52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_5001 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_5001  hypothetical protein  100 
 
 		 815 aa  1639    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5448  hypothetical protein  90.72 
 
 		 808 aa  1453    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.592113  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5570  hypothetical protein  84.2 
 
 		 816 aa  1404    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.315496 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7560  hypothetical protein  77.97 
 
 		 811 aa  1233    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.125475  normal  0.437403 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0133  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding protein  27.82 
 
 		 956 aa  70.9  0.00000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.967311  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2777  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  26.12 
 
 		 975 aa  68.9  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4726  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  29.49 
 
 		 959 aa  67.4  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0267018  normal  0.466648 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0623  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  27.89 
 
 		 971 aa  65.5  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.252366  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0607  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  28.17 
 
 		 971 aa  63.9  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0441  PEP-utilising enzyme, mobile region  27.27 
 
 		 963 aa  62  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.299176 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3610  PEP-utilising enzyme, mobile region  26.99 
 
 		 1240 aa  61.6  0.00000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.66232  normal  0.099174 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2432  Pyruvate, water dikinase  31.91 
 
 		 359 aa  60.5  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1818  pyruvate, water dikinase  29.02 
 
 		 788 aa  57.8  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0545713 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  26.02 
 
 		 287 aa  54.3  0.000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0419  phosphoenolpyruvate synthase  25.35 
 
 		 757 aa  53.5  0.00001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0346  phosphoenolpyruvate synthase  24.6 
 
 		 758 aa  52  0.00004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000716638 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25910  putative lipase  27.07 
 
 		 315 aa  51.6  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0600573 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2212  putative lipase  27.07 
 
 		 315 aa  51.6  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.799877  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  23.19 
 
 		 291 aa  50.4  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2598  phosphoenolpyruvate synthase  28.64 
 
 		 785 aa  50.4  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  23.83 
 
 		 290 aa  50.4  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4402  phosphoenolpyruvate synthase  28.7 
 
 		 799 aa  50.8  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1185  pyruvate, water dikinase  26.37 
 
 		 275 aa  50.8  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3057  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  26.78 
 
 		 811 aa  50.1  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0118124  decreased coverage  0.000000211627 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  25.57 
 
 		 286 aa  50.1  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3294  phosphoenolpyruvate synthase  26.54 
 
 		 837 aa  50.1  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2165  phosphoenolpyruvate synthase  28.84 
 
 		 761 aa  49.7  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2065  cyclic nucleotide-binding protein  26.15 
 
 		 462 aa  49.7  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1622  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  23.9 
 
 		 891 aa  49.7  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6941  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  27.78 
 
 		 810 aa  49.3  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.951528  normal  0.75146 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3593  PEP-utilising enzyme, mobile region  22.43 
 
 		 1097 aa  48.9  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0490  phosphoenolpyruvate synthase  23.69 
 
 		 758 aa  48.9  0.0004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5551  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding protein  27.88 
 
 		 826 aa  48.5  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0952263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4990  phosphoenolpyruvate synthase  27.38 
 
 		 765 aa  48.5  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.82613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1801  hypothetical protein  29.1 
 
 		 238 aa  48.5  0.0005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0314686 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1573  phosphoenolpyruvate synthase  23.81 
 
 		 758 aa  47.8  0.0007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0592  phosphoenolpyruvate synthase  26.55 
 
 		 788 aa  47.8  0.0008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.245818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2997  phosphoenolpyruvate synthase  28.46 
 
 		 760 aa  47.8  0.0008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.804311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1509  alpha/beta hydrolase fold  22.83 
 
 		 287 aa  47.8  0.0008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  24.03 
 
 		 291 aa  47.8  0.0009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  24.03 
 
 		 291 aa  47.8  0.0009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  24.03 
 
 		 291 aa  47.8  0.0009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09891  Alpha/beta hydrolase fold  25.89 
 
 		 299 aa  47  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  23.44 
 
 		 301 aa  47  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  25.1 
 
 		 299 aa  46.2  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0510  pyruvate, water dikinase  24.75 
 
 		 334 aa  46.2  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.749276  normal  0.163777 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0847  alpha/beta hydrolase fold protein  27.57 
 
 		 404 aa  45.8  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.135304  normal  0.159023 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2573  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  27.27 
 
 		 835 aa  45.4  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0704  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  32.28 
 
 		 797 aa  45.1  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.138362 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  23.41 
 
 		 309 aa  45.1  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1694  phosphoenolpyruvate synthase  22.58 
 
 		 779 aa  44.7  0.008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.434121 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4720  phosphoenolpyruvate synthase  28.64 
 
 		 785 aa  44.3  0.009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.878278  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>