More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0894 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1722  beta alanine--pyruvate transaminase  77.85 
 
 		 447 aa  737    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.899211  normal  0.216023 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2537  beta alanine--pyruvate transaminase  74.5 
 
 		 445 aa  709    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.664901 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1370  beta alanine--pyruvate transaminase  81.03 
 
 		 448 aa  761    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.424959  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2299  beta alanine--pyruvate transaminase  67.89 
 
 		 453 aa  640    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.104405 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1184  beta alanine--pyruvate transaminase  79.91 
 
 		 448 aa  740    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0905648 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0894  beta alanine--pyruvate transaminase  100 
 
 		 447 aa  916    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1288  beta alanine--pyruvate transaminase  81.25 
 
 		 448 aa  749    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.313039 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3157  beta alanine--pyruvate transaminase  78.52 
 
 		 445 aa  743    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.381748  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1242  beta alanine--pyruvate transaminase  68.23 
 
 		 444 aa  604  1.0000000000000001e-171  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.407775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3237  beta alanine--pyruvate transaminase  66.9 
 
 		 451 aa  588  1e-167  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.786147  normal  0.54766 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4458  beta alanine--pyruvate transaminase  67.59 
 
 		 451 aa  586  1e-166  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.461411  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0278  beta alanine--pyruvate transaminase  63.3 
 
 		 442 aa  578  1e-164  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.534691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6089  omega amino acid--pyruvate transaminase  60.23 
 
 		 444 aa  565  1e-160  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70160  omega amino acid--pyruvate transaminase  60.97 
 
 		 444 aa  566  1e-160  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2042  beta alanine--pyruvate transaminase  58.99 
 
 		 441 aa  548  1e-154  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0229  beta alanine--pyruvate transaminase  59.54 
 
 		 437 aa  544  1e-153  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.946492  normal  0.224107 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3898  beta alanine--pyruvate transaminase  58.45 
 
 		 444 aa  544  1e-153  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2709  beta alanine--pyruvate transaminase  57.3 
 
 		 443 aa  539  9.999999999999999e-153  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0655117  normal  0.245576 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2317  omega amino acid--pyruvate transaminase  58.06 
 
 		 442 aa  535  1e-151  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.414372  normal  0.544021 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1898  beta alanine--pyruvate transaminase  57.77 
 
 		 435 aa  536  1e-151  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.422888  normal  0.144142 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3287  omega amino acid--pyruvate transaminase  57.04 
 
 		 445 aa  536  1e-151  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1366  beta alanine--pyruvate transaminase  58.76 
 
 		 441 aa  531  1e-150  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.528214 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2828  omega amino acid--pyruvate transaminase  57.24 
 
 		 441 aa  533  1e-150  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0375615  normal  0.107326 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3097  omega amino acid--pyruvate transaminase  56.78 
 
 		 441 aa  529  1e-149  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.495008 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00471  beta alanine--pyruvate transaminase  55.16 
 
 		 450 aa  528  1e-148  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.113548  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2649  beta alanine--pyruvate transaminase  57.72 
 
 		 446 aa  525  1e-148  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.297249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1078  beta alanine--pyruvate transaminase  59.23 
 
 		 444 aa  522  1e-147  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1084  beta alanine--pyruvate transaminase  57.62 
 
 		 445 aa  523  1e-147  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000566845  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2927  beta alanine--pyruvate transaminase  58.8 
 
 		 446 aa  524  1e-147  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.162261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3203  beta alanine--pyruvate transaminase  58.56 
 
 		 454 aa  520  1e-146  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3410  beta alanine--pyruvate transaminase  57.74 
 
 		 441 aa  519  1e-146  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3497  beta alanine--pyruvate transaminase  57.47 
 
 		 446 aa  520  1e-146  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1186  beta alanine--pyruvate transaminase  58.56 
 
 		 454 aa  520  1e-146  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0383535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1092  beta alanine--pyruvate transaminase  58.33 
 
 		 454 aa  518  1e-146  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00103831  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1152  beta alanine--pyruvate transaminase  58.33 
 
 		 454 aa  520  1e-146  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0463634  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3009  beta alanine--pyruvate transaminase  58.1 
 
 		 446 aa  518  1e-146  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00260047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3106  beta alanine--pyruvate transaminase  58.56 
 
 		 446 aa  520  1e-146  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.319419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0936  beta alanine--pyruvate transaminase  58.33 
 
 		 446 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0125442  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3162  beta alanine--pyruvate transaminase  57.66 
 
 		 445 aa  515  1.0000000000000001e-145  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4468  beta alanine--pyruvate transaminase  57.6 
 
 		 442 aa  511  1e-144  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.59935 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3022  beta alanine--pyruvate transaminase  57.34 
 
 		 450 aa  513  1e-144  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1742  beta alanine--pyruvate transaminase  57.41 
 
 		 441 aa  514  1e-144  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000372034 
 
 
-
 
NC_003296  RS02393  beta alanine--pyruvate transaminase  58.94 
 
 		 445 aa  509  1e-143  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.824942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1505  omega amino acid--pyruvate transaminase  57.34 
 
 		 442 aa  509  1e-143  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.151073  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2175  omega amino acid--pyruvate transaminase  56.88 
 
 		 442 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3126  omega amino acid--pyruvate transaminase  57.31 
 
 		 442 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0765  beta alanine--pyruvate transaminase  55.66 
 
 		 445 aa  507  9.999999999999999e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2046  omega amino acid--pyruvate transaminase  56.88 
 
 		 442 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.374094  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3101  omega amino acid--pyruvate transaminase  56.88 
 
