More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2869 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_3490  putative monooxygenase  69.15 
 
 
467 aa  662    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.286781  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2746  hypothetical protein  82.17 
 
 
469 aa  799    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0157125  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6108  putative monooxygenase  69.37 
 
 
469 aa  663    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3872  putative monooxygenase  69.37 
 
 
467 aa  664    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0559897 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2984  xenobiotic compound monooxygenase, DszA family  97.21 
 
 
466 aa  943    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0528073  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1146  monoxygenase  69.47 
 
 
467 aa  673    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.948118  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7155  nitrilotriacetate monooxygenase  65.88 
 
 
468 aa  657    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2543  putative monooxygenase  67.19 
 
 
462 aa  639    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.779513  normal  0.2652 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2869  xenobiotic compound monooxygenase  100 
 
 
466 aa  966    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.927289  normal  0.14753 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1120  hypothetical protein  82.2 
 
 
461 aa  791    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3798  putative monooxygenase  68.93 
 
 
467 aa  661    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.438268 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6340  flavin-dependent oxidoreductase-like protein  67.31 
 
 
466 aa  653    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6145  DszA family monooxygenase  74.56 
 
 
465 aa  725    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.453092  hitchhiker  0.00590526 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2257  monoxygenase  69.03 
 
 
467 aa  669    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2933  hypothetical protein  83.37 
 
 
469 aa  807    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.820953  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7501  flavin-dependent oxidoreductase-like  66.31 
 
 
466 aa  650    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.180408  normal  0.269687 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1741  monoxygenase  68.58 
 
 
467 aa  661    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.139435  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3007  hypothetical protein  83.26 
 
 
469 aa  806    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.40837  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6560  putative monooxygenase protein, DszA family  74.56 
 
 
465 aa  728    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.176413  normal  0.397515 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6517  flavin-dependent oxidoreductase-like  67.31 
 
 
466 aa  650    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34540  xenobiotic compound DszA family monooxygenase  83.37 
 
 
469 aa  807    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.748973  normal  0.0562583 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0931  monoxygenase  69.47 
 
 
467 aa  673    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.639701  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1520  monoxygenase  69.47 
 
 
467 aa  673    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.148632  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6751  flavin-dependent oxidoreductase-like protein  67.31 
 
 
466 aa  652    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0288588 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43810  monoxygenase, NtaA/DszA family  79.18 
 
 
467 aa  784    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.29629  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1016  monoxygenase  69.25 
 
 
467 aa  672    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0291524  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0093  monoxygenase  69.47 
 
 
467 aa  673    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5154  nitrilotriacetate monooxygenase  64.72 
 
 
467 aa  630  1e-179  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.866117  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0897  putative monooxygenase  64 
 
 
480 aa  598  1e-170  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.125634  normal  0.0455418 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1560  FMNH2-dependent monooxygenase  62.03 
 
 
461 aa  595  1e-169  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.414034  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2052  putative luciferase-like protein, putative alkanesulfonate monooxygenase  61.4 
 
 
463 aa  596  1e-169  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.752934  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0891  putative monooxygenase  63.78 
 
 
480 aa  595  1e-169  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0908  putative monooxygenase  63.78 
 
 
480 aa  595  1e-169  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.89307  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3195  putative luciferase-like protein, putative alkanesulfonate monooxygenase  59.38 
 
 
454 aa  588  1e-167  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3462  monoxygenase  58.7 
 
 
460 aa  563  1.0000000000000001e-159  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0705308  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1591  monoxygenase  60.09 
 
 
483 aa  563  1.0000000000000001e-159  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.452627  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02460  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  59.56 
 
 
473 aa  554  1e-156  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.230038  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2397  monoxygenase  57.14 
 
 
463 aa  541  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.661365 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2244  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  56.25 
 
 
463 aa  532  1e-150  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3529  monooxygenase, putative  56.25 
 
 
454 aa  530  1e-149  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.756628  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2914  hypothetical protein  55.97 
 
 
462 aa  519  1e-146  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.513081  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34290  DszA family monooxygenase  55.65 
 
 
462 aa  520  1e-146  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0671328  normal  0.0164622 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5186  monooxygenase, DszA family  53.42 
 
 
452 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0352  DszA family monooxygenase  53.42 
 
 
452 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.895998  normal  0.798866 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0238  DszA family monooxygenase  54 
 
 
454 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.552909  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31500  Flavin-dependent oxidoreductase  54.82 
 
 
463 aa  517  1.0000000000000001e-145  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.419822  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2085  monoxygenase  56.32 
 
 
464 aa  511  1e-144  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.924859  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2363  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  53.1 
 
 
467 aa  512  1e-144  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.000880106  hitchhiker  0.00124341 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1590  putative luciferase-like protein, putative alkanesulfonate monooxygenase  55.29 
 
 
460 aa  508  1e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0963352 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3028  flavin-dependent oxidoreductase  54.02 
 
 
470 aa  509  1e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0660648  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4930  flavin-dependent oxidoreductase  54.02 
 
