35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3579 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3579  hypothetical protein  100 
 
 		 153 aa  307  2.9999999999999997e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0597646  normal  0.630321 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1987  hypothetical protein  87.58 
 
 		 153 aa  278  2e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.64403  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7095  hypothetical protein  72.44 
 
 		 159 aa  238  2e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.141009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2822  hypothetical protein  45.89 
 
 		 162 aa  134  7.000000000000001e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.779408  normal  0.185946 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1562  hypothetical protein  40.4 
 
 		 180 aa  130  7.999999999999999e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1721  hypothetical protein  42.36 
 
 		 178 aa  129  1.0000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0281  hypothetical protein  43.75 
 
 		 158 aa  129  2.0000000000000002e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.721924  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2212  hypothetical protein  42.07 
 
 		 158 aa  127  8.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.894625  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0299  hypothetical protein  44.26 
 
 		 154 aa  121  3e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000250454 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2986  hypothetical protein  39.73 
 
 		 180 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000138173  normal  0.0479849 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2282  hypothetical protein  42.66 
 
 		 166 aa  114  6e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6173  hypothetical protein  38.35 
 
 		 151 aa  112  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.226286 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0801  hypothetical protein  40.85 
 
 		 158 aa  112  1.0000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.647534  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1996  hypothetical protein  40.97 
 
 		 181 aa  111  4.0000000000000004e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2237  hypothetical protein  40.31 
 
 		 151 aa  106  1e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6460  hypothetical protein  34.64 
 
 		 175 aa  102  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4624  hypothetical protein  33.56 
 
 		 156 aa  87.8  5e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0533139 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2877  hypothetical protein  34.67 
 
 		 165 aa  79  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3838  hypothetical protein  30 
 
 		 152 aa  78.6  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.909163 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1647  hypothetical protein  31.33 
 
 		 152 aa  76.3  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.152626  normal  0.355337 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5091  hypothetical protein  33.77 
 
 		 157 aa  75.1  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3181  hypothetical protein  31.85 
 
 		 178 aa  72.4  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1791  hypothetical protein  33.63 
 
 		 151 aa  64.7  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00490564  normal  0.234102 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3974  hypothetical protein  32.38 
 
 		 160 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.096944  normal  0.0332005 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4034  hypothetical protein  32.38 
 
 		 160 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3960  hypothetical protein  32.38 
 
 		 160 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0040  hypothetical protein  38.75 
 
 		 192 aa  58.5  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1995  hypothetical protein  31.03 
 
 		 172 aa  57.8  0.00000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0016  hypothetical protein  39.51 
 
 		 174 aa  55.5  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.864114  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1655  cellulosome protein dockerin type I  37.97 
 
 		 435 aa  54.7  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000388378  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3575  hypothetical protein  28.91 
 
 		 173 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3346  hypothetical protein  28.91 
 
 		 173 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0203915 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11119  conserved hypothetical protein  24.38 
 
 		 399 aa  48.5  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0732122  normal  0.0501614 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7096  hypothetical protein  29.66 
 
 		 172 aa  47  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2232  hypothetical protein  25.89 
 
 		 157 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>