45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0504 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_0504  hypothetical protein  100 
 
 
70 aa  146  9e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0099  hypothetical protein  52.17 
 
 
69 aa  82  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2492  hypothetical protein  54.29 
 
 
70 aa  82  0.000000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4371  hypothetical protein  52.17 
 
 
71 aa  80.9  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000300106  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1673  hypothetical protein  50.72 
 
 
70 aa  79.3  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0224958  normal  0.264874 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2783  hypothetical protein  48.57 
 
 
70 aa  75.5  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1819  hypothetical protein  49.28 
 
 
70 aa  73.9  0.0000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.329591  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1711  hypothetical protein  49.28 
 
 
70 aa  73.9  0.0000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000512885  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2620  hypothetical protein  48.61 
 
 
72 aa  69.3  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.635901  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1846  hypothetical protein  45.83 
 
 
72 aa  64.7  0.0000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0310  protein of unknown function DUF87  46.88 
 
 
679 aa  65.1  0.0000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.724586  normal  0.179177 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1648  hypothetical protein  45.31 
 
 
102 aa  63.9  0.0000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0883  lysyl-tRNA synthetase  40.98 
 
 
573 aa  60.5  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158887  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0856  lysyl-tRNA synthetase  40.98 
 
 
573 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0345  lysyl-tRNA synthetase  39.34 
 
 
573 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2413  hypothetical protein  35.71 
 
 
70 aa  59.3  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.26259  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3150  lysyl-tRNA synthetase  48.15 
 
 
561 aa  58.2  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000153086  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1714  hypothetical protein  37.68 
 
 
74 aa  58.2  0.00000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.594159 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2976  hypothetical protein  43.33 
 
 
67 aa  57.4  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0650  ATPase protein  40 
 
 
709 aa  57.4  0.00000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4946  hypothetical protein  43.75 
 
 
68 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.5658 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6775  ATPase protein; K06915  45.16 
 
 
65 aa  57  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4475  hypothetical protein  41.43 
 
 
70 aa  56.2  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.202643 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2313  hypothetical protein  32.86 
 
 
70 aa  55.5  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.153075  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3014  hypothetical protein  37.68 
 
 
69 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.583833 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2311  hypothetical protein  37.68 
 
 
69 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2369  hypothetical protein  36.23 
 
 
69 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00667036  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0203  hypothetical protein  42.19 
 
 
66 aa  54.3  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.699788 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2152  hypothetical protein  36.23 
 
 
69 aa  53.9  0.0000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23663  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2660  hypothetical protein  41.27 
 
 
67 aa  53.1  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.228035  normal  0.241718 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2491  hypothetical protein  40.35 
 
 
79 aa  52  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2344  hypothetical protein  34.78 
 
 
68 aa  52  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.425435  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1664  hypothetical protein  34.29 
 
 
70 aa  51.2  0.000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0239529  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1297  hypothetical protein  37.5 
 
 
73 aa  50.8  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1935  hypothetical protein  32.86 
 
 
70 aa  50.1  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.432758  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2137  hypothetical protein  36.92 
 
 
69 aa  48.1  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0329  lysyl-tRNA synthetase  38.89 
 
 
58 aa  47  0.00009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00705575 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2998  imidazoleglycerol-phosphate synthase  35 
 
 
67 aa  43.9  0.0007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2626  hypothetical protein  40.43 
 
 
49 aa  43.1  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000563687  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3238  hypothetical protein  36.07 
 
 
80 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2989  hypothetical protein  36.07 
 
 
83 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.717037  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3122  chaperone with DnaK; heat shock protein  35.19 
 
 
164 aa  42  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.268695 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5498  hypothetical protein  36.21 
 
 
109 aa  41.6  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.194337  normal  0.967305 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0708  hypothetical protein  36.51 
 
 
69 aa  40.4  0.008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0352444  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1648  hypothetical protein  31.88 
 
 
114 aa  40.4  0.008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>