31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_1935 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_1935  hypothetical protein  100 
 
 
70 aa  140  8e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.432758  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1664  hypothetical protein  97.14 
 
 
70 aa  138  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0239529  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2313  hypothetical protein  75.71 
 
 
70 aa  110  8.000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.153075  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2413  hypothetical protein  72.86 
 
 
70 aa  107  6e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.26259  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2492  hypothetical protein  44.29 
 
 
70 aa  66.2  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1673  hypothetical protein  43.48 
 
 
70 aa  60.5  0.000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0224958  normal  0.264874 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0310  protein of unknown function DUF87  39.71 
 
 
679 aa  56.2  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.724586  normal  0.179177 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2620  hypothetical protein  40.91 
 
 
72 aa  54.7  0.0000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.635901  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4371  hypothetical protein  39.71 
 
 
71 aa  53.1  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000300106  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1714  hypothetical protein  35.29 
 
 
74 aa  50.4  0.000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.594159 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2783  hypothetical protein  35.71 
 
 
70 aa  50.1  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0504  hypothetical protein  32.86 
 
 
70 aa  50.1  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1819  hypothetical protein  32.81 
 
 
70 aa  48.9  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.329591  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1846  hypothetical protein  37.5 
 
 
72 aa  49.3  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1711  hypothetical protein  32.81 
 
 
70 aa  48.9  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000512885  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1297  hypothetical protein  38.1 
 
 
73 aa  47.8  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0099  hypothetical protein  36.23 
 
 
69 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1648  hypothetical protein  34.38 
 
 
102 aa  45.8  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0345  lysyl-tRNA synthetase  32.79 
 
 
573 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0856  lysyl-tRNA synthetase  35.71 
 
 
573 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0883  lysyl-tRNA synthetase  35.71 
 
 
573 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158887  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0203  hypothetical protein  29.23 
 
 
66 aa  42.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.699788 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2491  hypothetical protein  36.07 
 
 
79 aa  42.7  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0708  hypothetical protein  32.35 
 
 
69 aa  42  0.003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0352444  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2976  hypothetical protein  33.33 
 
 
67 aa  42  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2369  hypothetical protein  36.76 
 
 
69 aa  42  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00667036  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2311  hypothetical protein  36.76 
 
 
69 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3014  hypothetical protein  36.76 
 
 
69 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.583833 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2152  hypothetical protein  38.24 
 
 
69 aa  41.6  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23663  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2344  hypothetical protein  35.29 
 
 
68 aa  40.8  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.425435  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4946  hypothetical protein  29.69 
 
 
68 aa  40.4  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.5658 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>