26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3326 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3326  hypothetical protein  100 
 
 		 211 aa  409  1e-113  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.321018 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2263  putative exported protein of unknown function  64.15 
 
 		 199 aa  201  8e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2116  hypothetical protein  68.52 
 
 		 210 aa  184  9e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0278262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2337  hypothetical protein  55.61 
 
 		 192 aa  179  2.9999999999999997e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3231  hypothetical protein  64.77 
 
 		 185 aa  177  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.114974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2714  hypothetical protein  53.68 
 
 		 196 aa  173  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6040  hypothetical protein  55.44 
 
 		 205 aa  139  3e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.152767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2997  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  48.68 
 
 		 179 aa  104  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.388571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1368  hypothetical protein  52.68 
 
 		 170 aa  100  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3214  hypothetical protein  45.35 
 
 		 221 aa  92  5e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5590  hypothetical protein  50.7 
 
 		 177 aa  92  6e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.386943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2839  hypothetical protein  43.42 
 
 		 165 aa  90.9  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1388  hypothetical protein  50.91 
 
 		 209 aa  90.1  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.610976 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0739  hypothetical protein  35.76 
 
 		 183 aa  81.6  0.000000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.371354  normal  0.125366 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3124  hypothetical protein  35.1 
 
 		 155 aa  68.6  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0921  hypothetical protein  32.43 
 
 		 152 aa  65.5  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.38389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4116  hypothetical protein  33.96 
 
 		 219 aa  58.9  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.252565  normal  0.544851 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2938  hypothetical protein  38.46 
 
 		 280 aa  57  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.796058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2343  hypothetical protein  39.42 
 
 		 241 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.400558 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3157  hypothetical protein  38.24 
 
 		 199 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2943  hypothetical protein  31.76 
 
 		 152 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.61221 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1695  hypothetical protein  31.73 
 
 		 162 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.307378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1811  hypothetical protein  32.62 
 
 		 218 aa  46.6  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.603279  normal  0.334623 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2676  hypothetical protein  30.97 
 
 		 217 aa  45.1  0.0009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4888  hypothetical protein  34.38 
 
 		 106 aa  43.9  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.503138  normal  0.689634 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1533  hypothetical protein  31.54 
 
 		 178 aa  42.4  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.914411 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>