30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2660 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2660  hypothetical protein  100 
 
 		 67 aa  137  6e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.228035  normal  0.241718 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6775  ATPase protein; K06915  51.56 
 
 		 65 aa  74.3  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0345  lysyl-tRNA synthetase  40.98 
 
 		 573 aa  60.5  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0329  lysyl-tRNA synthetase  46.3 
 
 		 58 aa  57.4  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00705575 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0883  lysyl-tRNA synthetase  37.7 
 
 		 573 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0856  lysyl-tRNA synthetase  37.7 
 
 		 573 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2492  hypothetical protein  40 
 
 		 70 aa  53.9  0.0000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2413  hypothetical protein  35.38 
 
 		 70 aa  53.5  0.0000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.26259  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3150  lysyl-tRNA synthetase  44.26 
 
 		 561 aa  53.5  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000153086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4371  hypothetical protein  42.19 
 
 		 71 aa  53.1  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000300106  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0504  hypothetical protein  41.27 
 
 		 70 aa  53.1  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2998  imidazoleglycerol-phosphate synthase  43.1 
 
 		 67 aa  51.2  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1711  hypothetical protein  43.55 
 
 		 70 aa  50.1  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000512885  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1819  hypothetical protein  43.55 
 
 		 70 aa  50.1  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.329591  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0650  ATPase protein  35.48 
 
 		 709 aa  49.3  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0099  hypothetical protein  34.38 
 
 		 69 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0203  hypothetical protein  35.48 
 
 		 66 aa  47  0.00008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.699788 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2313  hypothetical protein  30.77 
 
 		 70 aa  44.3  0.0005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.153075  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2976  hypothetical protein  32.26 
 
 		 67 aa  44.3  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2491  hypothetical protein  34.43 
 
 		 79 aa  44.7  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2620  hypothetical protein  38.81 
 
 		 72 aa  44.3  0.0006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.635901  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1714  hypothetical protein  29.03 
 
 		 74 aa  43.1  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.594159 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2137  hypothetical protein  35.48 
 
 		 69 aa  43.1  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5498  hypothetical protein  35.38 
 
 		 109 aa  43.5  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.194337  normal  0.967305 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1846  hypothetical protein  37.31 
 
 		 72 aa  43.1  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4946  hypothetical protein  36.84 
 
 		 68 aa  43.5  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.5658 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2989  hypothetical protein  35.09 
 
 		 83 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.717037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0310  protein of unknown function DUF87  33.33 
 
 		 679 aa  41.6  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.724586  normal  0.179177 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4475  hypothetical protein  30.77 
 
 		 70 aa  40.4  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.202643 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3238  hypothetical protein  33.33 
 
 		 80 aa  40.4  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>