26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_2491 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_2491  hypothetical protein  100 
 
 
79 aa  161  3e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2492  hypothetical protein  44.26 
 
 
70 aa  56.2  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0504  hypothetical protein  40.35 
 
 
70 aa  52  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4946  hypothetical protein  36.21 
 
 
68 aa  50.8  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.5658 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1711  hypothetical protein  33.82 
 
 
70 aa  46.2  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000512885  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1819  hypothetical protein  33.82 
 
 
70 aa  46.2  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.329591  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4371  hypothetical protein  38.6 
 
 
71 aa  45.4  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000300106  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0203  hypothetical protein  37.93 
 
 
66 aa  45.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.699788 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0099  hypothetical protein  40.35 
 
 
69 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2660  hypothetical protein  34.43 
 
 
67 aa  44.7  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.228035  normal  0.241718 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2998  imidazoleglycerol-phosphate synthase  40.35 
 
 
67 aa  44.3  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4475  hypothetical protein  39.58 
 
 
70 aa  43.9  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.202643 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1648  hypothetical protein  36.21 
 
 
102 aa  43.5  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2620  hypothetical protein  35.14 
 
 
72 aa  42.4  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.635901  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1846  hypothetical protein  35.06 
 
 
72 aa  42.4  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1935  hypothetical protein  36.07 
 
 
70 aa  42.7  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.432758  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0856  lysyl-tRNA synthetase  37.93 
 
 
573 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1664  hypothetical protein  34.43 
 
 
70 aa  41.6  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0239529  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1714  hypothetical protein  31.25 
 
 
74 aa  41.6  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.594159 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0345  lysyl-tRNA synthetase  32.76 
 
 
573 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6775  ATPase protein; K06915  34.43 
 
 
65 aa  41.6  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3014  hypothetical protein  30.43 
 
 
69 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.583833 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2976  hypothetical protein  35.09 
 
 
67 aa  40.4  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0883  lysyl-tRNA synthetase  36.21 
 
 
573 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158887  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2783  hypothetical protein  31.15 
 
 
70 aa  40  0.009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2369  hypothetical protein  31.88 
 
 
69 aa  40  0.01  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00667036  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>