134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3071 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3071  putative hydroxypyruvate reductase/glycerate kinase  100 
 
 		 423 aa  810    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.212031  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3797  hydroxypyruvate reductase  98.58 
 
 		 423 aa  798    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.430898  normal  0.277754 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3906  hypothetical protein  83.84 
 
 		 427 aa  629  1e-179  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.394161 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2329  hydroxypyruvate reductase  55.5 
 
 		 432 aa  412  1e-114  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.162481  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0976  hydroxypyruvate reductase  57.71 
 
 		 429 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0906913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3177  hydroxypyruvate reductase  60.19 
 
 		 428 aa  400  9.999999999999999e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000791929 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2118  glycerate 2-kinase  55.16 
 
 		 426 aa  397  1e-109  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.143234 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1449  hydroxypyruvate reductase oxidoreductase protein  56.78 
 
 		 446 aa  392  1e-108  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.618251  normal  0.42713 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3609  MOFRL domain protein  55.77 
 
 		 419 aa  387  1e-106  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3717  Hydroxypyruvate reductase  54.57 
 
 		 420 aa  382  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3921  Hydroxypyruvate reductase  55.87 
 
 		 446 aa  384  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.152569  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2115  hydroxypyruvate reductase  53.5 
 
 		 440 aa  382  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0122606 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1434  hydroxypyruvate reductase  51.99 
 
 		 438 aa  378  1e-104  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.232767 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1122  hydroxypyruvate reductase  53.88 
 
 		 440 aa  374  1e-102  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.468975  normal  0.520204 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3263  glycerate 2-kinase  56.83 
 
 		 420 aa  374  1e-102  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1042  Hydroxypyruvate reductase  54.23 
 
 		 440 aa  371  1e-101  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4659  Hydroxypyruvate reductase  58.03 
 
 		 419 aa  369  1e-101  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1018  hydroxypyruvate reductase  53.33 
 
 		 448 aa  367  1e-100  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.49104  normal  0.460124 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3154  Hydroxypyruvate reductase  54.31 
 
 		 439 aa  368  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.941324 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3481  Hydroxypyruvate reductase  54.07 
 
 		 439 aa  363  4e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.866282  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4300  hydroxypyruvate reductase  51.32 
 
 		 424 aa  360  2e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1721  hydroxypyruvate reductase  53.5 
 
 		 447 aa  359  5e-98  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.374264  normal  0.0199208 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1132  hydroxypyruvate reductase  57.24 
 
 		 435 aa  359  6e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.217848 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3865  hydroxypyruvate reductase  51.08 
 
 		 424 aa  358  8e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.57883  normal  0.36576 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1113  hydroxypyruvate reductase  55.01 
 
 		 448 aa  358  9.999999999999999e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1569  hydroxypyruvate reductase  50.84 
 
 		 424 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.305775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1160  hydroxypyruvate reductase  57.96 
 
 		 439 aa  357  2.9999999999999997e-97  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.370064  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0355  hydroxypyruvate reductase, putative  50.35 
 
 		 428 aa  356  5e-97  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3625  hydroxypyruvate reductase  50.84 
 
 		 424 aa  355  6.999999999999999e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3451  glycerate 2-kinase  53.29 
 
 		 443 aa  355  1e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0372  putative hydroxypyruvate reductase  50.35 
 
 		 448 aa  353  4e-96  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.236389  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0928  hydroxypyruvate reductase  56.57 
 
 		 460 aa  350  3e-95  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1595  glycerate 2-kinase  49.64 
 
 		 424 aa  349  4e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00618023  normal  0.78325 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2309  hydroxypyruvate reductase  50.36 
 
 		 426 aa  349  6e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.866459  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1644  Hydroxypyruvate reductase  51.32 
 
 		 421 aa  348  8e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.265451 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4311  hydroxypyruvate reductase  51.54 
 
 		 422 aa  345  7e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0996892 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1319  hydroxypyruvate reductase  56.83 
 
 		 422 aa  340  2e-92  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.136183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45030  hypothetical protein  50.48 
 
 		 421 aa  340  2e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3294  glycerate 2-kinase  53.85 
 
 		 435 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.805027  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2839  MOFRL  51.31 
 
 		 421 aa  337  1.9999999999999998e-91  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.127402  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3163  hydroxypyruvate reductase  53 
 
 		 423 aa  337  1.9999999999999998e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3833  hypothetical protein  50.48 
 
 		 421 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1715  Hydroxypyruvate reductase  55.4 
 
 		 421 aa  335  7e-91  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.497663 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0461  hydroxypyruvate reductase  49.53 
 
 		 424 aa  335  7e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.38588  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1461  Hydroxypyruvate reductase  50.71 
 
 		 424 aa  334  2e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.012769  normal  0.0639524 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0654  MOFRL domain protein  56.07 
 
 		 419 aa  332  1e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3046  Hydroxypyruvate reductase  53.49 
 
 		 415 aa  332  1e-89  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.418895  normal  0.698329 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4629  hydroxypyruvate reductase  52.8 
 
 		 440 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5562  hydroxypyruvate reductase  48.65 
 
 		 404 aa  327  2.0000000000000001e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.912561  normal  0.104542 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2772  glycerate 2-kinase  50.6 
 
