53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0031 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_0031  hypothetical protein  100 
 
 		 128 aa  258  2e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.829328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2253  hypothetical protein  53.79 
 
 		 139 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0821742  normal  0.0981277 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3843  hypothetical protein  57.39 
 
 		 139 aa  117  6e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4521  hypothetical protein  57.39 
 
 		 139 aa  117  6e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3684  hypothetical protein  57.39 
 
 		 139 aa  117  6e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.439114  normal  0.115226 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5566  hypothetical protein  53.03 
 
 		 139 aa  117  7e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.869642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3740  hypothetical protein  53.03 
 
 		 139 aa  117  7e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.298391  normal  0.20234 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4901  hypothetical protein  56.52 
 
 		 144 aa  116  7.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0916616  hitchhiker  0.000097555 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1494  hypothetical protein  55.65 
 
 		 188 aa  116  9.999999999999999e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.566835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0556  hypothetical protein  54.78 
 
 		 307 aa  114  5e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.115578  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2856  hypothetical protein  56.52 
 
 		 145 aa  114  6e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2470  hypothetical protein  53.91 
 
 		 139 aa  113  8.999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0716803  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2609  hypothetical protein  53.91 
 
 		 139 aa  113  8.999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0905  hypothetical protein  53.91 
 
 		 222 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6814  hypothetical protein  56.52 
 
 		 145 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0340512 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4398  hypothetical protein  53.04 
 
 		 145 aa  108  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0862516 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1860  hypothetical protein  38.58 
 
 		 129 aa  101  3e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.450292  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0436  hypothetical protein  44.8 
 
 		 137 aa  96.3  1e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.888364  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26270  hypothetical protein  48.65 
 
 		 113 aa  89.4  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2908  hypothetical protein  45.87 
 
 		 129 aa  90.1  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5937  hypothetical protein  38.89 
 
 		 174 aa  82.8  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.805677  normal  0.235631 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0207  hypothetical protein  39.17 
 
 		 125 aa  83.2  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.335071  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7074  hypothetical protein  38.71 
 
 		 173 aa  83.6  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00681904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3065  hypothetical protein  40.32 
 
 		 137 aa  80.9  0.000000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.367568  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3800  hypothetical protein  42.34 
 
 		 127 aa  80.5  0.000000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.92452  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0634  hypothetical protein  39.82 
 
 		 133 aa  79  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0458  hypothetical protein  42 
 
 		 138 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2369  hypothetical protein  36.51 
 
 		 174 aa  74.7  0.0000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.38542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0246  hypothetical protein  34.92 
 
 		 158 aa  74.7  0.0000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0271  hypothetical protein  34.92 
 
 		 158 aa  74.7  0.0000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.450907  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2111  hypothetical protein  42 
 
 		 138 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3583  hypothetical protein  39.62 
 
 		 136 aa  73.6  0.0000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.252528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2932  hypothetical protein  34.48 
 
 		 175 aa  71.6  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.784361  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1570  hypothetical protein  41.38 
 
 		 124 aa  72  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2379  hypothetical protein  40 
 
 		 152 aa  71.6  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.351453 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1420  hypothetical protein  41.38 
 
 		 124 aa  72  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3925  hypothetical protein  37.07 
 
 		 146 aa  71.2  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2890  hypothetical protein  35.56 
 
 		 148 aa  69.3  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4482  hypothetical protein  34.15 
 
 		 148 aa  68.6  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2010  hypothetical protein  36.54 
 
 		 131 aa  65.1  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00777804  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1814  hypothetical protein  38.46 
 
 		 131 aa  64.3  0.0000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000108382  normal  0.608406 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2226  hypothetical protein  37 
 
 		 132 aa  63.9  0.0000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2468  hypothetical protein  36.8 
 
 		 137 aa  62.8  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.316227  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2714  hypothetical protein  38.24 
 
 		 129 aa  60.8  0.000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.532676 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1071  hypothetical protein  31.3 
 
 		 179 aa  60.5  0.000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0158833  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0059  hypothetical protein  34.92 
 
 		 135 aa  60.1  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1660  hypothetical protein  34.23 
 
 		 135 aa  59.3  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.149614  normal  0.777055 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1187  hypothetical protein  33.04 
 
 		 137 aa  58.5  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.80515  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00943  hypothetical protein  27.93 
 
 		 128 aa  57  0.00000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1046  hypothetical protein  31.71 
 
 		 277 aa  52.8  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4081  hypothetical protein  33.07 
 
 		 151 aa  50.4  0.000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2862  hypothetical protein  28.46 
 
 		 136 aa  41.6  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.927887  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4130  hypothetical protein  37.5 
 
 		 145 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000962953 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>