137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1517 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1517  flagellar basal body rod protein FlgB  100 
 
 		 136 aa  280  7.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0183705  normal  0.774595 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4411  flagellar basal body rod protein FlgB  79.41 
 
 		 135 aa  225  1e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.420287  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3777  flagellar basal body rod protein FlgB  73.53 
 
 		 145 aa  218  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0109555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1693  flagellar basal body rod protein FlgB  66.91 
 
 		 136 aa  201  4e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.235256  normal  0.633905 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1392  flagellar basal body rod protein FlgB  67.65 
 
 		 135 aa  190  7e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.154079  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5497  flagellar basal body rod protein FlgB  70.59 
 
 		 135 aa  190  7e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0469396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1132  flagellar basal body rod protein FlgB  62.5 
 
 		 135 aa  172  9.999999999999999e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5538  flagellar basal body rod protein FlgB  51.85 
 
 		 134 aa  145  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.407776  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2235  flagellar basal body rod protein FlgB  53.68 
 
 		 133 aa  140  5e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5155  flagellar basal body rod protein FlgB  52.94 
 
 		 133 aa  140  8e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.18507  normal  0.0554322 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2608  flagellar basal body rod protein FlgB  47.48 
 
 		 138 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0696754  normal  0.269497 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2638  flagellar basal body rod protein FlgB  47.83 
 
 		 138 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.164325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2831  flagellar basal body rod protein FlgB  47.48 
 
 		 138 aa  126  8.000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0664971  normal  0.159517 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2570  flagellar basal-body rod protein FlgB  37.93 
 
 		 142 aa  100  8e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.15376 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1938  flagellar basal-body rod protein FlgB  34.51 
 
 		 150 aa  87.4  6e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.276304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1366  flagellar basal body rod protein FlgB  37.12 
 
 		 139 aa  86.3  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1576  flagellar basal body rod protein FlgB  36.07 
 
 		 137 aa  66.2  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2110  flagellar basal body rod protein FlgB  31.9 
 
 		 129 aa  64.7  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.132503 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4122  flagellar basal-body rod protein FlgB  32.82 
 
 		 133 aa  62.4  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.271092  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0846  hypothetical protein  34.71 
 
 		 138 aa  60.5  0.000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1978  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.66 
 
 		 139 aa  59.3  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2826  flagellar basal-body rod protein FlgB  28.68 
 
 		 152 aa  58.5  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3437  putative flagellar basal-body rod protein FlgB  29.13 
 
 		 139 aa  58.2  0.00000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3247  flagellar basal body rod protein FlgB  30.88 
 
 		 126 aa  57.8  0.00000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.896474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0266  flagellar basal-body rod protein FlgB  32.5 
 
 		 137 aa  57.4  0.00000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3925  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.99 
 
 		 139 aa  57.4  0.00000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0660618 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2600  flagellar basal body rod protein FlgB  32.46 
 
 		 127 aa  57  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000530741 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0342  flagellar basal-body rod protein FlgB  32.87 
 
 		 165 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.395119  normal  0.980929 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2284  flagellar basal body rod protein FlgB  31.54 
 
 		 136 aa  56.2  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0749  flagellar basal-body rod protein FlgB  32.03 
 
 		 135 aa  56.2  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0768  flagellar basal-body rod protein FlgB  27.69 
 
 		 132 aa  55.8  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00183103 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2176  flagellar basal-body rod protein FlgB  28.03 
 
 		 133 aa  56.2  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.873568  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1195  flagellar basal-body rod protein FlgB  31.54 
 
 		 141 aa  55.5  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1768  flagellar basal-body rod protein FlgB  31.25 
 
 		 132 aa  55.1  0.0000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.144654  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3841  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.28 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2924  flagellar basal-body rod protein FlgB  32.03 
 
 		 134 aa  54.3  0.0000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16920  flagellar basal-body rod protein FlgB  28.91 
 
 		 131 aa  54.3  0.0000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3656  flagellar basal body rod protein FlgB  30.53 
 
 		 126 aa  53.9  0.0000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.306825  normal  0.434285 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2134  flagellar basal body protein-like protein  30 
 
 		 126 aa  53.5  0.0000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1954  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.3 
 
 		 131 aa  53.1  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3714  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.28 
 
 		 151 aa  52.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.202019 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2665  flagellar basal body rod protein FlgB  32.23 
 
 		 136 aa  52.4  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2992  flagellar basal body rod protein FlgB  33.61 
 
 		 127 aa  52.4  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4791  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.28 
 
 		 151 aa  52.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.301769 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3307  flagellar basal-body rod protein FlgB  28 
 
 		 146 aa  52.4  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2047  flagellar basal-body rod protein FlgB  31.62 
 
 		 133 aa  52.8  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1331  flagellar basal body rod protein FlgB  33.61 
 
 		 127 aa  51.6  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.754656  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4198  flagellar basal body rod protein FlgB  31.93 
 
 		 117 aa  51.2  0.000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0356  flagellar basal body rod protein FlgB  29.31 
 