 		 424 aa  325  9e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0569344  normal  0.431109 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3104  hydroxypyruvate reductase  49.64 
 
 		 418 aa  319  7e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.561288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3926  hydroxypyruvate reductase  50.84 
 
 		 407 aa  317  3e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2372  hydroxypyruvate reductase  56.7 
 
 		 424 aa  316  6e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.137273  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2209  hydroxypyruvate reductase  51.4 
 
 		 444 aa  314  1.9999999999999998e-84  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1267  hydroxypyruvate reductase  52.27 
 
 		 422 aa  303  3.0000000000000004e-81  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.315917  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9119  hydroxypyruvate reductase  46.99 
 
 		 411 aa  301  1e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5964  MOFRL domain protein  50.36 
 
 		 434 aa  300  2e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2464  hydroxypyruvate reductase  52.4 
 
 		 421 aa  293  3e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.222248  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0362  Hydroxypyruvate reductase  47.89 
 
 		 432 aa  289  7e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.228357  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0377  Hydroxypyruvate reductase  47.29 
 
 		 432 aa  288  1e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.487635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5205  hydroxypyruvate reductase  50.6 
 
 		 434 aa  287  2e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.37508  normal  0.0772192 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0405  MOFRL  46.95 
 
 		 432 aa  287  2.9999999999999996e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0774334 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2747  hydroxypyruvate reductase  47.94 
 
 		 437 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.279736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2974  Hydroxypyruvate reductase  47.71 
 
 		 437 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.845005 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1889  hydroxypyruvate reductase  44.55 
 
 		 450 aa  281  2e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000303684  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0477  hydroxypyruvate reductase  49.87 
 
 		 374 aa  280  4e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.34998  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3775  MOFRL domain-containing protein  50.35 
 
 		 413 aa  279  9e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.801472  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0486  putative hydroxypyruvate reductase oxidoreductase protein  47.67 
 
 		 432 aa  277  3e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.214637 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2869  Hydroxypyruvate reductase  47.48 
 
 		 437 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1207  hydroxypyruvate reductase  39.32 
 
 		 417 aa  273  5.000000000000001e-72  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00103634  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03376  Hydroxypyruvate reductase  44.05 
 
 		 409 aa  272  8.000000000000001e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0126  hydroxypyruvate reductase  47.18 
 
 		 439 aa  271  1e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.448884 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1248  hydroxypyruvate reductase  39.52 
 
 		 417 aa  271  2e-71  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0463  hydroxypyruvate reductase  45.2 
 
 		 437 aa  268  8.999999999999999e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00870475  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0433  hydroxypyruvate reductase  49.37 
 
 		 424 aa  265  8e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.152478 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1897  hydroxypyruvate reductase  47.07 
 
 		 438 aa  264  3e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.216641 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5683  Hydroxypyruvate reductase  47.89 
 
 		 428 aa  263  3e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.272807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2000  Hydroxypyruvate reductase  48.24 
 
 		 426 aa  262  6.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7083  putative hydroxypyruvate reductase  44.47 
 
 		 426 aa  261  2e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1425  Hydroxypyruvate reductase  42.96 
 
 		 424 aa  256  6e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0099  Hydroxypyruvate reductase  42.09 
 
 		 443 aa  254  3e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0806  Hydroxypyruvate reductase  39.02 
 
 		 496 aa  251  1e-65  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.490664  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0207  hydroxypyruvate reductase  41.96 
 
 		 459 aa  250  3e-65  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0534  hydroxypyruvate reductase  38.46 
 
 		 415 aa  248  1e-64  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0143531  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0659  hydroxypyruvate reductase  46.01 
 
 		 428 aa  248  2e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2615  hydroxypyruvate reductase  44.31 
 
 		 422 aa  246  4.9999999999999997e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2230  hydroxypyruvate reductase  43.89 
 
 		 451 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0944  Hydroxypyruvate reductase  45.39 
 
 		 439 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0451317  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3915  MOFRL domain-containing protein  43.4 
 
 		 443 aa  239  5e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0566  hypothetical protein  42.96 
 
 		 428 aa  238  1e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2759  Hydroxypyruvate reductase  46.01 
 
 		 317 aa  234  2.0000000000000002e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1253  hydroxypyruvate reductase  34.84 
 
 		 412 aa  234  2.0000000000000002e-60  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000356699  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1997  hydroxypyruvate reductase  45.94 
 
 		 458 aa  232  8.000000000000001e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.05256 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2031  hydroxypyruvate reductase  42.11 
 
 		 447 aa  231  1e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.560327 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1573  hydroxypyruvate reductase  43.65 
 
 		 452 aa  232  1e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0993833  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3567  hydroxypyruvate reductase  46.01 
 
 		 426 aa  231  3e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.187616  normal  0.669404 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2854  glycerate 2-kinase  47.09 
 
 		 428 aa  231  3e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0336  hydroxypyruvate reductase  42.34 
 
 		 412 aa  228  2e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1502  Hydroxypyruvate reductase  41.24 
 
 		 446 aa  227  4e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3389  Hydroxypyruvate reductase  44.78 
 
 		 453 aa  226  8e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.911945  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>