 		 442 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2481  omega amino acid--pyruvate transaminase  56.78 
 
 		 442 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0734  omega amino acid--pyruvate transaminase  56.88 
 
 		 442 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2567  omega amino acid--pyruvate transaminase  56.88 
 
 		 442 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.291742  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3868  beta alanine--pyruvate transaminase  56.06 
 
 		 445 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0248  beta alanine--pyruvate transaminase  56.36 
 
 		 443 aa  504  1e-141  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0670  beta alanine--pyruvate transaminase  57.44 
 
 		 442 aa  503  1e-141  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4383  beta alanine--pyruvate transaminase  58.03 
 
 		 445 aa  502  1e-141  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.488386  normal  0.439586 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4273  beta alanine--pyruvate transaminase  58.03 
 
 		 445 aa  502  1e-141  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0078691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4340  beta alanine--pyruvate transaminase  56.75 
 
 		 442 aa  502  1e-141  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.525424 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3065  omega amino acid--pyruvate transaminase  56.65 
 
 		 442 aa  504  1e-141  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.786576  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3957  beta alanine--pyruvate transaminase  56.35 
 
 		 444 aa  502  1e-141  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.25217  normal  0.625415 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0966  beta alanine--pyruvate transaminase  59.49 
 
 		 446 aa  496  1e-139  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0569565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1044  beta alanine--pyruvate transaminase  57.4 
 
 		 445 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00442858  normal  0.786011 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1329  beta alanine--pyruvate transaminase  58.18 
 
 		 450 aa  491  1e-137  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.759246  normal  0.141438 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1122  beta alanine--pyruvate transaminase  55.43 
 
 		 438 aa  489  1e-137  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.456667  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1456  beta alanine--pyruvate transaminase  55.07 
 
 		 445 aa  486  1e-136  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.736746  normal  0.822879 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1294  beta alanine--pyruvate transaminase  55.07 
 
 		 445 aa  486  1e-136  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.341909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1114  beta alanine--pyruvate transaminase  58.33 
 
 		 445 aa  487  1e-136  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00127194  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4833  beta alanine--pyruvate transaminase  52.67 
 
 		 444 aa  483  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.318992  normal  0.116227 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1442  beta alanine--pyruvate transaminase  53.44 
 
 		 442 aa  481  1e-135  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0205  beta alanine--pyruvate transaminase  56.36 
 
 		 443 aa  482  1e-135  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0926  beta alanine--pyruvate transaminase  52.99 
 
 		 442 aa  479  1e-134  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4783  beta alanine--pyruvate transaminase  51.78 
 
 		 444 aa  476  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.948331  normal  0.0649173 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4248  aminotransferase class-III  52.36 
 
 		 438 aa  477  1e-133  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7631  omega amino acid--pyruvate transaminase  52.87 
 
 		 445 aa  449  1e-125  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.356992 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4788  aminotransferase class-III  51.61 
 
 		 444 aa  446  1.0000000000000001e-124  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.359193  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0868  beta alanine--pyruvate transaminase  49.22 
 
 		 413 aa  439  9.999999999999999e-123  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.124838  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1964  beta alanine--pyruvate transaminase  49.1 
 
 		 441 aa  439  9.999999999999999e-123  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4203  beta alanine--pyruvate transaminase  50.81 
 
 		 452 aa  432  1e-120  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.152237 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4059  beta alanine--pyruvate transaminase  49.66 
 
 		 447 aa  432  1e-120  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3729  beta alanine--pyruvate transaminase  50.81 
 
 		 452 aa  432  1e-120  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4294  beta alanine--pyruvate transaminase  50.58 
 
 		 452 aa  429  1e-119  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.4783 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4437  beta alanine--pyruvate transaminase  50.23 
 
 		 453 aa  428  1e-119  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0945399  normal  0.140435 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3204  beta alanine--pyruvate transaminase  50.58 
 
 		 451 aa  428  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.141001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4039  beta alanine--pyruvate transaminase  49.78 
 
 		 449 aa  427  1e-118  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1698  beta alanine--pyruvate transaminase  50.35 
 
 		 451 aa  427  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4313  beta alanine--pyruvate transaminase  50.58 
 
 		 451 aa  428  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0156  beta alanine--pyruvate transaminase  50 
 
 		 466 aa  426  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.122523  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0494  beta alanine--pyruvate transaminase  50 
 
 		 466 aa  426  1e-118  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0789505  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4053  beta alanine--pyruvate transaminase  50.58 
 
 		 451 aa  428  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1096  beta alanine--pyruvate transaminase  50 
 
 		 466 aa  425  1e-118  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.414552  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1454  beta alanine--pyruvate transaminase  50 
 
 		 466 aa  426  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1380  beta alanine--pyruvate transaminase  50 
 
 		 451 aa  425  1e-117  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.308177  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2318  beta alanine--pyruvate transaminase  49.78 
 
 		 503 aa  424  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1658  beta alanine--pyruvate transaminase  49.78 
 
 		 503 aa  424  1e-117  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.194845  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1009  beta alanine--pyruvate transaminase  50 
 
 		 466 aa  424  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6274  omega amino acid--pyruvate transaminase  50.46 
 
 		 447 aa  419  1e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0607  beta alanine--pyruvate transaminase  52.29 
 
 		 446 aa  421  1e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2367  aminotransferase class-III  51.36 
 
 		 477 aa  421  1e-116  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1578  beta alanine--pyruvate transaminase  49.66 
 
 		 451 aa  419  1e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1541  beta alanine--pyruvate transaminase  50.8 
 
 		 447 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0541648  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>