More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3343 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_3343  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  100 
 
 
303 aa  602  1.0000000000000001e-171  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3990  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  95.03 
 
 
303 aa  578  1e-164  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0261  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  72.7 
 
 
305 aa  416  9.999999999999999e-116  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0646517 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1923  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  53.12 
 
 
296 aa  288  6e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000000238794  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0081  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  50.35 
 
 
292 aa  268  8e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.280871 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2852  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  49.31 
 
 
297 aa  266  2e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0134215  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1173  tartronate semialdehyde reductase  45.7 
 
 
296 aa  263  3e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1714  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  48.97 
 
 
309 aa  263  3e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.280932  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3126  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  49.83 
 
 
300 aa  262  6e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0554322 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0699  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  49.1 
 
 
286 aa  259  4e-68  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000621245 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1800  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding protein  46.79 
 
 
288 aa  257  2e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1333  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  46.21 
 
 
299 aa  255  8e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000839454 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1318  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  46.98 
 
 
291 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.676438  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1305  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  45.86 
 
 
299 aa  253  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0209  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  45.3 
 
 
294 aa  253  3e-66  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0924  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  43.21 
 
 
288 aa  252  6e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3393  tartronate semialdehyde reductase  46.39 
 
 
294 aa  251  1e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1265  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  46.95 
 
 
284 aa  251  1e-65  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.92382  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0811  tartronate semialdehyde reductase  46.39 
 
 
294 aa  250  2e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2614  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  48.64 
 
 
300 aa  251  2e-65  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02990  tartronate semialdehyde reductase  44.67 
 
 
296 aa  249  3e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0580  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  44.67 
 
 
296 aa  249  3e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0575  tartronate semialdehyde reductase  44.67 
 
 
296 aa  249  3e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3420  tartronate semialdehyde reductase  44.67 
 
 
294 aa  250  3e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3603  tartronate semialdehyde reductase  44.67 
 
 
294 aa  250  3e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0845  tartronate semialdehyde reductase  45.36 
 
 
294 aa  249  3e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02941  hypothetical protein  44.67 
 
 
296 aa  249  3e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3233  tartronate semialdehyde reductase  44.67 
 
 
294 aa  250  3e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4437  tartronate semialdehyde reductase  44.67 
 
 
294 aa  250  3e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.211957 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3314  tartronate semialdehyde reductase  44.67 
 
 
294 aa  250  3e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3607  tartronate semialdehyde reductase  43.99 
 
 
296 aa  249  5e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.680577  normal  0.959534 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3546  tartronate semialdehyde reductase  43.99 
 
 
296 aa  249  5e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.370176  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3438  tartronate semialdehyde reductase  43.99 
 
 
296 aa  249  5e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3441  tartronate semialdehyde reductase  43.99 
 
 
296 aa  249  5e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3510  tartronate semialdehyde reductase  43.99 
 
 
296 aa  249  5e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.900889  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2389  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding protein  42.66 
 
 
289 aa  248  8e-65  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1933  oxidoreductase protein  46.85 
 
 
290 aa  247  2e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.508408  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0236  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  47.31 
 
 
284 aa  246  3e-64  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.355607  normal  0.156106 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3369  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding protein  43.96 
 
 
303 aa  246  4.9999999999999997e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00318158  normal  0.297176 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3864  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  47.08 
 
 
297 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0721878  normal  0.335239 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0210  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  47.31 
 
 
284 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.866351  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1371  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  41.44 
 
 
307 aa  243  1.9999999999999999e-63  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.506801  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1934  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  40.55 
 
 
294 aa  243  3e-63  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4299  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  46.05 
 
 
297 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1570  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  46.05 
 
 
297 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.101448  normal  0.880113 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2927  tartronate semialdehyde reductase  47.26 
 
 
299 aa  240  2e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.378474 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3295  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  49.13 
 
 
293 aa  240  2e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.168978  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3624  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  46.05 
 
