47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1837 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_1837  putative ferredoxin  100 
 
 		 69 aa  144  5e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3630  putative ferredoxin  91.3 
 
 		 69 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.712603 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1933  putative ferredoxin  85.07 
 
 		 75 aa  122  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00206821  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2692  putative ferredoxin  75.36 
 
 		 69 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.13983  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4034  putative ferredoxin  45.31 
 
 		 64 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6843  hypothetical protein  43.75 
 
 		 63 aa  56.2  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1965  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  42.42 
 
 		 65 aa  53.1  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.838957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4586  hypothetical protein  41.67 
 
 		 62 aa  50.8  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0764967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1479  putative ferredoxin  40 
 
 		 71 aa  48.9  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.621705  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4159  hypothetical protein  37.5 
 
 		 64 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3679  hypothetical protein  36.92 
 
 		 65 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3718  ferredoxin 1  41.67 
 
 		 63 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3692  hypothetical protein  36.92 
 
 		 65 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.303835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3752  hypothetical protein  36.92 
 
 		 65 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.711087 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3705  ferredoxin 1  41.67 
 
 		 63 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4179  ferredoxin 1  43.33 
 
 		 63 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0661278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3778  ferredoxin 1  41.67 
 
 		 63 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.432439 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5162  hypothetical protein  39.68 
 
 		 71 aa  47  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.635112 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3163  ferredoxin  35.94 
 
 		 71 aa  47  0.00008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.980888  hitchhiker  0.00034613 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2815  hypothetical protein  38.71 
 
 		 63 aa  47  0.00009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.184095  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4170  hypothetical protein  37.5 
 
 		 101 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.71627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3936  ferredoxin 1  43.33 
 
 		 62 aa  46.2  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00512992 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13537  ferredoxin fdxD  38.33 
 
 		 63 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.48492  hitchhiker  0.0000142713 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2484  hypothetical protein  37.5 
 
 		 101 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.342972 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2834  ferredoxin  38.71 
 
 		 62 aa  45.8  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1742  hypothetical protein  38.71 
 
 		 67 aa  45.8  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2520  ferredoxin  38.71 
 
 		 62 aa  45.8  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2711  cytochrome P450 51  39.13 
 
 		 551 aa  45.1  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3681  hypothetical protein  35.38 
 
 		 70 aa  45.1  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0609  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.92 
 
 		 68 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0578713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0618  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  36.92 
 
 		 68 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0631  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.92 
 
 		 68 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1552  hypothetical protein  40 
 
 		 83 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.709118 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3662  putative ferredoxin  37.5 
 
 		 63 aa  43.9  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0222771  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1595  hypothetical protein  36.51 
 
 		 68 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1295  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40 
 
 		 62 aa  43.5  0.0009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000000405521  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1226  hypothetical protein  39.34 
 
 		 64 aa  42.7  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.156661  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3704  hypothetical protein  36.67 
 
 		 104 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.623768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2631  hypothetical protein  33.33 
 
 		 107 aa  42.4  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.338821  normal  0.255777 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3691  hypothetical protein  36.67 
 
 		 104 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2499  hypothetical protein  34.38 
 
 		 64 aa  42.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3764  hypothetical protein  36.67 
 
 		 104 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.310706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3832  hypothetical protein  32.81 
 
 		 64 aa  42  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00188009  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2877  hypothetical protein  33.87 
 
 		 62 aa  41.6  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0752  NADH dehydrogenase (quinone)  35.59 
 
 		 505 aa  41.2  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11816  ferredoxin  33.33 
 
 		 67 aa  40.4  0.008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.454511  normal  0.975573 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5849  FdxD  36.67 
 
 		 60 aa  40.4  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.98386 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>