30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1659 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1659  hypothetical protein  100 
 
 		 504 aa  949    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00230757 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1303  hypothetical protein  61.43 
 
 		 548 aa  348  2e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.480323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4621  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  43.84 
 
 		 830 aa  69.3  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.184337  normal  0.0506116 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2819  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA) protein-like omain  42.56 
 
 		 1394 aa  62.8  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0967207  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2777  hypothetical protein  29.66 
 
 		 428 aa  61.2  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0809  hypothetical protein  46.62 
 
 		 916 aa  59.3  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.455366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0679  hypothetical protein  43.37 
 
 		 625 aa  58.9  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00239733  hitchhiker  0.00966173 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0267  type 3a, cellulose-binding  33.23 
 
 		 671 aa  58.2  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47315  predicted protein  43.17 
 
 		 504 aa  57.8  0.0000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0151566  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4505  PT repeat-containing protein  50.35 
 
 		 453 aa  56.6  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3078  cellulosome anchoring protein, cohesin region  40.37 
 
 		 2313 aa  55.8  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48493  predicted protein  45.13 
 
 		 551 aa  55.1  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0000192267  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3871  laminin G, domain-containing 2  44.32 
 
 		 1159 aa  52.8  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5691  hypothetical protein  37.36 
 
 		 330 aa  52  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0596359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3078  hypothetical protein  39.29 
 
 		 571 aa  51.6  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1834  hypothetical protein  35.29 
 
 		 719 aa  51.2  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.610374  normal  0.1985 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45682  predicted protein  41.09 
 
 		 633 aa  50.8  0.00006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1291  mucin 2, intestinal/tracheal  43.69 
 
 		 2353 aa  50.1  0.00008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.62338 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0098  hypothetical protein  47.75 
 
 		 605 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0997115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38966  predicted protein  47.17 
 
 		 555 aa  50.1  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00578111  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3758  hypothetical protein  32.76 
 
 		 381 aa  49.3  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000107199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1873  peptidoglycan binding domain-containing protein  46.05 
 
 		 261 aa  49.3  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.499146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  41.18 
 
 		 846 aa  48.5  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44994  predicted protein  42.86 
 
 		 840 aa  47.8  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0685164  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44995  predicted protein  41.46 
 
 		 1217 aa  47  0.0009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00833272  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49571  predicted protein  33.99 
 
 		 1000 aa  46.6  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.822968  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48495  predicted protein  37.14 
 
 		 472 aa  45.8  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.380882  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02800  hypothetical protein  38.46 
 
 		 375 aa  44.3  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2404  FHA domain-containing protein  36.76 
 
 		 489 aa  43.5  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210357  hitchhiker  0.0000326037 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0810  laminin G  53.85 
 
 		 433 aa  43.5  0.01  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.478954  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>