 
297 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3553  tartronate semialdehyde reductase  46.74 
 
 
294 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6528  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  44.56 
 
 
297 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.186276  normal  0.100696 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0594  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  45.42 
 
 
299 aa  238  1e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.84188  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2944  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  41.67 
 
 
309 aa  234  1.0000000000000001e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.541427 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3567  tartronate semialdehyde reductase  42.96 
 
 
296 aa  233  2.0000000000000002e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.795052 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3456  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  48.21 
 
 
291 aa  233  3e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.236209  normal  0.0188789 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1320  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  44.37 
 
 
301 aa  233  3e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4173  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  38.93 
 
 
292 aa  233  3e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000525805  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5561  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  45.23 
 
 
283 aa  233  4.0000000000000004e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.560852  normal  0.0590725 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2369  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  46.23 
 
 
292 aa  232  5e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2741  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  39.64 
 
 
292 aa  232  6e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0379773  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1570  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  40.89 
 
 
293 aa  232  6e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.232989 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3784  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  38.33 
 
 
293 aa  231  1e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.874704  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3799  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase; 6-phosphogluconate dehydrogenase  38.33 
 
 
293 aa  231  1e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4063  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  38.33 
 
 
293 aa  231  1e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1777  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  47.95 
 
 
295 aa  231  1e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.581987  normal  0.552551 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0958  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  43.29 
 
 
299 aa  230  3e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5726  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  45.17 
 
 
305 aa  229  3e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4109  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  38.57 
 
 
292 aa  229  5e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2391  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  41.46 
 
 
291 aa  229  5e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.633873  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5347  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding protein  45.17 
 
 
305 aa  229  6e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.224641  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5436  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  45.17 
 
 
305 aa  229  6e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.790109 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1596  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  46.74 
 
 
297 aa  228  8e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00205037  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1587  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  41.67 
 
 
291 aa  228  1e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.169784  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4859  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  43.69 
 
 
297 aa  228  1e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.748222  normal  0.158599 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4151  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  37.98 
 
 
292 aa  228  1e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.130124  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2554  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  41.11 
 
 
291 aa  227  2e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0333948  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2310  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  46.39 
 
 
294 aa  226  3e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.167544  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1087  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  37.98 
 
 
292 aa  226  3e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3871  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  37.98 
 
 
292 aa  226  3e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2461  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding protein  41.11 
 
 
291 aa  226  3e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.243113  hitchhiker  0.00729445 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43420  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  45.7 
 
 
296 aa  226  3e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.164862  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2516  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  44.56 
 
 
292 aa  226  4e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1040  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  41.38 
 
 
292 aa  226  5.0000000000000005e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.821044  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0245  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  42.41 
 
 
304 aa  225  7e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0172  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  43 
 
 
309 aa  225  8e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.798657  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45020  putative oxidoreductase  44.67 
 
 
296 aa  225  9e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.820061  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3831  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  44.67 
 
 
296 aa  225  9e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2771  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  40.91 
 
 
291 aa  224  2e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2771  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  45.02 
 
 
296 aa  224  2e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0891841  normal  0.489794 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1394  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  45.86 
 
 
296 aa  224  2e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.125188  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4310  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  44.71 
 
 
294 aa  224  2e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0860064 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1353  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  40.28 
 
 
290 aa  224  2e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.478456  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1133  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  44.26 
 
 
301 aa  223  2e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.24797 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00459  tartronate semialdehyde reductase, NADH-dependent  45.83 
 
 
292 aa  223  3e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2048  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  42.55 
 
 
289 aa  223  3e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00464  hypothetical protein  45.83 
 
 
292 aa  223  3e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0555  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  44.25 
 
 
299 aa  223  3e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3103  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  45.83 
 
 
292 aa  223  4e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0546  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  45.83 
 
 
292 aa  223  4e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1098  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  42.71 
 
 
312 aa  223  4e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3113  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  45.83 
 
 
292 aa  223  4e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.327741 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>