More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2012 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2012  gst-related protein  100 
 
 		 218 aa  449  1e-125  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.844191  normal  0.0196648 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2167  putative GST-related protein  83.87 
 
 		 217 aa  390  1e-108  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0415103  normal  0.0855354 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1843  Glutathione S-transferase domain protein  81.11 
 
 		 217 aa  378  1e-104  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00779491 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1011  gst-related protein  66.35 
 
 		 213 aa  291  4e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0975  glutathione S-transferase-like protein  66.82 
 
 		 213 aa  287  7e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.144128 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0523  glutathione S-transferase domain-containing protein  58.72 
 
 		 220 aa  266  1e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118067 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4930  glutathione S-transferase domain-containing protein  59.72 
 
 		 214 aa  259  2e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3183  putative glutathione S-transferase  48.42 
 
 		 215 aa  204  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0938037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1982  glutathione S-transferase domain-containing protein  50.48 
 
 		 215 aa  203  2e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1087  glutathione S-transferase domain-containing protein  52.4 
 
 		 218 aa  202  3e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.279034  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2143  glutathione S-transferase-like protein  51.39 
 
 		 218 aa  201  9e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.34665 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5554  glutathione S-transferase-like protein  51.44 
 
 		 218 aa  198  5e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.170335 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0711  glutathione S-transferase domain-containing protein  50.72 
 
 		 224 aa  198  5e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.349527  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1464  glutathione S-transferase domain-containing protein  50.72 
 
 		 218 aa  198  7e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.123939  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1158  glutathione S-transferase domain-containing protein  50.72 
 
 		 218 aa  198  7e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0670265  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0441  glutathione S-transferase domain-containing protein  50.72 
 
 		 218 aa  198  7e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.743701  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1327  glutathione S-transferase family protein  50.72 
 
 		 218 aa  198  7e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1318  glutathione S-transferase family protein  50.72 
 
 		 218 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1372  Glutathione S-transferase domain  48.42 
 
 		 215 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.749181  hitchhiker  0.00129076 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1002  glutathione S-transferase domain-containing protein  50.24 
 
 		 218 aa  196  3e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2264  glutathione S-transferase-like protein  51.39 
 
 		 218 aa  196  3e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1051  glutathione S-transferase-like protein  48.11 
 
 		 218 aa  193  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00110623  normal  0.378234 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1614  glutathione S-transferase-like  49.53 
 
 		 218 aa  192  3e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2226  glutathione S-transferase-like protein  49.53 
 
 		 218 aa  192  3e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2250  glutathione S-transferase-like protein  49.06 
 
 		 218 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1802  glutathione S-transferase domain-containing protein  50.5 
 
 		 210 aa  189  4e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3824  glutathione S-transferase-like  43.93 
 
 		 224 aa  186  3e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.136134  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5490  glutathione S-transferase-like protein  41.55 
 
 		 219 aa  162  3e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0253  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.93 
 
 		 220 aa  160  9e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0205  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.45 
 
 		 220 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.969858  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0183  glutathione S-transferase family protein  40.45 
 
 		 220 aa  150  1e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0326305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0208  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.41 
 
 		 220 aa  150  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.902366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1613  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.71 
 
 		 225 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1807  hypothetical protein  34.3 
 
 		 225 aa  125  7e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.162476  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2216  Glutathione S-transferase domain protein  33.1 
 
 		 208 aa  76.3  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.112278 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2873  Glutathione S-transferase domain  30.1 
 
 		 260 aa  75.5  0.0000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.606982  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3634  glutathione S-transferase domain protein  33.91 
 
 		 219 aa  75.1  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1651  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.02 
 
 		 261 aa  75.1  0.0000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.491053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2106  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.7 
 
 		 199 aa  74.7  0.0000000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0706663  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1688  Glutathione S-transferase domain protein  36.17 
 
 		 243 aa  74.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.423888 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2474  Glutathione S-transferase domain protein  33.33 
 
 		 219 aa  73.6  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03089  stringent starvation protein A  30.19 
 
 		 212 aa  72.4  0.000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00148635  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0477  Glutathione S-transferase domain protein  30.19 
 
 		 212 aa  72.4  0.000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000149407  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0477  stringent starvation protein A  30.19 
 
 		 212 aa  72.4  0.000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000183333  normal  0.261267 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3524  stringent starvation protein A  30.19 
 
 		 212 aa  72.4  0.000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000742741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3702  stringent starvation protein A  30.19 
 
 		 212 aa  72.4  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.711785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3533  stringent starvation protein A  30.19 
 
 		 212 aa  72.4  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000186075  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3547  stringent starvation protein A  30.19 
 
 		 212 aa  72.4  0.000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000170112  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3418  stringent starvation protein A  30.19 
 
