31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1714 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_1714  hypothetical protein  100 
 
 
74 aa  150  7e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.594159 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1648  hypothetical protein  60.56 
 
 
102 aa  98.2  4e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2783  hypothetical protein  42.03 
 
 
70 aa  64.3  0.0000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2976  hypothetical protein  36.36 
 
 
67 aa  63.5  0.0000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1673  hypothetical protein  40 
 
 
70 aa  63.5  0.0000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0224958  normal  0.264874 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2492  hypothetical protein  36.23 
 
 
70 aa  60.8  0.000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4371  hypothetical protein  40.58 
 
 
71 aa  58.9  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000300106  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0504  hypothetical protein  37.68 
 
 
70 aa  58.2  0.00000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4946  hypothetical protein  37.88 
 
 
68 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.5658 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0310  protein of unknown function DUF87  42.03 
 
 
679 aa  57.4  0.00000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.724586  normal  0.179177 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0099  hypothetical protein  34.78 
 
 
69 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1711  hypothetical protein  35.71 
 
 
70 aa  55.5  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000512885  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1819  hypothetical protein  35.71 
 
 
70 aa  55.5  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.329591  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2620  hypothetical protein  38.03 
 
 
72 aa  55.1  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.635901  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0883  lysyl-tRNA synthetase  34.43 
 
 
573 aa  51.6  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158887  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2413  hypothetical protein  37.68 
 
 
70 aa  52  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.26259  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1664  hypothetical protein  36.76 
 
 
70 aa  51.2  0.000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0239529  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0856  lysyl-tRNA synthetase  34.43 
 
 
573 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2998  imidazoleglycerol-phosphate synthase  32.79 
 
 
67 aa  51.2  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2313  hypothetical protein  36.23 
 
 
70 aa  50.8  0.000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.153075  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1935  hypothetical protein  35.29 
 
 
70 aa  50.4  0.000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.432758  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0345  lysyl-tRNA synthetase  34.43 
 
 
573 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1846  hypothetical protein  30.99 
 
 
72 aa  47.4  0.00006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2626  hypothetical protein  37.5 
 
 
49 aa  43.1  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000563687  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2660  hypothetical protein  29.03 
 
 
67 aa  43.1  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.228035  normal  0.241718 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2137  hypothetical protein  32.31 
 
 
69 aa  42.7  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4454  hypothetical protein  33.85 
 
 
69 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.881493 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1297  hypothetical protein  32.35 
 
 
73 aa  41.6  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2491  hypothetical protein  31.25 
 
 
79 aa  41.6  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6775  ATPase protein; K06915  25.81 
 
 
65 aa  41.2  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3150  lysyl-tRNA synthetase  24.24 
 
 
561 aa  40  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000153086  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>