35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2618 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_2618  phosphatidylcholine synthase  100 
 
 		 244 aa  474  1e-133  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.302309  normal  0.648955 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2630  phosphatidylcholine synthase  74.18 
 
 		 244 aa  343  1e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.11384  decreased coverage  0.0000345218 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2842  phosphatidylcholine synthase  73.11 
 
 		 247 aa  343  2e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.172075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2947  Phosphatidylcholine synthase  73.36 
 
 		 244 aa  329  3e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1506  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  70.2 
 
 		 244 aa  321  7e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0866377 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2046  phosphatidylcholine synthase  73.66 
 
 		 244 aa  311  4.999999999999999e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.268593  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4148  CDP-diacylglycerol-choline O-phosphatidyltransferase  70.71 
 
 		 244 aa  308  4e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.781675 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0817  phosphatidylcholine synthase  43.61 
 
 		 253 aa  209  2e-53  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.179519  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1695  CDP-diacylglycerol-choline O-phosphatidyltransferase  44.78 
 
 		 243 aa  204  1e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.34018  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0538  phosphatidylcholine synthase  42.41 
 
 		 270 aa  188  8e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0572  phosphatidylcholine synthase  42.41 
 
 		 266 aa  187  1e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.731145  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1420  phosphatidylcholine synthase  41.99 
 
 		 241 aa  187  2e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.206675  normal  0.0327839 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3634  phosphatidylcholine synthase  41.96 
 
 		 287 aa  186  3e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1714  Phosphatidylcholine synthase  45.73 
 
 		 242 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1898  Phosphatidylcholine synthase  45.73 
 
 		 242 aa  176  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.35457 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0811  phosphatidylcholine synthase  44.67 
 
 		 230 aa  172  5e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2165  phosphatidylcholine synthase  42.79 
 
 		 241 aa  171  1e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0811902  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0497  phosphatidylcholine synthase  51.4 
 
 		 232 aa  169  4e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.186684  normal  0.666159 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0565  CDP-diacylglycerol-choline O-phosphatidyltransferase  51.96 
 
 		 238 aa  166  2e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.114502  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2217  phosphatidylcholine synthase  51.96 
 
 		 238 aa  166  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.952452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2382  CDP-diacylglycerol-choline O-phosphatidyltransferase  46.77 
 
 		 230 aa  161  1e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.908281  normal  0.773407 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1000  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  39.79 
 
 		 239 aa  143  3e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.399609  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0866  phosphatidylcholine synthase  39.79 
 
 		 239 aa  143  3e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0969943  normal  0.700495 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2093  CDP-diacylglycerol-choline O-phosphatidyltransferase  42.16 
 
 		 249 aa  142  4e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.112953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1254  hypothetical protein  41.09 
 
 		 236 aa  142  5e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1029  CDP-diacylglycerol-choline O-phosphatidyltransferase  41.07 
 
 		 243 aa  142  6e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1484  phosphatidylcholine synthase  38.4 
 
 		 254 aa  134  9e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14110  phosphatidylserine synthase  40.59 
 
 		 238 aa  128  9.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000253182  normal  0.0748452 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3554  CDP-diacylglycerol-choline O-phosphatidyltransferase  41.12 
 
 		 254 aa  120  3e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.130481 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0254  phosphatidyltransferase  30.95 
 
 		 234 aa  110  2.0000000000000002e-23  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4045  CDP-diacylglycerol-cholineO-phosphatidyl transferase  37.07 
 
 		 267 aa  105  5e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.103023  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1441  hypothetical protein  28.76 
 
 		 255 aa  101  9e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1542  hypothetical protein  28.76 
 
 		 255 aa  101  9e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0272  CDP-diacylglycerol-choline O-phosphatidyltransferase  36.59 
 
 		 256 aa  91.7  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.827677  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1145  phosphatidylcholine synthase  31.15 
 
 		 236 aa  87.4  2e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>