29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2943 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_2943  hypothetical protein  100 
 
 		 152 aa  302  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.61221 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0921  hypothetical protein  90.13 
 
 		 152 aa  273  5e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.38389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3124  hypothetical protein  78.71 
 
 		 155 aa  241  3e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2343  hypothetical protein  38.84 
 
 		 241 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.400558 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3157  hypothetical protein  36.36 
 
 		 199 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2938  hypothetical protein  38.02 
 
 		 280 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.796058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1811  hypothetical protein  33.33 
 
 		 218 aa  74.3  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.603279  normal  0.334623 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4116  hypothetical protein  35 
 
 		 219 aa  71.2  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.252565  normal  0.544851 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0739  hypothetical protein  33.73 
 
 		 183 aa  70.1  0.000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.371354  normal  0.125366 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2839  hypothetical protein  43.3 
 
 		 165 aa  62  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1388  hypothetical protein  42.11 
 
 		 209 aa  61.2  0.000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.610976 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2997  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  40.95 
 
 		 179 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.388571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2714  hypothetical protein  31.97 
 
 		 196 aa  57.4  0.00000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5590  hypothetical protein  37.61 
 
 		 177 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.386943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1368  hypothetical protein  42.31 
 
 		 170 aa  57  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2337  hypothetical protein  31.13 
 
 		 192 aa  53.9  0.0000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1695  hypothetical protein  29.86 
 
 		 162 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.307378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2263  putative exported protein of unknown function  34.51 
 
 		 199 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3231  hypothetical protein  35.56 
 
 		 185 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.114974  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3214  hypothetical protein  38.14 
 
 		 221 aa  50.1  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6040  hypothetical protein  34.34 
 
 		 205 aa  46.2  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.152767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1989  hypothetical protein  26.62 
 
 		 172 aa  43.9  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.181266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2271  hypothetical protein  31.52 
 
 		 171 aa  43.9  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.994316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2116  hypothetical protein  32.29 
 
 		 210 aa  43.9  0.0009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0278262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0023  hypothetical protein  27.12 
 
 		 184 aa  42.7  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5287  hypothetical protein  26.77 
 
 		 125 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3326  hypothetical protein  32.45 
 
 		 211 aa  42.4  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.321018 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0017  hypothetical protein  28.26 
 
 		 189 aa  41.2  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.343432 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5570  hypothetical protein  29.55 
 
 		 95 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>