27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1297 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1297  hypothetical protein  100 
 
 
73 aa  150  7e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1673  hypothetical protein  43.75 
 
 
70 aa  57.8  0.00000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0224958  normal  0.264874 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2976  hypothetical protein  38.46 
 
 
67 aa  56.2  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2313  hypothetical protein  42.86 
 
 
70 aa  53.1  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.153075  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0099  hypothetical protein  40.62 
 
 
69 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0203  hypothetical protein  39.06 
 
 
66 aa  51.6  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.699788 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0504  hypothetical protein  37.5 
 
 
70 aa  50.8  0.000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4946  hypothetical protein  39.39 
 
 
68 aa  50.8  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.5658 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1711  hypothetical protein  40.74 
 
 
70 aa  50.1  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000512885  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1819  hypothetical protein  40.74 
 
 
70 aa  50.1  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.329591  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2413  hypothetical protein  38.1 
 
 
70 aa  49.3  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.26259  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0310  protein of unknown function DUF87  38.71 
 
 
679 aa  48.1  0.00004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.724586  normal  0.179177 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1664  hypothetical protein  38.1 
 
 
70 aa  47.8  0.00005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0239529  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1935  hypothetical protein  38.1 
 
 
70 aa  47.8  0.00005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.432758  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4371  hypothetical protein  39.06 
 
 
71 aa  46.6  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000300106  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2343  hypothetical protein  32 
 
 
92 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0539871  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6775  ATPase protein; K06915  35.48 
 
 
65 aa  46.2  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2783  hypothetical protein  36.92 
 
 
70 aa  45.1  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2492  hypothetical protein  35.94 
 
 
70 aa  43.5  0.0009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0883  lysyl-tRNA synthetase  29.51 
 
 
573 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158887  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0856  lysyl-tRNA synthetase  29.51 
 
 
573 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2376  hypothetical protein  35.71 
 
 
93 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000039933  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0345  lysyl-tRNA synthetase  29.51 
 
 
573 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1714  hypothetical protein  32.35 
 
 
74 aa  41.6  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.594159 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1648  hypothetical protein  36.92 
 
 
114 aa  41.2  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0650  ATPase protein  31.25 
 
 
709 aa  40.4  0.009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1648  hypothetical protein  29.31 
 
 
102 aa  40  0.01  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>