41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1262 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1262  methyltransferase type 11  100 
 
 		 232 aa  474  1e-133  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.978798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0509  methyltransferase type 11  90.09 
 
 		 232 aa  416  9.999999999999999e-116  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.427696  normal  0.940294 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3712  Methyltransferase type 11  35.47 
 
 		 244 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.435938  normal  0.0474323 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1618  Methyltransferase type 11  38.98 
 
 		 299 aa  108  8.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0772  Methyltransferase type 11  27.92 
 
 		 240 aa  49.3  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3502  methyltransferase type 11  32.79 
 
 		 225 aa  47.4  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0622401 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1898  methyltransferase type 11  37.36 
 
 		 201 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0160246  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2066  Methyltransferase type 11  37.36 
 
 		 201 aa  46.6  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.240565  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1981  Methyltransferase type 11  37.36 
 
 		 201 aa  46.6  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.020374  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2186  Methyltransferase type 11  32.41 
 
 		 254 aa  46.2  0.0005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.660776  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1690  Methyltransferase type 11  36.84 
 
 		 285 aa  46.2  0.0005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0193071 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1607  Methyltransferase type 11  36.67 
 
 		 238 aa  45.8  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3143  hypothetical protein  32.93 
 
 		 216 aa  45.8  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0708214  normal  0.0392147 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0490  Methyltransferase type 11  35.04 
 
 		 222 aa  45.8  0.0006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1146  Methyltransferase type 11  40 
 
 		 256 aa  45.4  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00784878 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3974  methyltransferase type 11  35.56 
 
 		 284 aa  45.4  0.0008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5676  hypothetical protein  31.31 
 
 		 272 aa  45.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.636295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0390  Methyltransferase type 11  42.59 
 
 		 194 aa  44.7  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4974  methyltransferase type 11  39.62 
 
 		 218 aa  44.7  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.218885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5678  hypothetical protein  26.52 
 
 		 294 aa  44.7  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.622302  normal  0.945039 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2374  methyltransferase type 11  31.71 
 
 		 212 aa  44.7  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.404257 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2007  methyltransferase type 11  32.58 
 
 		 239 aa  44.3  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1577  methyltransferase type 11  32.86 
 
 		 301 aa  44.7  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0911179  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12118  Glycosyltransferase  31.78 
 
 		 255 aa  44.3  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0860161  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1111  methyltransferase type 11  34.45 
 
 		 367 aa  44.3  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.0000134358  hitchhiker  0.0000106237 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72050  hypothetical protein  32.32 
 
 		 278 aa  44.3  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.892313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0965  Methyltransferase type 11  30.09 
 
 		 261 aa  43.5  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0162273  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2546  hypothetical protein  30.11 
 
 		 280 aa  43.5  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.346853  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3234  Methyltransferase type 11  44.68 
 
 		 235 aa  43.1  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4432  glycosyl transferase family 2  32.39 
 
 		 527 aa  43.1  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0484  putative methyltransferase  33.72 
 
 		 240 aa  43.1  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1371  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  48.84 
 
 		 279 aa  43.1  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1569  methyltransferase type 11  33.98 
 
 		 268 aa  42.7  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6478  methyltransferase type 11  38.33 
 
 		 269 aa  42.4  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0560724  normal  0.10851 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4270  methyltransferase type 11  36.21 
 
 		 279 aa  42  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4780  methyltransferase type 11  46.34 
 
 		 256 aa  42  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0464151  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1519  Methyltransferase type 11  46.67 
 
 		 267 aa  42  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0636  Methyltransferase type 11  32.18 
 
 		 228 aa  42  0.008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0381586  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0774  glycosyl transferase family 2  50 
 
 		 1476 aa  42  0.009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1761  methyltransferase type 11  28.7 
 
 		 257 aa  42  0.009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30580  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  42.86 
 
 		 272 aa  41.6  0.01  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>