More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3193 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009668  Oant_3052  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  75.93 
 
 		 497 aa  735    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0432  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  74.64 
 
 		 494 aa  732    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.401755  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1289  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  77.48 
 
 		 497 aa  755    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0121805  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2495  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  94.78 
 
 		 498 aa  949    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0352  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  74.9 
 
 		 497 aa  722    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.258005  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3166  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  75.83 
 
 		 496 aa  749    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.224874  normal  0.708004 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0405  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  70.89 
 
 		 485 aa  695    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0548973 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1194  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  70.96 
 
 		 499 aa  667    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0718304  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2146  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  89.13 
 
 		 498 aa  908    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0341  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  72.14 
 
 		 499 aa  728    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0084  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  76.03 
 
 		 497 aa  756    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1646  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  66.26 
 
 		 484 aa  650    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.536649  hitchhiker  0.0000000511927 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3123  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  76.36 
 
 		 510 aa  743    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0244  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  68.57 
 
 		 487 aa  654    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.20132  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5770  inosine-5`-monophosphate dehydrogenase  72.58 
 
 		 532 aa  702    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3193  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  100 
 
 		 498 aa  1002    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.291902  normal  0.962231 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1752  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  68.94 
 
 		 500 aa  666    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.151769  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1982  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  65.64 
 
 		 482 aa  646    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.311927  normal  0.313546 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3071  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  89.36 
 
 		 497 aa  899    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.303181  normal  0.0977004 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0379  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  74.39 
 
 		 500 aa  735    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2264  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  93.78 
 
 		 498 aa  955    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.334086 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1328  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  72.54 
 
 		 496 aa  743    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2546  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  88.96 
 
 		 498 aa  908    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.509974  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1168  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  75 
 
 		 486 aa  741    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.249665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1027  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  71.84 
 
 		 485 aa  703    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0467  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  75.36 
 
 		 500 aa  721    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.132943  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0477  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  74.23 
 
 		 494 aa  724    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.578734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0968  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  76.57 
 
 		 497 aa  770    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.242284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3610  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  91.63 
 
 		 495 aa  912    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.899725  normal  0.0328127 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1923  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  73.88 
 
 		 496 aa  749    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1175  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  68.58 
 
 		 489 aa  687    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.654831  normal  0.725895 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2213  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  67.14 
 
 		 487 aa  679    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.6099  normal  0.441831 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2939  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  75.83 
 
 		 496 aa  749    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.27006 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0319  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  75.1 
 
 		 497 aa  724    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0040  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  65.23 
 
 		 500 aa  650    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.116515  normal  0.0387479 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3122  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  75.62 
 
 		 496 aa  750    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.698548 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1224  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  66.67 
 
 		 482 aa  628  1e-179  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.717892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0592  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  65.43 
 
 		 482 aa  629  1e-179  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1152  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  65.84 
 
 		 482 aa  627  1e-178  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.859407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2868  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  65.43 
 
 		 482 aa  626  1e-178  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.419057  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1514  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  65.43 
 
 		 482 aa  626  1e-178  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.339989  normal  0.154254 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1217  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  60.46 
 
 		 491 aa  595  1e-169  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0529  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  60.33 
 
 		 487 aa  590  1e-167  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1429  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  59.51 
 
 		 487 aa  585  1e-166  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0657932  normal  0.0240553 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1314  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  59.43 
 
 		 486 aa  587  1e-166  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1141  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  59.43 
 
 		 486 aa  585  1e-166  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.144187 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1461  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  59.51 
 
 		 487 aa  586  1e-166  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.296416 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1200  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  59.21 
 
 		 492 aa  585  1e-166  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1688  hypothetical protein  58.93 
 
 		 490 aa  581  1.0000000000000001e-165  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1856  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  59.1 
 
 		 487 aa  583  1.0000000000000001e-165  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0224  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  58.88 
 
 		 485 aa  583  1.0000000000000001e-165  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.218435  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0116  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  57.03 
 