 
470 aa  510  1e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.497416  normal  0.995257 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5338  flavin-dependent oxidoreductase  54.02 
 
 
470 aa  509  1e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.287655  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1906  DszA family monooxygenase  53.2 
 
 
457 aa  510  1e-143  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.214665  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0447  hypothetical protein  55.53 
 
 
472 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1543  DszA family monooxygenase  52.86 
 
 
456 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.9269  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1440  monoxygenase  55.31 
 
 
464 aa  503  1e-141  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0857  hypothetical protein  55.31 
 
 
472 aa  503  1e-141  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1866  monoxygenase  55.53 
 
 
464 aa  504  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0384468  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2173  monoxygenase  55.31 
 
 
464 aa  503  1e-141  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.417795  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0545  hypothetical protein  55.31 
 
 
472 aa  504  1e-141  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3392  flavin-dependent oxidoreductase  54.51 
 
 
465 aa  503  1e-141  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.425797  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0310  flavin-dependent oxidoreductase  53.96 
 
 
470 aa  498  1e-140  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4538  flavin-dependent oxidoreductase  54.42 
 
 
468 aa  499  1e-140  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.182426  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4688  flavin-dependent oxidoreductase  53.85 
 
 
472 aa  499  1e-140  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0991712  normal  0.791693 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5152  nitrilotriacetate monooxygenase  51.33 
 
 
454 aa  496  1e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.669149  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1129  hypothetical protein  53.64 
 
 
468 aa  496  1e-139  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0222  DszA family monooxygenase  52.54 
 
 
461 aa  491  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0424148  hitchhiker  0.00698134 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5217  flavin-dependent oxidoreductase  53.44 
 
 
472 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.668453 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4846  hypothetical protein  51.61 
 
 
470 aa  491  1e-137  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.318443 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6097  putative monooxygenase protein  51.88 
 
 
452 aa  488  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.97832  normal  0.472399 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0237  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  52.54 
 
 
461 aa  490  1e-137  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.782934  normal  0.380883 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6510  putative monooxygenase protein  51.44 
 
 
452 aa  487  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0246  monooxygenase  52.54 
 
 
463 aa  487  1e-136  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4990  monooxygenase  52.32 
 
 
464 aa  487  1e-136  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2670  hypothetical protein  53.63 
 
 
457 aa  483  1e-135  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09004  xenobiotic compound monooxygenase, DszA family, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G17580)  51.52 
 
 
482 aa  481  1e-134  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5029  flavin-dependent oxidoreductase  53.06 
 
 
463 aa  481  1e-134  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.177434  normal  0.283856 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4860  putative luciferase-like protein, putative alkanesulfonate monooxygenase  51.68 
 
 
469 aa  479  1e-134  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.06917  normal  0.729737 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1591  hypothetical protein  51.87 
 
 
457 aa  467  9.999999999999999e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.176548 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3997  monooxygenase  52.01 
 
 
459 aa  459  9.999999999999999e-129  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.784522  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4229  putative luciferase-like protein, putative alkanesulfonate monooxygenase  52.77 
 
 
469 aa  457  1e-127  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0605852 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4268  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  47.79 
 
 
462 aa  451  1e-125  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.375018  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2573  putative luciferase-like protein, putative alkanesulfonate monooxygenase  51.66 
 
 
478 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.210511 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2175  hypothetical protein  53.4 
 
 
408 aa  441  1e-123  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02320  xenobiotic compound monooxygenase, DszA family (AFU_orthologue; AFUA_6G01920)  48.25 
 
 
486 aa  431  1e-120  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.678427  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02576  xenobiotic compound monooxygenase, DszA family (AFU_orthologue; AFUA_3G15040)  46.7 
 
 
481 aa  424  1e-117  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.285559 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1776  DszA family monooxygenase  47.12 
 
 
454 aa  424  1e-117  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0096  hypothetical protein  46.93 
 
 
458 aa  408  1e-113  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45532  predicted protein  47.3 
 
 
505 aa  409  1e-113  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.533075 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_36305  predicted protein  47 
 
 
507 aa  406  1.0000000000000001e-112  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.412413  normal  0.117145 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5216  nitrilotriacetate monooxygenase  42.04 
 
 
461 aa  379  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.772157  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43740  monooxygenase, NtaA/SnaA/SoxA/DszA family  42.95 
 
 
452 aa  370  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.514983  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1792  monooxygenase  44.77 
 
 
460 aa  369  1e-101  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.318899 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2534  putative flavin-dependent oxidoreductase  43.88 
 
 
458 aa  355  1e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.688829  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0250  hypothetical protein  41.84 
 
 
442 aa  352  5.9999999999999994e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2169  putative monooxygenase  40.89 
 
 
493 aa  347  3e-94  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2800  hypothetical protein  40.49 
 
 
457 aa  345  7e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3646  putative monooxygenase, DszA family  42.58 
 
 
460 aa  344  2e-93  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1259  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  41.5 
 
 
460 aa  343  5e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.860986  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6573  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductases-like protein  41.5 
 
 
460 aa  343  5e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.265801  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>