 		 155 aa  49.7  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1655  flagellar basal-body rod protein FlgB  33.63 
 
 		 118 aa  50.1  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0922245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1094  flagellar basal body rod protein FlgB  26.85 
 
 		 125 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.376721 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4216  flagellar basal-body rod protein FlgB  29.08 
 
 		 140 aa  49.7  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1217  flagellar basal-body rod protein FlgB  32.23 
 
 		 130 aa  48.5  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.284991  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000740  flagellar basal-body rod protein FlgB  28.69 
 
 		 120 aa  48.5  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0685  flagellar basal-body rod protein FlgB  28.95 
 
 		 134 aa  48.5  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2000  flagellar basal body rod protein FlgB  31.3 
 
 		 129 aa  47.8  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0024  flagellar basal body rod protein FlgB  32.65 
 
 		 126 aa  47  0.00009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0838  flagellar basal-body rod protein  30.16 
 
 		 125 aa  47  0.00009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1647  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.16 
 
 		 116 aa  47  0.00009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.938182  normal  0.173322 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2965  flagellar basal body rod protein FlgB  25 
 
 		 129 aa  46.6  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.157354 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3423  flagellar basal-body rod protein FlgB  29.17 
 
 		 140 aa  46.6  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3073  flagellar basal body protein  30.7 
 
 		 150 aa  46.6  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.179869 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0317  flagellar basal body rod protein FlgB  30.36 
 
 		 130 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.763946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3578  flagellar basal-body rod protein FlgB  28.93 
 
 		 117 aa  46.2  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2734  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.7 
 
 		 134 aa  46.2  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000288784 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1525  flagellar basal-body rod protein FlgB  32.38 
 
 		 137 aa  45.8  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1474  flagellar basal-body rod protein FlgB  31.67 
 
 		 133 aa  45.4  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1674  flagellar basal-body rod protein FlgB  32.73 
 
 		 144 aa  45.4  0.0003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0255  flagellar basal body rod protein FlgB  32.38 
 
 		 126 aa  45.1  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3673  flagellar basal body rod protein FlgB  28.71 
 
 		 127 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00533118 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0629  flagellar basal body rod protein FlgB  29.82 
 
 		 129 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.148561 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1321  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.77 
 
 		 134 aa  44.7  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04909  flagellar basal body rod protein FlgB  27.05 
 
 		 120 aa  44.7  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0618  flagellar basal body rod protein FlgB  29.82 
 
 		 129 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0896138  normal  0.0941281 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1560  flagellar basal body rod protein FlgB  23.66 
 
 		 135 aa  44.7  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1340  flagellar basal-body rod protein FlgB  31.58 
 
 		 134 aa  44.3  0.0006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00164532  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0427  flagellar basal-body rod protein FlgB  32.17 
 
 		 144 aa  44.3  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.707859  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0151  flagellar basal body rod protein FlgB  31.13 
 
 		 126 aa  43.9  0.0007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2411  flagellar basal-body rod protein FlgB  26.47 
 
 		 132 aa  43.9  0.0007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2850  flagellar basal body rod protein FlgB  27.41 
 
 		 135 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.115651 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0069  flagellar basal body rod protein FlgB  28.57 
 
 		 116 aa  43.9  0.0008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0349  flagellar basal body rod protein FlgB  32.46 
 
 		 130 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0740426 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24000  flagellar basal-body rod protein  30.95 
 
 		 136 aa  43.5  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1144  flagellar basal body rod protein FlgB  34.41 
 
 		 128 aa  43.5  0.001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0520  flagellar basal-body rod protein FlgB  30 
 
 		 135 aa  43.1  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.223496  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3468  flagellar basal body rod protein FlgB  27.01 
 
 		 116 aa  43.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4212  flagellar basal body rod protein FlgB  31.58 
 
 		 126 aa  43.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0735  flagellar basal body rod protein FlgB  29.46 
 
 		 130 aa  43.5  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01013  flagellar basal body rod protein FlgB  30.25 
 
 		 117 aa  43.1  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.648482  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06153  flagellar basal body rod protein FlgB  30.25 
 
 		 117 aa  43.1  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000283374  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1557  flagellar basal body rod protein FlgB  25 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.371547  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1531  flagellar basal body rod protein FlgB  24.22 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.124492  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1520  flagellar basal body rod protein FlgB  24.22 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1674  flagellar basal body rod protein FlgB  25 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1709  flagellar basal body rod protein FlgB  24.22 
 
 		 135 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2213  GTP-binding protein LepA  25.87 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3636  flagellar basal body rod protein FlgB  24.22 
 
 		 135 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3583  flagellar basal-body rod protein FlgB  25.53 
 
 		 130 aa  42.4  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0676749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1645  flagellar basal-body rod protein FlgB  25.98 
 
 		 122 aa  42.7  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000413162  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1906  flagellar basal body rod protein FlgB  27.97 
 
 		 131 aa  42.4  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.179452 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>