21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3078 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_3078  prevent-host-death protein  100 
 
 		 80 aa  160  8.000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.018345  normal  0.547068 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3345  prevent-host-death protein  90 
 
 		 92 aa  149  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.408445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0090  prevent-host-death protein  82.89 
 
 		 80 aa  128  2.0000000000000002e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5883  prevent-host-death family protein  70.59 
 
 		 79 aa  102  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.635627 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3378  prevent-host-death family protein  59.21 
 
 		 83 aa  96.7  9e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.185106  normal  0.561941 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0140  prevent-host-death family protein  57.89 
 
 		 83 aa  95.9  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2530  prevent-host-death protein  59.32 
 
 		 69 aa  73.9  0.0000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2085  prevent-host-death family protein  44.16 
 
 		 86 aa  53.5  0.0000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.335208  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1710  prevent-host-death protein  40.24 
 
 		 90 aa  50.4  0.000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0575  prevent-host-death protein  43.21 
 
 		 80 aa  50.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.103149  normal  0.496262 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3527  prevent-host-death family protein  53.33 
 
 		 82 aa  48.5  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.378115  normal  0.865399 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0506  hypothetical protein  41.56 
 
 		 93 aa  45.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.275503 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0714  prevent-host-death family protein  38.81 
 
 		 93 aa  45.1  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000667491  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1212  prevent-host-death family protein  36.9 
 
 		 101 aa  43.5  0.0009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.985049  normal  0.376618 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2918  prevent-host-death family protein  35.9 
 
 		 83 aa  43.5  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4285  hypothetical protein  43.33 
 
 		 92 aa  42.4  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.192464  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0623  prevent-host-death protein  39.39 
 
 		 94 aa  42.7  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3930  Axe family addiction module antitoxin  39.13 
 
 		 73 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2340  prevent-host-death family protein  46.81 
 
 		 82 aa  42  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4711  prevent-host-death family protein  38.37 
 
 		 86 aa  41.6  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.364654 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1603  prevent-host-death protein  35 
 
 		 85 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.916276  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>