298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3156 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_3156  molybdopterin binding domain-containing protein  100 
 
 		 245 aa  489  1e-137  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0770951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2472  molybdopterin binding domain  87.24 
 
 		 245 aa  436  1e-121  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.488887  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2241  molybdopterin binding domain-containing protein  86.36 
 
 		 245 aa  428  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.312717  normal  0.144561 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3215  molybdopterin binding domain  86.36 
 
 		 245 aa  424  1e-118  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.585688 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5271  hypothetical protein  84.71 
 
 		 245 aa  426  1e-118  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.31936 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2591  molybdopterin binding domain-containing protein  77.64 
 
 		 246 aa  386  1e-106  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.301025  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2189  molybdopterin-biosynthesis enzyme MoeA  76.13 
 
 		 246 aa  377  1e-103  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3541  molybdopterin binding domain-containing protein  63.83 
 
 		 250 aa  288  4e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0974564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6952  molybdopterin binding domain-containing protein  59.09 
 
 		 250 aa  264  8e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0163627 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7665  molybdopterin binding domain protein  62.08 
 
 		 250 aa  263  1e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0708  molybdopterin binding domain-containing protein  59.67 
 
 		 246 aa  260  2e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.261408 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1340  molybdopterin binding domain-containing protein  54.32 
 
 		 246 aa  253  2.0000000000000002e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1130  molybdopterin binding domain-containing protein  58.33 
 
 		 246 aa  251  7e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.327977  normal  0.856918 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2117  molybdopterin binding domain protein  55.65 
 
 		 259 aa  251  8.000000000000001e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2606  competence-damage associated protein  53.31 
 
 		 260 aa  245  6e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.187764  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3791  molybdopterin binding domain-containing protein  52.87 
 
 		 254 aa  244  9.999999999999999e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.397428  hitchhiker  0.00000267151 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0374  molybdopterin binding domain-containing protein  57.02 
 
 		 245 aa  242  3e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0442  molybdopterin binding domain  60 
 
 		 250 aa  238  5.999999999999999e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.422918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2135  molybdopterin binding domain-containing protein  51.25 
 
 		 252 aa  237  1e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0406  molybdopterin binding domain  59.17 
 
 		 245 aa  237  1e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.803143 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2601  molybdopterin binding domain-containing protein  50.83 
 
 		 255 aa  235  4e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0702349  normal  0.154459 
 
 
-
 
NC_004310  BR1048  cinA-related protein  50.42 
 
 		 252 aa  233  2.0000000000000002e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1593  molybdopterin binding domain protein  52.89 
 
 		 258 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1417  molybdopterin binding domain  52.7 
 
 		 258 aa  231  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.348811  normal  0.21412 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1013  cinA-related protein  50 
 
 		 252 aa  230  2e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1385  molybdopterin binding domain-containing protein  52.25 
 
 		 253 aa  226  2e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0445129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2992  molybdopterin binding domain-containing protein  51.75 
 
 		 243 aa  224  1e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.091459 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2777  molybdopterin binding domain-containing protein  52.44 
 
 		 253 aa  221  7e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0392  molybdopterin binding domain-containing protein  51.67 
 
 		 255 aa  221  8e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.162299  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2583  molybdopterin binding domain-containing protein  51.75 
 
 		 243 aa  215  5e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.4094  normal  0.993204 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0924  nucleotide-utilizing enzyme/competence-damage associated protein  51.75 
 
 		 243 aa  215  5e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1048  molybdopterin binding domain-containing protein  47.54 
 
 		 260 aa  214  8e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.279267 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2467  molybdopterin binding domain-containing protein  55.67 
 
 		 240 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0258396 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0283  molybdopterin binding domain-containing protein  47.66 
 
 		 242 aa  208  5e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.198181 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0839  molybdopterin binding domain-containing protein  48.13 
 
 		 253 aa  207  2e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4834  molybdopterin binding domain-containing protein  47.7 
 
 		 256 aa  204  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1980  molybdopterin binding domain-containing protein  47.76 
 
 		 246 aa  201  9.999999999999999e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.572596 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0399  molybdopterin binding domain  46.41 
 
 		 250 aa  199  3e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0119  molybdenum cofactor biosynthesis protein MogA  51.82 
 
 		 242 aa  188  5.999999999999999e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1546  molybdopterin binding domain-containing protein  44.93 
 
 		 252 aa  177  1e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02400  conserved hypothetical protein  34.8 
 
 		 337 aa  135  8e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3949  molybdopterin binding domain protein  36.84 
 
 		 249 aa  129  3e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0493373  normal  0.0572261 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2081  molybdopterin binding domain-containing protein  35.58 
 
 		 248 aa  119  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.279418  normal  0.0172334 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0288  molybdopterin binding domain protein  37.5 
 
 		 249 aa  118  7e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00336657  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2217  molybdopterin binding domain protein  35.06 
 
 		 250 aa  117  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.132891  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2127  molybdopterin binding domain protein  35.06 
 
 		 250 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.292161  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1720  molybdopterin binding domain-containing protein  34.2 
 
 		 250 aa  115  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1211  molybdopterin binding domain-containing protein  36.89 
 
 		 251 aa  109  4.0000000000000004e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.524109 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0257  molybdopterin binding domain-containing protein  32.35 
 
