39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1276 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1276  hypothetical protein  100 
 
 		 172 aa  336  8e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0147934  normal  0.415736 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0523  hypothetical protein  73.21 
 
 		 179 aa  248  4e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251176 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0372  hypothetical protein  47.4 
 
 		 181 aa  112  3e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1798  hypothetical protein  27.87 
 
 		 207 aa  71.6  0.000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.188481  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1193  hypothetical protein  30.39 
 
 		 208 aa  70.1  0.00000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3003  hypothetical protein  25.42 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0128  hypothetical protein  29.48 
 
 		 269 aa  55.8  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3218  protein of unknown function DUF165  34.62 
 
 		 170 aa  55.8  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000164696  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2753  hypothetical protein  23.16 
 
 		 225 aa  55.5  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2662  hypothetical protein  29.75 
 
 		 204 aa  52  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0021  hypothetical protein  23.86 
 
 		 235 aa  52  0.000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.594873  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0917  hypothetical protein  31.76 
 
 		 216 aa  50.4  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4163  hypothetical protein  31.06 
 
 		 155 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.143064 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2296  hypothetical protein  29.71 
 
 		 181 aa  49.7  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0878915  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2014  hypothetical protein  31.03 
 
 		 223 aa  48.9  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.736236  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0915  hypothetical protein  23.39 
 
 		 235 aa  48.9  0.00003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1179  hypothetical protein  28.16 
 
 		 224 aa  48.5  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0144  hypothetical protein  26.47 
 
 		 185 aa  48.5  0.00004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.852907  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1938  hypothetical protein  31.03 
 
 		 223 aa  48.5  0.00005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1418  hypothetical protein  29.93 
 
 		 189 aa  47.8  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1456  hypothetical protein  34.41 
 
 		 155 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.143776 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1061  hypothetical protein  34.41 
 
 		 155 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4383  protein of unknown function DUF165  40.4 
 
 		 194 aa  46.2  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2665  hypothetical protein  26.36 
 
 		 210 aa  46.2  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4265  hypothetical protein  34.41 
 
 		 155 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0352  hypothetical protein  30.95 
 
 		 186 aa  45.8  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.352328  normal  0.803247 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3889  hypothetical protein  31.45 
 
 		 166 aa  45.1  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.168768  normal  0.374571 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1013  hypothetical protein  31.06 
 
 		 155 aa  44.3  0.0009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.340468 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6947  hypothetical protein  43.33 
 
 		 205 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.119564  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4165  hypothetical protein  32.1 
 
 		 285 aa  43.9  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.486669  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1085  hypothetical protein  23.16 
 
 		 230 aa  43.5  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3234  hypothetical protein  30.59 
 
 		 289 aa  42.7  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0078  hypothetical protein  30.17 
 
 		 220 aa  43.5  0.002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3094  hypothetical protein  36.14 
 
 		 258 aa  43.5  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0390  hypothetical protein  23.03 
 
 		 238 aa  42.7  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0293125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0375  hypothetical protein  23.03 
 
 		 238 aa  42.7  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4043  hypothetical protein  28.71 
 
 		 210 aa  42  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3163  hypothetical protein  30.59 
 
 		 289 aa  41.2  0.006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.405047  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2415  hypothetical protein  25 
 
 		 234 aa  40.8  0.01  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000066201  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>