34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3795 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_3795  hypothetical protein  100 
 
 		 277 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.394583 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4040  hypothetical protein  87.36 
 
 		 277 aa  509  1e-143  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.253336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1669  hypothetical protein  83.63 
 
 		 281 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1229  hypothetical protein  71.64 
 
 		 275 aa  408  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000116233 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3061  hypothetical protein  64.5 
 
 		 275 aa  357  8e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3562  hypothetical protein  62.98 
 
 		 275 aa  349  3e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.252373  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2390  hypothetical protein  62.6 
 
 		 277 aa  345  5e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.325647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3331  hypothetical protein  63.92 
 
 		 282 aa  344  8.999999999999999e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.400491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4780  hypothetical protein  60.93 
 
 		 295 aa  342  5e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2916  putative hydrolase  60.82 
 
 		 277 aa  342  5.999999999999999e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.751414 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0078  hypothetical protein  43.95 
 
 		 526 aa  196  3e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0137812  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1120  hypothetical protein  37.33 
 
 		 281 aa  138  7.999999999999999e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.381858  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4546  protein of unknown function DUF1400  32.64 
 
 		 551 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3002  hypothetical protein  26.9 
 
 		 346 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2047  alpha/beta hydrolase fold  47.27 
 
 		 261 aa  47  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.939702  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3340  protein of unknown function DUF71 ATP-binding region  33.63 
 
 		 382 aa  46.6  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1188  alpha/beta hydrolase fold  27.2 
 
 		 289 aa  46.2  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.971563  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1365  alpha/beta hydrolase fold protein  30.23 
 
 		 300 aa  45.8  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.371007  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3339  hypothetical protein  36.07 
 
 		 289 aa  45.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3135  hypothetical protein  26.9 
 
 		 339 aa  45.4  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0222063  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1441  hypothetical protein  25.48 
 
 		 312 aa  44.3  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1914  alpha/beta fold family hydrolase  30.53 
 
 		 243 aa  43.5  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5046  alpha/beta hydrolase fold protein  42.37 
 
 		 281 aa  43.9  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.186398  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0978  alpha/beta hydrolase fold  28.24 
 
 		 305 aa  43.5  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.754776  normal  0.076368 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1074  alpha/beta hydrolase fold protein  28.24 
 
 		 305 aa  43.5  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.444129  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3591  hypothetical protein  27.27 
 
 		 269 aa  42.7  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.391737  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2445  alpha/beta hydrolase fold  26.13 
 
 		 340 aa  42.7  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.54824  normal  0.191947 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0391  hypothetical protein  33.33 
 
 		 526 aa  42.7  0.007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0764093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1357  hypothetical protein  35.04 
 
 		 283 aa  42.7  0.007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0861154 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3335  alpha/beta hydrolase fold  31.94 
 
 		 307 aa  42.4  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.674591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4184  alpha/beta hydrolase fold  31.94 
 
 		 307 aa  42.4  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4182  alpha/beta hydrolase fold  31.94 
 
 		 307 aa  42.4  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.250212  normal  0.347082 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3825  protein of unknown function DUF1400  25.52 
 
 		 547 aa  42.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2483  alpha/beta hydrolase fold  25.37 
 
 		 359 aa  42.4  0.01  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.436597  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>