28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0872 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0872  hypothetical protein  100 
 
 		 83 aa  166  1e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.653193  normal  0.0282611 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4711  prevent-host-death family protein  67.44 
 
 		 86 aa  120  8e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.364654 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0012  prevent-host-death protein  55.22 
 
 		 102 aa  79.3  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.93374 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2340  prevent-host-death family protein  43.37 
 
 		 82 aa  70.9  0.000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0714  prevent-host-death family protein  45 
 
 		 93 aa  67.4  0.00000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000667491  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1595  prevent-host-death family protein  44.12 
 
 		 77 aa  63.5  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1697  prevent-host-death family protein  40.54 
 
 		 82 aa  62.8  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000276102  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0623  prevent-host-death protein  39.76 
 
 		 94 aa  60.5  0.000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2918  prevent-host-death family protein  40 
 
 		 83 aa  58.9  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1401  prevent-host-death family protein  48.44 
 
 		 86 aa  56.2  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.489676 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4537  prevent-host-death family protein  37.8 
 
 		 88 aa  55.5  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0623765 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5263  prevent-host-death family protein  37.8 
 
 		 88 aa  54.7  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.416232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4285  hypothetical protein  40 
 
 		 92 aa  54.7  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.192464  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1822  prevent-host-death family protein  32.53 
 
 		 81 aa  54.7  0.0000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.307814  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6276  prevent-host-death family protein  39.02 
 
 		 84 aa  53.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0506  hypothetical protein  37.04 
 
 		 93 aa  52  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.275503 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4580  prevent-host-death family protein  38.75 
 
 		 88 aa  52  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.564565  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5092  prevent-host-death family protein  43.94 
 
 		 112 aa  51.6  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4514  prevent-host-death protein  37.5 
 
 		 91 aa  49.7  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.680635  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2538  prevent-host-death family protein  36.59 
 
 		 84 aa  47.4  0.00006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.91328 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4542  prevent-host-death family protein  37.21 
 
 		 85 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2085  prevent-host-death family protein  38.82 
 
 		 86 aa  45.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.335208  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3421  prevent-host-death family protein  33.75 
 
 		 83 aa  43.5  0.0009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.985918 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1603  prevent-host-death protein  47.83 
 
 		 85 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.916276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4105  hypothetical protein  35 
 
 		 80 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2874  prevent-host-death family protein  36.54 
 
 		 85 aa  41.6  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2734  prevent-host-death protein  53.85 
 
 		 98 aa  41.2  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.431133  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4337  prevent-host-death protein  55.26 
 
 		 77 aa  40.4  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.574582 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>