27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0203 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_0203  hypothetical protein  100 
 
 
66 aa  136  8.999999999999999e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.699788 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2492  hypothetical protein  53.12 
 
 
70 aa  63.5  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0345  lysyl-tRNA synthetase  36.92 
 
 
573 aa  57.4  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0856  lysyl-tRNA synthetase  38.46 
 
 
573 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0504  hypothetical protein  42.19 
 
 
70 aa  54.3  0.0000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0883  lysyl-tRNA synthetase  36.92 
 
 
573 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158887  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4946  hypothetical protein  36.07 
 
 
68 aa  52.4  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.5658 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1297  hypothetical protein  39.06 
 
 
73 aa  51.6  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1846  hypothetical protein  41.79 
 
 
72 aa  50.4  0.000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0650  ATPase protein  38.71 
 
 
709 aa  47.8  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1711  hypothetical protein  35.94 
 
 
70 aa  47.8  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000512885  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1819  hypothetical protein  35.94 
 
 
70 aa  47.8  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.329591  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1673  hypothetical protein  35.94 
 
 
70 aa  47.8  0.00006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0224958  normal  0.264874 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2660  hypothetical protein  35.48 
 
 
67 aa  47  0.00008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.228035  normal  0.241718 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2620  hypothetical protein  35.82 
 
 
72 aa  47  0.00008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.635901  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2491  hypothetical protein  37.93 
 
 
79 aa  45.8  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2413  hypothetical protein  30.77 
 
 
70 aa  46.2  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.26259  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3150  lysyl-tRNA synthetase  30.3 
 
 
561 aa  43.9  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000153086  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4454  hypothetical protein  32.79 
 
 
69 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.881493 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4475  hypothetical protein  38.46 
 
 
70 aa  42.7  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.202643 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1935  hypothetical protein  29.23 
 
 
70 aa  42.4  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.432758  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1664  hypothetical protein  29.23 
 
 
70 aa  42  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0239529  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0708  hypothetical protein  37.5 
 
 
69 aa  41.6  0.004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0352444  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2998  imidazoleglycerol-phosphate synthase  35.59 
 
 
67 aa  41.6  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2313  hypothetical protein  27.69 
 
 
70 aa  41.2  0.005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.153075  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4140  hypothetical protein  31.15 
 
 
69 aa  40.8  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.239447  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6775  ATPase protein; K06915  32.26 
 
 
65 aa  40  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>