 		 508 aa  581  1.0000000000000001e-165  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000189991  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1459  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  59.27 
 
 		 556 aa  583  1.0000000000000001e-165  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.439962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1706  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  60.04 
 
 		 486 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2623  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  59.71 
 
 		 487 aa  584  1.0000000000000001e-165  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1370  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  59.51 
 
 		 487 aa  579  1e-164  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.810739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1306  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  59.51 
 
 		 487 aa  578  1e-164  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.24376  normal  0.894393 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1423  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  60.94 
 
 		 487 aa  578  1e-164  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1687  hypothetical protein  58.93 
 
 		 490 aa  581  1e-164  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2338  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  59.02 
 
 		 487 aa  580  1e-164  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.879992  normal  0.100057 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0784  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  58.26 
 
 		 485 aa  580  1e-164  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0613  IMP dehydrogenase  58.81 
 
 		 486 aa  581  1e-164  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000830235  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2293  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  58.97 
 
 		 491 aa  581  1e-164  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.711267  normal  0.709548 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1200  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  58.4 
 
 		 486 aa  578  1e-164  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.608786  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2349  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  59.75 
 
 		 487 aa  579  1e-164  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.163967  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1520  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  59.54 
 
 		 487 aa  578  1e-164  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0307442  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1639  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  56.91 
 
 		 488 aa  580  1e-164  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0762082  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1615  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  59.75 
 
 		 487 aa  579  1e-164  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2195  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  59.18 
 
 		 491 aa  577  1.0000000000000001e-163  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5301  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  58.81 
 
 		 486 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.446018  normal  0.148731 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1893  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  58.81 
 
 		 486 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0489208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1260  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  56.97 
 
 		 499 aa  575  1.0000000000000001e-163  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.334206 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2122  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  58.39 
 
 		 491 aa  575  1.0000000000000001e-163  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100541 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3015  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  59.84 
 
 		 488 aa  575  1.0000000000000001e-163  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2431  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  59.43 
 
 		 486 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.171445 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0500  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  60 
 
 		 490 aa  573  1.0000000000000001e-162  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6086  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  58.81 
 
 		 486 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2011  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  58.61 
 
 		 486 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.438138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2024  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  58.61 
 
 		 486 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.363824  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1991  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  58.81 
 
 		 486 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.287012  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2457  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  58.61 
 
 		 486 aa  569  1e-161  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195801  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1524  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  58.61 
 
 		 486 aa  569  1e-161  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.048391  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2549  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  58.61 
 
 		 486 aa  569  1e-161  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.425317  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2024  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  58.61 
 
 		 486 aa  569  1e-161  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.637626  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1295  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  58.61 
 
 		 486 aa  569  1e-161  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2056  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  58.61 
 
 		 486 aa  568  1e-161  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3486  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  59.39 
 
 		 489 aa  569  1e-161  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3120  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  58.37 
 
 		 489 aa  570  1e-161  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.899033  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2405  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  58.61 
 
 		 486 aa  569  1e-161  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.323419  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3287  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  58.61 
 
 		 486 aa  569  1e-161  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00821787  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1482  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  57.2 
 
 		 482 aa  565  1e-160  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20480  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  57.29 
 
 		 486 aa  565  1e-160  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000012591  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1886  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  57.02 
 
 		 485 aa  567  1e-160  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1752  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  59.43 
 
 		 486 aa  565  1e-160  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.853386 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0525  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  55.88 
 
 		 481 aa  565  1e-160  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0514  response regulator receiver protein  55.58 
 
 		 484 aa  565  1e-160  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.135977  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1524  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  58.3 
 
 		 487 aa  565  1e-160  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1360  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  58.25 
 
 		 490 aa  561  1.0000000000000001e-159  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1005  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  58.25 
 
 		 490 aa  561  1.0000000000000001e-159  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2011  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  57.41 
 
 		 489 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>