46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_0099 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_0099  hypothetical protein  100 
 
 		 69 aa  140  7e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0504  hypothetical protein  52.17 
 
 		 70 aa  82  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1673  hypothetical protein  57.97 
 
 		 70 aa  81.6  0.000000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0224958  normal  0.264874 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4371  hypothetical protein  49.28 
 
 		 71 aa  77.4  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000300106  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0310  protein of unknown function DUF87  53.62 
 
 		 679 aa  74.3  0.0000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.724586  normal  0.179177 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2783  hypothetical protein  49.28 
 
 		 70 aa  73.6  0.0000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0650  ATPase protein  51.52 
 
 		 709 aa  69.7  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2369  hypothetical protein  43.48 
 
 		 69 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00667036  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2492  hypothetical protein  40.58 
 
 		 70 aa  61.2  0.000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2344  hypothetical protein  40.58 
 
 		 68 aa  60.8  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.425435  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1648  hypothetical protein  40 
 
 		 102 aa  60.8  0.000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2152  hypothetical protein  42.03 
 
 		 69 aa  60.8  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23663  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3014  hypothetical protein  39.13 
 
 		 69 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.583833 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2311  hypothetical protein  39.13 
 
 		 69 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1711  hypothetical protein  39.13 
 
 		 70 aa  59.3  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000512885  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1819  hypothetical protein  39.13 
 
 		 70 aa  59.3  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.329591  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1714  hypothetical protein  34.78 
 
 		 74 aa  56.2  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.594159 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2313  hypothetical protein  36.23 
 
 		 70 aa  55.1  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.153075  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2976  hypothetical protein  45 
 
 		 67 aa  53.9  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2413  hypothetical protein  34.78 
 
 		 70 aa  53.5  0.0000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.26259  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0883  lysyl-tRNA synthetase  40.98 
 
 		 573 aa  52.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1297  hypothetical protein  40.62 
 
 		 73 aa  53.1  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0856  lysyl-tRNA synthetase  40.98 
 
 		 573 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4475  hypothetical protein  42.86 
 
 		 70 aa  50.8  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.202643 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3122  chaperone with DnaK; heat shock protein  36.67 
 
 		 164 aa  50.8  0.000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.268695 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2620  hypothetical protein  43.75 
 
 		 72 aa  50.4  0.000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.635901  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1846  hypothetical protein  43.75 
 
 		 72 aa  50.1  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6775  ATPase protein; K06915  38.71 
 
 		 65 aa  50.1  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2998  imidazoleglycerol-phosphate synthase  37.7 
 
 		 67 aa  49.7  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3238  hypothetical protein  39.34 
 
 		 80 aa  48.9  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2989  hypothetical protein  39.34 
 
 		 83 aa  48.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.717037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0708  hypothetical protein  37.7 
 
 		 69 aa  48.1  0.00004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0352444  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3150  lysyl-tRNA synthetase  36.07 
 
 		 561 aa  47.4  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000153086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2660  hypothetical protein  34.38 
 
 		 67 aa  47.4  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.228035  normal  0.241718 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0345  lysyl-tRNA synthetase  34.43 
 
 		 573 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1935  hypothetical protein  36.23 
 
 		 70 aa  47.4  0.00007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.432758  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1664  hypothetical protein  36.23 
 
 		 70 aa  47  0.00008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0239529  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5498  hypothetical protein  39.34 
 
 		 109 aa  45.8  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.194337  normal  0.967305 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2376  hypothetical protein  36.51 
 
 		 93 aa  45.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000039933  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2137  hypothetical protein  34.38 
 
 		 69 aa  44.7  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2491  hypothetical protein  40.35 
 
 		 79 aa  44.7  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2343  hypothetical protein  31.51 
 
 		 92 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0539871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1348  heat shock protein DnaJ domain protein  34.43 
 
 		 148 aa  43.5  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4946  hypothetical protein  35.38 
 
 		 68 aa  43.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.5658 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4342  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  32.61 
 
 		 146 aa  42.4  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.189562  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0329  lysyl-tRNA synthetase  29.63 
 
 		 58 aa  40.4  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00705575 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>