More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0363 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A0363  adenine phosphoribosyltransferase  100 
 
 
205 aa  417  1e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0311  adenine phosphoribosyltransferase  92.63 
 
 
190 aa  360  8e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0417  adenine phosphoribosyltransferase  83.94 
 
 
231 aa  327  6e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.572449  normal  0.29511 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0299  adenine phosphoribosyltransferase  84.57 
 
 
202 aa  323  1e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0272  adenine phosphoribosyltransferase  84.57 
 
 
202 aa  321  4e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4134  adenine phosphoribosyltransferase  80.45 
 
 
184 aa  293  1e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.488945 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3492  adenine phosphoribosyltransferase  80.45 
 
 
184 aa  292  2e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0333  adenine phosphoribosyltransferase  78.65 
 
 
188 aa  292  3e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0603  adenine phosphoribosyltransferase  72.63 
 
 
188 aa  290  1e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0244339 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4787  adenine phosphoribosyltransferase  80.45 
 
 
184 aa  288  3e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4115  adenine phosphoribosyltransferase  72.11 
 
 
188 aa  285  2.9999999999999996e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0531  adenine phosphoribosyltransferase  73.6 
 
 
188 aa  280  1e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0784653  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4239  adenine phosphoribosyltransferase  77.65 
 
 
194 aa  280  1e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3812  adenine phosphoribosyltransferase  76.88 
 
 
196 aa  279  2e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.526341 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2795  adenine phosphoribosyltransferase  73.03 
 
 
188 aa  278  4e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.2159 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6052  adenine phosphoribosyltransferase  75.98 
 
 
185 aa  278  5e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2702  adenine phosphoribosyltransferase  72.47 
 
 
188 aa  277  6e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.212838 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2844  adenine phosphoribosyltransferase  72.47 
 
 
188 aa  277  6e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.185899  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2170  adenine phosphoribosyltransferase  72.47 
 
 
188 aa  276  2e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2784  adenine phosphoribosyltransferase  72.47 
 
 
188 aa  276  2e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.236272  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6114  adenine phosphoribosyltransferase  71.91 
 
 
188 aa  275  3e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.38933  normal  0.400935 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0588  adenine phosphoribosyltransferase  66.34 
 
 
216 aa  273  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.633676  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0772  adenine phosphoribosyltransferase  73.03 
 
 
187 aa  272  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0604  adenine phosphoribosyltransferase  73.03 
 
 
197 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0493  adenine phosphoribosyltransferase  70.79 
 
 
188 aa  268  5e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.410126  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2098  adenine phosphoribosyltransferase  62.57 
 
 
181 aa  234  7e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2814  adenine phosphoribosyltransferase  61.63 
 
 
180 aa  233  1.0000000000000001e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1521  adenine phosphoribosyltransferase  65.73 
 
 
206 aa  231  6e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.781785  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0069  adenine phosphoribosyltransferase  65.73 
 
 
206 aa  231  6e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0575  adenine phosphoribosyltransferase  55.49 
 
 
181 aa  206  2e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.641386  hitchhiker  0.00758657 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0600  adenine phosphoribosyltransferase  55.49 
 
 
181 aa  206  2e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.102638  normal  0.0226618 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0611  adenine phosphoribosyltransferase  55.49 
 
 
181 aa  206  2e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.112864 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3506  adenine phosphoribosyltransferase  52.6 
 
 
181 aa  202  2e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.660561  normal  0.0396544 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2074  adenine phosphoribosyltransferase  56.4 
 
 
179 aa  202  3e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0743  adenine phosphoribosyltransferase  55.23 
 
 
175 aa  201  8e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0465531 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2246  adenine phosphoribosyltransferase  54.34 
 
 
175 aa  200  9.999999999999999e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.111495  normal  0.31564 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6008  adenine phosphoribosyltransferase  55.49 
 
 
181 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.937813  hitchhiker  0.00561119 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7279  adenine phosphoribosyltransferase  55.49 
 
 
181 aa  199  3e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0158728  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44500  adenine phosphoribosyltransferase  55.29 
 
 
182 aa  198  6e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.772947 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2616  adenine phosphoribosyltransferase  52.35 
 
 
182 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0092322  normal  0.996002 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2232  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 
180 aa  196  2.0000000000000003e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0145  normal  0.61649 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3060  adenine phosphoribosyltransferase  50.57 
 
 
187 aa  195  4.0000000000000005e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3199  adenine phosphoribosyltransferase  50.57 
 
 
187 aa  195  4.0000000000000005e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.954761  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3212  adenine phosphoribosyltransferase  52.33 
 
 
179 aa  195  4.0000000000000005e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.699753  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3789  adenine phosphoribosyltransferase  54.12 
 
 
182 aa  195  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.516522  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2325  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 
179 aa  194  6e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.915682  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2888  adenine phosphoribosyltransferase  50.57 
 
 
187 aa  194  8.000000000000001e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.716655  normal  0.100922 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0571  adenine phosphoribosyltransferase  49.71 
 
 
181 aa  192  2e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000300234  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2236  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 
197 aa  192  3e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000133357  hitchhiker  0.000161546 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2270  adenine phosphoribosyltransferase  54.44 
 
