
279 aa  72.8  0.000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.917399  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3216  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
275 aa  72.8  0.000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1652  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.58 
 
 
254 aa  72.8  0.000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.583368 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  35.19 
 
 
282 aa  72.8  0.000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4247  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.77 
 
 
251 aa  72.4  0.000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.225644  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0294  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methlytransferase UbiE  30.89 
 
 
271 aa  71.6  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00915266  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1671  s-adenosylmethionine (SAM)-dependent methyltransferase  34.54 
 
 
251 aa  71.6  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  37.76 
 
 
265 aa  72  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  40.62 
 
 
225 aa  71.2  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4056  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.77 
 
 
251 aa  71.6  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1159  Methyltransferase type 11  30.43 
 
 
282 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0308306  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0623  methyltransferase type 11  35.17 
 
 
278 aa  71.6  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0996998 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2196  Methyltransferase type 11  36.36 
 
 
266 aa  70.9  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001927  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase UbiE/COQ5  35.14 
 
 
259 aa  70.9  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4216  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.61 
 
 
251 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00227535 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5274  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.61 
 
 
251 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.123369  normal  0.211011 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0972  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  47.87 
 
 
233 aa  70.9  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2022  hypothetical protein  35.71 
 
 
261 aa  70.9  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.891913  normal  0.0390381 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4839  putative methyltransferase  37.23 
 
 
271 aa  70.9  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.705578 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4354  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.61 
 
 
251 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.556022  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2215  methyltransferase type 11  30.56 
 
 
288 aa  70.9  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0250997  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2641  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  30.9 
 
 
236 aa  71.2  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4627  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  28.02 
 
 
291 aa  70.9  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.951338  decreased coverage  0.00842858 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4305  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.61 
 
 
251 aa  70.9  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3960  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.61 
 
 
251 aa  70.5  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0746465 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>