52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_7300 on replicon NC_007490
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007490  RSP_7300  putative transposase  100 
 
 		 125 aa  249  9.000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.675476  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8273  transposase  92.5 
 
 		 186 aa  221  2e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.523661  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4172  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  57.14 
 
 		 411 aa  138  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4132  transposase IS116/IS110/IS902  54.62 
 
 		 411 aa  137  6e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4164  transposase IS116/IS110/IS902  54.62 
 
 		 411 aa  137  6e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4296  transposase IS116/IS110/IS902  54.62 
 
 		 411 aa  137  6e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4315  transposase IS116/IS110/IS902  54.62 
 
 		 411 aa  137  6e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.86614  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1378  transposase IS116/IS110/IS902  54.62 
 
 		 411 aa  137  6e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.972954  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2955  transposase IS116/IS110/IS902  54.62 
 
 		 411 aa  137  6e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2552  putative IS1492 transposase, TnpA1  55.2 
 
 		 412 aa  130  3.9999999999999996e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.88926 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0442  transposase  60.98 
 
 		 380 aa  107  8.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.145361  normal  0.540344 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1953  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  53.68 
 
 		 378 aa  105  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6214  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  58.14 
 
 		 381 aa  103  9e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9134  transposase  37.29 
 
 		 385 aa  80.1  0.000000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.220032  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9211  transposase  37.29 
 
 		 385 aa  80.1  0.000000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5440  transposase IS111A/IS1328/IS1533  38.52 
 
 		 244 aa  58.2  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3686  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.52 
 
 		 309 aa  58.2  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3532  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.52 
 
 		 309 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.462333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1548  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.52 
 
 		 309 aa  58.2  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.175586  normal  0.166379 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0352  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.52 
 
 		 309 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1436  hypothetical protein  83.33 
 
 		 237 aa  55.5  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1055  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  33.33 
 
 		 307 aa  53.5  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.124364  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4384  transposase IS116/IS110/IS902  32.52 
 
 		 339 aa  48.5  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4247  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  30.77 
 
 		 159 aa  46.6  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5379  putative transposase for insertion sequence element  30.51 
 
 		 208 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1339  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  32.23 
 
 		 328 aa  45.8  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5358  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.81 
 
 		 373 aa  45.4  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0901346 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1120  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.4 
 
 		 328 aa  45.1  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0932183  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3100  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  32.2 
 
 		 342 aa  44.7  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.185223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4623  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  32.2 
 
 		 342 aa  44.7  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0473  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  32.2 
 
 		 342 aa  44.7  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1224  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.4 
 
 		 328 aa  44.7  0.0004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000744849  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1205  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.4 
 
 		 328 aa  44.7  0.0004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000114656  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1260  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  32.23 
 
 		 328 aa  44.3  0.0005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1556  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  32.23 
 
 		 328 aa  44.7  0.0005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00019648  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0012  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.58 
 
 		 328 aa  43.5  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1270  hypothetical protein  27.93 
 
 		 279 aa  43.1  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.251236 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2600  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.17 
 
 		 360 aa  42.7  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1384  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.75 
 
 		 328 aa  42.7  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000149924  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3116  transposase  28.91 
 
 		 265 aa  42.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0859  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.17 
 
 		 360 aa  42.7  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.774179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0279  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.17 
 
 		 360 aa  42.7  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.456081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0408  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.58 
 
 		 326 aa  42  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000108361  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0439  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.91 
 
 		 369 aa  41.6  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1192  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.91 
 
 		 369 aa  41.6  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1680  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.91 
 
 		 369 aa  41.6  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0670311  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4617  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  30.36 
 
 		 243 aa  40.8  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.219004  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06779  hypothetical protein  30.51 
 
 		 384 aa  40.8  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08189  transposase  30.65 
 
 		 229 aa  40.4  0.009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4047  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  33.63 
 
 		 314 aa  40  0.01  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1602  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  33.63 
 
 		 314 aa  40  0.01  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0984  hypothetical protein  26.79 
 
 		 326 aa  40  0.01  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.365898 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>