 		 268 aa  105  5e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.626396  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0136  molybdopterin binding domain-containing protein  36.59 
 
 		 248 aa  104  1e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1810  molybdopterin binding domain-containing protein  39.22 
 
 		 251 aa  103  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000000230071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0108  competence/damage-inducible protein CinA  36.69 
 
 		 391 aa  101  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0265  molybdopterin binding domain protein  37.66 
 
 		 246 aa  100  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3847  molybdopterin binding domain protein  29.05 
 
 		 241 aa  100  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.367452  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0096  competence damage-inducible protein A  35.24 
 
 		 265 aa  99.4  4e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0062  competence damage-inducible protein A  34.12 
 
 		 262 aa  98.6  7e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1180  molybdopterin binding domain protein  33.99 
 
 		 249 aa  98.2  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5003  molybdopterin binding domain-containing protein  32.46 
 
 		 272 aa  98.2  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.92537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1059  molybdopterin binding domain protein  31.84 
 
 		 372 aa  97.4  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0254  molybdopterin binding domain protein  30.93 
 
 		 260 aa  97.8  2e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.373966  normal  0.818293 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1136  competence damage-inducible protein A  32.27 
 
 		 282 aa  96.7  3e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000100005 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1871  competence/damage-inducible protein CinA  35.47 
 
 		 415 aa  96.3  4e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0858152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0932  molybdopterin binding domain protein  32.69 
 
 		 243 aa  95.5  6e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.452634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1894  hypothetical protein  30.73 
 
 		 250 aa  95.1  9e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1568  molybdopterin binding domain  30.73 
 
 		 250 aa  95.1  9e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000557725 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2121  competence damage-inducible protein A  31.93 
 
 		 272 aa  94.4  1e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.240966 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1209  molybdopterin binding domain-containing protein  34.48 
 
 		 257 aa  94.7  1e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.497342  hitchhiker  0.00709222 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0347  competence/damage-inducible protein CinA  34.91 
 
 		 393 aa  94  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.85118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1389  molybdopterin binding domain protein  30.69 
 
 		 228 aa  94  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2338  molybdopterin binding domain protein  28.45 
 
 		 228 aa  93.6  3e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1918  molybdopterin binding domain protein  29.88 
 
 		 248 aa  92.8  4e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1922  molybdopterin binding domain protein  31.56 
 
 		 249 aa  92  7e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2509  competence/damage-inducible protein CinA  36.9 
 
 		 395 aa  92  7e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1079  molybdopterin binding domain protein  29.91 
 
 		 264 aa  92  8e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0044  molybdopterin binding domain protein  33.17 
 
 		 262 aa  91.3  1e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02831  molybdenum cofactor biosynthesis protein  35.4 
 
 		 431 aa  90.5  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2403  competence/damage-inducible protein CinA  35.37 
 
 		 412 aa  90.1  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3614  competence/damage-inducible protein cinA  33.73 
 
 		 408 aa  90.1  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1256  hypothetical protein  34.94 
 
 		 272 aa  89.4  5e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.757696  normal  0.244029 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12894  predicted protein  35.88 
 
 		 403 aa  89.4  5e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.894493  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4097  molybdopterin binding domain-containing protein  34.97 
 
 		 392 aa  89.4  5e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0088  competence damage-inducible protein A  32.43 
 
 		 271 aa  89  6e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.747767  normal  0.181951 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1084  molybdopterin binding domain  33.13 
 
 		 272 aa  89  7e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.444245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3752  competence/damage-inducible protein CinA  33.76 
 
 		 408 aa  88.2  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3304  competence/damage-inducible protein CinA  34.34 
 
 		 432 aa  88.2  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.102145  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1363  molybdopterin binding domain-containing protein  30.72 
 
 		 248 aa  87  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2333  molybdopterin binding domain protein  29.15 
 
 		 230 aa  87.4  2e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.651571 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1497  competence/damage-inducible protein cinA  32.97 
 
 		 427 aa  87.4  2e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.931703 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3424  molybdopterin binding domain-containing protein  33.77 
 
 		 254 aa  87  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000022543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2060  molybdopterin binding domain-containing protein  33.73 
 
 		 273 aa  86.7  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3683  competence/damage-inducible protein CinA  33.12 
 
 		 408 aa  86.7  3e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.954377  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1176  molybdopterin binding domain protein  33.13 
 
 		 272 aa  87  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02801  molybdenum cofactor biosynthesis protein  28.57 
 
 		 424 aa  86.3  4e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.441283  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0259  competence/damage-inducible protein cinA  28.02 
 
 		 424 aa  86.3  4e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2617  molybdopterin binding domain  34.73 
 
 		 278 aa  86.3  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00272212  normal  0.647979 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2180  competence/damage-inducible protein CinA  35.98 
 
 		 423 aa  85.9  6e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.324051  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1483  molybdopterin binding domain-containing protein  33.93 
 
 		 277 aa  85.5  7e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0916482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0255  competence/damage-inducible protein cinA  31.14 
 
 		 419 aa  85.5  7e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02791  molybdenum cofactor biosynthesis protein  27.47 
 
 		 424 aa  85.5  7e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1256  molybdopterin binding domain-containing protein  34.36 
 
 		 287 aa  85.1  8e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0896823  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>