 
180 aa  192  4e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.739798  normal  0.613668 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1018  adenine phosphoribosyltransferase  49.46 
 
 
182 aa  191  5e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.14395  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4387  adenine phosphoribosyltransferase  51.45 
 
 
199 aa  191  7e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0100341 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4212  adenine phosphoribosyltransferase  53.18 
 
 
181 aa  191  7e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3039  adenine phosphoribosyltransferase  50.56 
 
 
180 aa  191  8e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.350672  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2310  adenine phosphoribosyltransferase  52.02 
 
 
179 aa  191  8e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2775  adenine phosphoribosyltransferase  51.12 
 
 
181 aa  190  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.781756  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3426  adenine phosphoribosyltransferase  52.94 
 
 
182 aa  190  1e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.65432 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1810  adenine phosphoribosyltransferase  52.35 
 
 
182 aa  190  1e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4317  adenine phosphoribosyltransferase  50.87 
 
 
181 aa  190  1e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.867387 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4990  adenine phosphoribosyltransferase  50.87 
 
 
181 aa  188  5e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1990  adenine phosphoribosyltransferase  52.35 
 
 
182 aa  188  5.999999999999999e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.160211  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1836  adenine phosphoribosyltransferase  52.91 
 
 
178 aa  187  1e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.820901  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1134  adenine phosphoribosyltransferase  44.39 
 
 
198 aa  186  1e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.397131  unclonable  0.0000000192445 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0625  adenine phosphoribosyltransferase  52.33 
 
 
178 aa  186  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1789  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 
177 aa  186  2e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.935669  normal  0.019006 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0485  adenine phosphoribosyltransferase  52.33 
 
 
178 aa  186  3e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.994648  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1995  adenine phosphoribosyltransferase  49.71 
 
 
177 aa  185  3e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.14545  normal  0.153368 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0949  adenine phosphoribosyltransferase  49.43 
 
 
183 aa  186  3e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.431291  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0559  adenine phosphoribosyltransferase  49.43 
 
 
183 aa  186  3e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.100039  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4266  adenine phosphoribosyltransferase  51.76 
 
 
182 aa  185  4e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.262007  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1602  adenine phosphoribosyltransferase  51.76 
 
 
182 aa  185  4e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.143258 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3584  adenine phosphoribosyltransferase  51.76 
 
 
182 aa  185  4e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3237  adenine phosphoribosyltransferase  53.18 
 
 
179 aa  185  4e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.97458  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3831  adenine phosphoribosyltransferase  51.76 
 
 
182 aa  185  4e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.660838 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00420  adenine phosphoribosyltransferase  49.43 
 
 
183 aa  185  5e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00707641  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3141  adenine phosphoribosyltransferase  49.43 
 
 
183 aa  185  5e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000274738  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0401  adenine phosphoribosyltransferase  49.43 
 
 
183 aa  185  5e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0547967  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0512  adenine phosphoribosyltransferase  49.43 
 
 
183 aa  185  5e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00096873  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2613  adenine phosphoribosyltransferase  52.6 
 
 
179 aa  185  5e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.666832 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03088  adenine phosphoribosyltransferase  49.13 
 
 
181 aa  185  5e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0546  adenine phosphoribosyltransferase  49.43 
 
 
183 aa  185  5e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00425  hypothetical protein  49.43 
 
 
183 aa  185  5e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00912156  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0506  adenine phosphoribosyltransferase  49.43 
 
 
183 aa  185  5e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00345089  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2163  adenine phosphoribosyltransferase  51.48 
 
 
181 aa  185  5e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3147  adenine phosphoribosyltransferase  49.43 
 
 
183 aa  185  5e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0333667  normal  0.241044 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002884  adenine phosphoribosyltransferase  49.13 
 
 
181 aa  183  1.0000000000000001e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0439897  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1309  adenine phosphoribosyltransferase  48.59 
 
 
181 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.107555  normal  0.0516553 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2853  adenine phosphoribosyltransferase  48.04 
 
 
184 aa  182  3e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.22702  hitchhiker  0.000000299091 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2408  adenine phosphoribosyltransferase  46.63 
 
 
182 aa  182  3e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000607797  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2619  adenine phosphoribosyltransferase  50.29 
 
 
173 aa  181  9.000000000000001e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0159  adenine phosphoribosyltransferase  49.13 
 
 
179 aa  181  1e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.577979  normal  0.21366 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0533  adenine phosphoribosyltransferase  48.85 
 
 
183 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0527  adenine phosphoribosyltransferase  48.85 
 
 
183 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.11259  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0527  adenine phosphoribosyltransferase  48.85 
 
 
183 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0935  adenine phosphoribosyltransferase  52.6 
 
 
175 aa  180  1e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2382  adenine phosphoribosyltransferase  47.19 
 
 
185 aa  180  1e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000868696  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3040  adenine phosphoribosyltransferase  47.28 
 
 
182 aa  180  1e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0543  adenine phosphoribosyltransferase  48.85 
 
 
183 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2146  adenine phosphoribosyltransferase  50.29 
 
 
186 aa  179  2e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1084  adenine phosphoribosyltransferase  46.24 
 
 
181 aa  179  2e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.954514  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>