 		 212 aa  72.4  0.000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000267382  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3535  stringent starvation protein A  30.19 
 
 		 212 aa  72.4  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00187434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4546  stringent starvation protein A  30.19 
 
 		 212 aa  72.4  0.000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000354095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2467  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.66 
 
 		 209 aa  72.4  0.000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0122974  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3605  stringent starvation protein A  30.19 
 
 		 212 aa  72.4  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0584302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3640  stringent starvation protein A  30.19 
 
 		 212 aa  72.4  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0516172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3712  stringent starvation protein A  30.19 
 
 		 212 aa  72.4  0.000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104882  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03040  hypothetical protein  30.19 
 
 		 212 aa  72.4  0.000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00103064  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0852  putative transcription modulator protein  29.56 
 
 		 204 aa  72  0.000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3532  Glutathione S-transferase domain protein  30.64 
 
 		 217 aa  70.9  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.150118 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2570  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.95 
 
 		 228 aa  71.2  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00976958 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3664  stringent starvation protein A  29.56 
 
 		 212 aa  70.9  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0432438  normal  0.165471 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2825  glutathione S-transferase-like  27.1 
 
 		 221 aa  70.5  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2208  glutathione S-transferase  26.83 
 
 		 207 aa  70.9  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.1078  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0927  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.57 
 
 		 207 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0752  Glutathione S-transferase domain protein  29.38 
 
 		 208 aa  70.1  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.151095  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0291  glutathione S-transferase-like protein  34.68 
 
 		 218 aa  69.7  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.278783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2205  glutathione S-transferase-like protein  26.88 
 
 		 208 aa  68.9  0.00000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.213168  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1959  stringent starvation protein A  25.87 
 
 		 217 aa  68.6  0.00000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.110879  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0812  glutathione S-transferase  24.54 
 
 		 198 aa  68.2  0.00000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000181934  hitchhiker  0.000010543 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5058  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.61 
 
 		 207 aa  68.2  0.00000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000892035 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0933  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.75 
 
 		 204 aa  68.2  0.00000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1830  stringent starvation protein a  28.22 
 
 		 199 aa  67.8  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.855376  normal  0.188895 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0804  stringent starvation protein A  28.48 
 
 		 209 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000607549  hitchhiker  0.0080229 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0263  glutathione S-transferase-like protein  27.67 
 
 		 199 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000123388  hitchhiker  0.00483772 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0371  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.3 
 
 		 203 aa  67  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.322532  normal  0.452731 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1405  Glutathione S-transferase domain protein  28.22 
 
 		 198 aa  67  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4437  stringent starvation protein A  25.95 
 
 		 213 aa  67  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.112115  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3704  stringent starvation protein A  28.3 
 
 		 203 aa  67  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.885565  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2695  stringent starvation protein A  28.3 
 
 		 203 aa  67  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2745  stringent starvation protein A  28.3 
 
 		 203 aa  67  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1808  stringent starvation protein A  28.3 
 
 		 203 aa  67  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3672  stringent starvation protein A  28.3 
 
 		 203 aa  67  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.381091  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4689  glutathione S-transferase-like protein  26.25 
 
 		 205 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.111203  normal  0.0217381 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3542  glutathione S-transferase  28.3 
 
 		 203 aa  67  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.412867 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0221  stringent starvation protein A  27.67 
 
 		 206 aa  67.4  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.43404  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0444  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.3 
 
 		 203 aa  67  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3259  stringent starvation protein A  28.3 
 
 		 203 aa  67  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0398  Glutathione S-transferase domain  27.67 
 
 		 206 aa  67.4  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.165939  normal  0.123126 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2974  stringent starvation protein A  28.3 
 
 		 203 aa  67  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.904673  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0423  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.3 
 
 		 203 aa  67  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.102515  hitchhiker  0.00000408677 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3533  stringent starvation protein A  28.3 
 
 		 209 aa  67  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0362173  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2663  glutathione S-transferase-like  28.3 
 
 		 203 aa  67  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.763542  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4163  stringent starvation protein A  28.3 
 
 		 209 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00527161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0347  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.3 
 
 		 203 aa  67  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0108  stringent starvation protein A  27.41 
 
 		 211 aa  67  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0236194  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0362  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.3 
 
 		 203 aa  67  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0609511  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57530  stringent starvation protein A  26.71 
 
 		 205 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3932  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.75 
 
 		 203 aa  66.6  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.336565 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3647  stringent starvation protein A  28.3 
 
 		 203 aa  67  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.48548  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3090  glutathione S-transferase  28.93 
 
 		 203 aa  66.6  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.840634  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0716  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.12 
 
 		 203 aa  66.2  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.258047 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>