25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3007 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3007  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 271 aa  529  1e-149  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2033  UspA domain-containing protein  80.81 
 
 		 271 aa  435  1e-121  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.267363 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0596  UspA domain-containing protein  34.84 
 
 		 276 aa  108  9.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3791  UspA domain protein  30.85 
 
 		 280 aa  94.4  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.375352  normal  0.0160832 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  28.88 
 
 		 305 aa  50.1  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  30.61 
 
 		 148 aa  47.4  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1288  universal stress protein UspA  28.67 
 
 		 310 aa  46.2  0.0006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3063  hypothetical protein  26.47 
 
 		 297 aa  45.4  0.0008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  30.41 
 
 		 159 aa  45.1  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  32.8 
 
 		 208 aa  45.4  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  28.02 
 
 		 288 aa  44.3  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3462  sodium/hydrogen exchanger  26.24 
 
 		 750 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0330875 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  24.66 
 
 		 153 aa  43.5  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0118  UspA domain-containing protein  27.08 
 
 		 144 aa  43.9  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.385941 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1574  UspA domain-containing protein  28.97 
 
 		 165 aa  43.5  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1597  UspA domain-containing protein  28.97 
 
 		 165 aa  43.5  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1117  hypothetical protein  28.97 
 
 		 165 aa  43.5  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1294  universal stress protein  31.5 
 
 		 152 aa  43.5  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.967689 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  25.23 
 
 		 287 aa  43.1  0.005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  26.96 
 
 		 304 aa  43.1  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1893  UspA domain protein  32.67 
 
 		 136 aa  42.7  0.007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.125519  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2648  universal stress protein  28.1 
 
 		 309 aa  42.4  0.008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  25.66 
 
 		 145 aa  42.4  0.009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0228  UspA domain protein  28.67 
 
 		 144 aa  42.4  0.009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.115538 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2155  UspA domain-containing protein  28.1 
 
 		 291 aa  42  0.01  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>